Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478856
• Subject: NM_001136084.2
• Aligned Length: 1342
• Identities: 1145
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  ATGATTGAAGACAATAAG---------GAGAACAAAGACCATTCCTTAGAAAGGGGAAGAGCAAGTCTCATTTT  65
            ||||||||||||||.|||         |||||||||||||||||||..|||||.||.||||..|.||||||.||
Sbjct    1  ATGATTGAAGACAACAAGGAGAACAAAGAGAACAAAGACCATTCCTCCGAAAGAGGGAGAGTGACTCTCATCTT  74

Query   66  TTCCTTAAAGAATGAAGTTGGAGGACTTATAAAAGCCCTGAAAATCTTTCAGGAGAAGCATGTGAATCTGTTAC  139
            .|||||..||||||||||.||||||||.|||||||..|||||||||||.||||||||.|||||||..|||||||
Sbjct   75  CTCCTTGGAGAATGAAGTCGGAGGACTCATAAAAGTGCTGAAAATCTTCCAGGAGAATCATGTGAGCCTGTTAC  148

Query  140  ATATCGAGTCCCGAAAATCAAAAAGAAGAAACTCAGAATTTGAGATTTTTGTTGACTGTGACATCAACAGAGAA  213
            |.|||||||||||.||||||||...||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|||||
Sbjct  149  ACATCGAGTCCCGGAAATCAAAGCAAAGAAATTCAGAATTTGAGATATTTGTTGACTGCGACATCAGCCGAGAA  222

Query  214  CAATTGAATGATATTTTTCATCTGCTGAAGTCTCATACCAATGTTCTCTCTGTGAATCT-ACCAGATAATTTTA  286
            ||.||||||||.||.||.|..|||||||||||.||..|||..||.|||||.|||.| || .||.|||.|..|.|
Sbjct  223  CAGTTGAATGACATCTTCCCCCTGCTGAAGTCGCACGCCACCGTCCTCTCGGTGGA-CTCGCCCGATCAGCTCA  295

Query  287  CTTTGAAGGAAGATGGTATGGAAACTGTTCCTTGGTTTCCAAAGAAGATTTCTGACCTGGACCATTGTGCCAAC  360
            ||..|||||||||.|.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||...||.||||||
Sbjct  296  CTGCGAAGGAAGACGTTATGGAGACTGTCCCTTGGTTTCCAAAGAAGATTTCTGACCTGGACTTCTGCGCCAAC  369

Query  361  AGAGTTCTGATGTATGGATCTGAACTAGATGCAGACCATCCTGGCTTCAAAGACAATGTCTACCGTAAACGTCG  434
            |||||.|||.||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|.|.||
Sbjct  370  AGAGTGCTGTTGTATGGATCCGAACTTGACGCCGACCACCCTGGCTTCAAAGACAATGTCTATCGTAGAAGACG  443

Query  435  AAAGTATTTTGCGGACTTGGCTATGAACTATAAACATGGAGACCCCATTCCAAAGGTTGAATTCACTGAAGAGG  508
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||||.|
Sbjct  444  AAAGTATTTTGCAGAGTTGGCTATGAACTACAAACATGGGGACCCCATTCCCAAGATTGAATTCACGGAAGAAG  517

Query  509  AGATTAAGACCTGGGGAACCGTATTCCAAGAGCTCAACAAACTCTACCCAACCCATGCTTGCAGAGAGTATCTC  582
            ||||||||||||||||.|||.|.||||.||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct  518  AGATTAAGACCTGGGGGACCATCTTCCGAGAGCTAAACAAACTCTACCCGACCCACGCCTGCAGGGAGTACCTC  591

Query  583  AAAAACTTACCTTTGCTTTCTAAATATTGTGGATATCGGGAGGATAATATCCCACAATTGGAAGATGTCTCCAA  656
            |.||||.|.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||.||||.|||||||||||
Sbjct  592  AGAAACCTCCCTTTGCTCTCAAAATACTGTGGCTATCGGGAAGACAACATCCCGCAACTGGAGGATGTCTCCAA  665

Query  657  CTTTTTAAAAGAGCGTACAGGTTTTTCCATCCGTCCTGTGGCTGGTTACTTATCACCAAGAGATTTCTTATCAG  730
            ||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||..|.||.|
Sbjct  666  CTTTTTAAAAGAACGCACTGGGTTTTCCATCCGTCCTGTGGCTGGTTACCTCTCACCGAGAGATTTTCTGTCGG  739

Query  731  GTTTAGCCTTTCGAGTTTTTCACTGCACTCAATATGTGAGACACAGTTCAGATCCCTTCTATACCCCAGAGCCA  804
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||
Sbjct  740  GGTTAGCCTTTCGAGTCTTTCACTGCACTCAGTATGTGAGACACAGTTCAGATCCCCTCTACACTCCAGAGCCA  813

Query  805  GATACCTGCCATGAACTCTTAGGTCATGTCCCGCTTTTGGCTGAACCTAGTTTTGCCCAATTCTCCCAAGAAAT  878
            ||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  814  GACACCTGCCATGAACTCCTAGGCCACGTTCCTCTCTTGGCTGAACCCAGTTTTGCTCAATTCTCCCAAGAAAT  887

Query  879  TGGCTTGGCTTCTCTTGGCGCTTCAGAGGAGGCTGTTCAAAAACTGGCAACGTGCTACTTTTTCACTGTGGAGT  952
            ||||.|||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TGGCCTGGCTTCCCTTGGAGCTTCAGAGGAGACAGTTCAAAAACTGGCAACGTGCTACTTTTTCACTGTGGAGT  961

Query  953  TTGGTCTATGTAAACAAGATGGACAGCTAAGAGTCTTTGGTGCTGGCTTACTTTCTTCTATCAGTGAACTCAAA  1026
            ||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  962  TTGGGCTGTGCAAACAAGATGGACAGCTGAGAGTCTTTGGGGCCGGCTTGCTTTCTTCCATCAGTGAACTCAAA  1035

Query 1027  CATGCACTTTCTGGACATGCCAAAGTAAAGCCCTTTGATCCCAAGATTACCTGCAAACAGGAATGTCTTATCAC  1100
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1036  CATGCACTTTCTGGACATGCCAAAGTCAAGCCCTTTGATCCCAAGATTGCCTGTAAACAGGAATGTCTCATCAC  1109

Query 1101  AACTTTTCAAGATGTCTACTTTGTATCTGAAAGTTTTGAAGATGCAAAGGAGAAGATGAGAGAATTTACCAAAA  1174
            .|..||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1110  GAGCTTCCAGGATGTCTACTTTGTATCTGAGAGCTTTGAAGATGCAAAGGAGAAGATGAGAGAATTTGCCAAGA  1183

Query 1175  CAATTAAGCGTCCATTTGGAGTGAAGTATAATCCATATACACGGAGTATTCAGATCCTGAAAGACACCAAGAGC  1248
            |..|.|||||.||.||||||.|||||||.||.||.||.||||.||||.|||||.|.||.|.|||||||||||||
Sbjct 1184  CCGTGAAGCGCCCGTTTGGACTGAAGTACAACCCGTACACACAGAGTGTTCAGGTTCTCAGAGACACCAAGAGC  1257

Query 1249  ATAACCAGTGCCATGAATGAGCTGCAGCATGATCTCGATGTTGTCAGTGATGCCCTTGCTAAGGTCAGCAGGAA  1322
            |||||.|||||||||||||||.|||.|.||||.||.|||||..|||||||||||||.||||.|||||.||||..
Sbjct 1258  ATAACTAGTGCCATGAATGAGTTGCGGTATGACCTTGATGTCATCAGTGATGCCCTCGCTAGGGTCACCAGGTG  1331

Query 1323  GCCGAGTATC  1332
            |||.|||.|.
Sbjct 1332  GCCCAGTGTG  1341