Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478836
• Subject: XM_017315205.1
• Aligned Length: 1467
• Identities: 1261
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGGTCCAGTCATGCCTCCCAGTAAGAAGCCAGAAAGCTCAGGAATTAGTGTCTCCAGTGGACTGAGTCAGTG  74
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGGGTCCAGTCATGCCTGCCAGTAAGAAGGCCGAGAGCTCAGGAATCAGTGTGTCCAGTGGACTGAGTCAGCG  74

Query   75  TTACGGGGGCAGCGGTTTCTCCAAGGCCCTTCAGGAAGACGATGACCTCGACTTTTCTCTGCCTGACATCCGAT  148
            ||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||..|||||||.||||||||||
Sbjct   75  TTACCGGGGCAGCGGTTTCTCCAAGGCCCTCCAGGAAGACGATGATCTTGACTTCCCTCTGCCCGACATCCGAT  148

Query  149  TAGAAGAGGGGGCCATGGAAGATGAAGAGCTGACCAACCTGAACTGGCTGCACGAGAGCAAGAACTTGCTGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGAAGAGGGGGCCATGGAAGATGAAGAGCTGACCAACCTGAACTGGCTGCATGAGAGCAAGAACTTGCTGAAG  222

Query  223  AGCTTTGGGGAGTCGGTCCTCAGGAGTGTCAGCCCCGTCCAGGACCTGGACGATGACACCCCCCCATCCCCTGC  296
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  AGCTTTGGGGAGTCGGTCCTTAGGAGTGTCAGTCCTGTGCAGGACCTAGACGATGACACCCCACCATCCCCTGC  296

Query  297  CCACTCTGACATGCCCTACGATGCCAGGCAGAACCCCAACTGCAAACCCCCCTACTCCTTCAGCTGCCTCATAT  370
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CCACTCGGACATGCCCTATGATGCCAGGCAGAACCCCAACTGCAAGCCCCCCTACTCCTTTAGCTGCCTCATAT  370

Query  371  TTATGGCCATCGAGGACTCTCCAACCAAGCGCCTGCCAGTGAAGGATATCTACAACTGGATCTTGGAACATTTT  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  TTATGGCCATCGAGGACTCTCCGACCAAGCGCCTTCCAGTGAAGGACATCTACAACTGGATCTTAGAACATTTC  444

Query  445  CCGTATTTTGCAAATGCACCTACTGGGTGGAAAAACTCAGTGAGACACAATTTATCATTGAATAAGTGTTTTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  445  CCGTATTTTGCAAATGCACCTACTGGGTGGAAGAACTCAGTGAGACACAACTTGTCATTGAATAAGTGTTTCAA  518

Query  519  GAAAGTGGACAAAGAGAGGAGTCAGAGTATTGGGAAAGGGTCGTTGTGGTGCATAGACCCAGAGTATAGACAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAGTGGACAAAGAGAGGAGTCAGAGTATTGGGAAAGGGTCATTGTGGTGCATCGACCCAGAGTATAGACAAA  592

Query  593  ATCTAATTCAGGCTTTGAAAAAGACACCTTATCACCCACACCCACACGTGTTCAATACACCTCCCACCTGTCCT  666
            ||||||||||||||.||||||||||||||||.||||                     |||||||.||   ||||
Sbjct  593  ATCTAATTCAGGCTCTGAAAAAGACACCTTACCACC---------------------CACCTCCTAC---TCCT  642

Query  667  CAGGCATATCAAAGCACATCAGGTCCACCCATCTGGCCGGGCAGTACCTTCTTCAAGAGAAATGGAGCCCTTCT  740
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  643  CAGGCTTATCAAAGCACATCAGGTCCACCCATCTGGCCGGGCAGTACCTTCTTCAAGAGAAACGGAGCCCTCCT  716

Query  741  CCA---------------------------------------------------------------AGTTCCTC  751
            .||                                                               ||||.|||
Sbjct  717  GCAAGATCCTGACATTGATGCTGCCAGTGCCATGATGCTTTTGAATTCTCCCCCTGAGATACAAGCAGTTTCTC  790

Query  752  CAGGAGTGATCCAAAATGGAGCGCGGGTCCTGAGCCGAGGGCTGTTTCCTGGCGTGCGGCCGCTGCCAATCACT  825
            ||||||||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||.|.|||||||||
Sbjct  791  CAGGAGTGATACAAAATGGAGCGAGGGTTCTGAGTCGAGGGCTGTTTCCTGGTGTCCGGCCGTTACCAATCACT  864

Query  826  CCCATTGGGGTGACAGCGGCCATGAGGAATGGCATCACCAGCTGCCGGATGCGGACTGAGAGTGAGCCATCTTG  899
            |||||||||.||||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||..|.||
Sbjct  865  CCCATTGGGATGACGGCAGCCATAAGGAATAGCATCACCAGTTGCAGGATGCGGACTGAGAGCGAGCCCCCATG  938

Query  900  TGGCTCCCCAGTGGTCAGCGGAGACCCCAAGGAGGATCACAACTACAGCAGTGCCAAGTCCTCCAACGCCCGGA  973
            ||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||..|||||||
Sbjct  939  TGGCTCCCCAGTGGTCAGTGGCGATCCGAAGGAGGACCACAACTACAGTAGTGCCAAGTCCTCCACTGCCCGGA  1012

Query  974  GCACCTCGCCCACCAGCGACTCCATCTCCTCCTCCTCCTCCTCAGCCGACGACCACTATGAGTTTGCCACCAAG  1047
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1013  GCACCTCTCCCACCAGCGACTCCATCTCCTCTTCCTCCTCCTCAGCCGACGACCACTATGAGTTTGCTACGAAG  1086

Query 1048  GGGAGCCAGGAGGGCAGCGAGGGCAGCGAGGGGAGCTTCCGGAGCCACGAGAGCCCCAGCGACACGGAAGAGGA  1121
            |||||||||         ||||||||.|||||.|||||||.||||||.|||||||.|||.||..|.||.|||||
Sbjct 1087  GGGAGCCAG---------GAGGGCAGTGAGGGAAGCTTCCAGAGCCATGAGAGCCACAGTGAACCAGAGGAGGA  1151

Query 1122  CGACAGGAAGCACAGCCAGAAGGAGCCCAAGGATTCTCTGGGGGACAGCGGGTACGCATCCCAGCACAAGAAGC  1195
            .|||.||||.|.|||||.||||||...|||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  GGACCGGAAACCCAGCCCGAAGGAAGGCAAGGATGCCCTGGGGGACAGCGGATACGCATCCCAGCACAAGAAGC  1225

Query 1196  GCCAGCACTTCGCCAAGGCCAGGAAGGTCCCCAGCGACACACTGCCCCTCAAAAAGAGACGCACCGAAAAGCCC  1269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1226  GCCAGCACTTCGCCAAGGCCAGGAAGGTCCCCAGCGACACACTGCCCCTCAAAAAGAGACGCACGGAGAAGCCG  1299

Query 1270  CCCGAGAGCGATGATGAGGAGATGAAAGAAGCGGCAGGGTCCCTCCTGCACTTAGCAGGGATCCGGTCCTGTTT  1343
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1300  CCCGAGAGCGATGACGAGGAGATGAAGGAGGCGGCCGGTTCACTCCTGCACTTAGCAGGGATTCGGTCCTGTTT  1373

Query 1344  GAATAACATCACCAATCGGACGGCAAAGGGGCAGAAAGAGCAAAAGGAAACCACAAAAAAT  1404
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 1374  GAACAACATCACCAATCGGACGGCCAAGGGGCAGAAAGAACAAAAGGAAACCGCAAAAAAT  1434