Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478879
• Subject: NM_001252567.1
• Aligned Length: 2646
• Identities: 2081
• Gaps: 276

Alignment

Query    1  ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT  74
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGGGGACTCCCAAGGCCCAGCACCCGCCGCCTTCCCAGCTGCTGCTCCTAATTCTGCTGAGCTGTGCCTGGAT  74

Query   75  CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG  148
            ..||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGATGAGATGATGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACTCCCACAGTGGCCTCTGAGG  148

Query  149  CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCCG  222
            .|||||||||.|||||.||||||||..|||||.|||.||||||||||||.||||.|.||||             
Sbjct  149  ACCTGGCTGAGCTGCTCCATGGGGCTTTGCTGCGGAAGGGCCCAGAGATCGGCTTCTTGCC-------------  209

Query  223  GACCCCACGCTAGCCACCCCTCC-GGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGG  295
            |.||||.|        ||||.|| |||   ||.|.||| |.||||.||..||||    |.|||  |||||  ||
Sbjct  210  GGCCCCGC--------CCCCGCCTGGC---CCCGCCTC-CCCAGTCCCACCCCT----CAGGC--CTGAG--GG  263

Query  296  -GGACAGG-----------------------GCCTCTGACAACAGCCGTCACCCC-------------------  326
             |||.|||                       .||    ||||||.|.||||||.|                   
Sbjct  264  AGGAGAGGAGGAAACCACCACCACCATCATCACC----ACAACAACTGTCACCACCACTGTCACCAGCCCAGTT  333

Query  327  --------TAAC-----------GGGGTCAGGG---GGGCAGGCCCC--ACTGCGCCAGAACTGCTGACC--CC  374
                    ||||           |||...||||   |.|.||.|.||  |||..|..||.||||    ||  ||
Sbjct  334  CTGTGCAATAACAACATCTCGGAGGGCGAAGGGTTTGTGGAGTCTCCGGACTTGGGGAGCACTG----CCAGCC  403

Query  375  GCCCCCAGGA-------------ACC-ACAGC-----------CCC----------------------------  395
            ||.||..|||             ||| |||||           |||                            
Sbjct  404  GCTCCGTGGAGCTCCTAGATTGCACCTACAGCATCCATGTCTACCCTGGTTATGGCATTGAGATTCAGGTGCAG  477

Query  396  ACCCCCA----------------------------------------------CCCAGCCCTGCCTCCCCAG--  421
            ||.|.||                                              .||||.||||.| ||||||  
Sbjct  478  ACACTCAACCTGTCTCAGGAGGAAGAACTTCTGGTGTTGGCCGGTGGGGGTTCTCCAGGCCTGGC-CCCCAGAC  550

Query  422  ----GGCC---TCC-CCTTGGGCCTGAGGGAGGAG----AG----GAGGAGACGA------CGAC--CACCATC  471
                ||||   ||| ||.||   ||  |||||.||    ||    |.||||.|.|      ||.|  |.||..|
Sbjct  551  TCCTGGCCAATTCCTCCATG---CT--GGGAGAAGGACAAGTGCTGCGGAGCCCAACAAACCGGCTGCTCCTGC  619

Query  472  ATCACCA-------CGA-----------CAACTGTTAC------CACTACGGTGACCAGCCCAGCCTACCTCCT  521
            ||..|||       |||           |||..|.|.|      ||||      |.|||    ||.|||||.||
Sbjct  620  ATTTCCAGAGTCCTCGAGTCCCAAGGGGCAATGGCTTCAGGATTCACT------ATCAG----GCATACCTTCT  683

Query  522  GAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCGGCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCA  595
            ||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  684  GAGCTGCGGCTTCCCACCCCGGCCAGCCCACGGGGATGTGAGCGTGACAGACTTGCATCCTGGGGGCACTGCCA  757

Query  596  CCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCAGCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCC  669
            ||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  758  CCTTCCACTGTGACTCAGGATACCAGCTACAGGGTGAGGAGACCCTCATTTGCCTCAATGGTACCCGGCCAGCC  831

Query  670  TGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCATGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGT  743
            ||||..||||||.||||.|||||.|..|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  832  TGGACTGGTGAACCCCCTAGCTGTACAGCATCTTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACACTGGGTCGCATTGT  905

Query  744  GTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTAGGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCC  817
            .|||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  906  ATCCCCTGAGCCTGGGGGAGCTGCAGGGCCCAACCTCACCTGCCGCTGGGTCATTGAAGCGGCCGAGGGACGCC  979

Query  818  GGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGTCTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGC  891
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  980  GGCTTCACCTACACTTTGAGAGAGTCTCACTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGAAGC  1053

Query  892  CCCCTATCCCCCGTGATCTATGATTCGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTC  965
            |||||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1054  CCCCTGTCCCCTGTGATTTACGACTCTGACATGGATGATGTCCCTGAACGCGGTCTCATCAGTGATGCCCAGTC  1127

Query  966  CCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAGACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGG  1039
            |||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1128  CCTCTACGTAGAACTGCTTTCAGAGACACCAGCCAACCCCCTGCTGCTCAGCCTCCGATTTGAAGCCTTTGAGG  1201

Query 1040  AGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCTGGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCA  1113
            ||||.|||||||||.||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||..|.||||||.|||
Sbjct 1202  AGGACCGCTGCTTCCCCCCGTTCCTGGCTCACGGCAATGTGACCACTACAGATCCTGAGTTCCACCCAGGAGCA  1275

Query 1114  CTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAGGATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGA  1187
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1276  CTGGCCACCTTCTCATGCCTCCCAGGATATGCTCTGGAGCCACCAGGACCCCCCAATGCTATCGAATGTGTGGA  1349

Query 1188  TCCCACAGAACCCCACTGGAACGACACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAG  1261
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1350  TCCCACCGAACCCCACTGGAACGACACAGAGCCAGCCTGCAAGGCCATGTGTGGAGGAGAGCTGTCTGAGCCAG  1423

Query 1262  CTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTGGCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTC  1335
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1424  CTGGTGTGGTACTCTCTCCCGACTGGCCCCAGAGTTACAGCCCTGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCCTGCACGTC  1497

Query 1336  CAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCCAAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGA  1409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1498  CAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCCAAGTTGAAATCTTGAATGTTCGCGAAGGGGATATGCTAACACTGTTCGA  1571

Query 1410  CGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTCTTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTG  1483
            ||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1572  CGGGGACGGTCCGAGCGCTCGAGTCCTGGCCCAGCTGCGAGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTCCTCTCCTCTG  1645

Query 1484  GGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCAGGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTG  1557
            |.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1646  GACCTGATCTCACTCTGCAGTTTCAGGCACCCCCTGGTCCCCCAAATCCGGGCCTAGGCCAGGGTTTCGTGTTA  1719

Query 1558  CACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACGACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATC  1631
            ||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1720  CATTTCAAAGAGGTCCCGAGAAACGATACGTGCCCGGAGCTACCACCACCTGAGTGGGGCTGGAGGACAGCATC  1793

Query 1632  CCACGGGGACCTGATCCGGGGCACGGTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACA  1705
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct 1794  CCACGGGGACCTTATCCGGGGTACAGTGCTCACCTATCAATGCGAGCCTGGCTATGAACTACTGGGATCAGACA  1867

Query 1706  TTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTCTTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGAC  1779
            |.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1868  TCCTCACTTGCCAATGGGACCTGTCCTGGAGCGCGGCGCCACCTGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGAC  1941

Query 1780  CCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACCGCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCG  1853
            |||||||||||..||||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1942  CCTGGCGAGATCACCAATGGCCATCGGACTGCCTCAGATGCTGGTTTCCCTGTGGGCTCCCACGTCCAGTATCG  2015

Query 1854  CTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAGGGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGT  1927
            |||.|||||||||||||||||.||.||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2016  CTGTCTGCCAGGGTACAGCCTGGAAGGAGCAGCTGTGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGT  2089

Query 1928  GGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGCCTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTAC  2001
            ||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 2090  GGAGTGATCGGGTCCCCAAATGCGCCTTAAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCCGGTGTTCCTGAGAATGGTTAC  2163

Query 2002  CAGACGCTGTACAAGCACCACTACCAGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTAT  2075
            ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 2164  CAAACTCTGTACAAGCATCACTACCAAGCGGGCGAGTCGCTACGCTTCTTCTGCTACGAGGGCTTTGAGCTCAT  2237

Query 2076  CGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTGCCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTG  2149
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2238  CGGCGAGGTCACCATCACATGTGTACCCGGTCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTGG  2311

Query 2150  CCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCGAAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGG  2223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 2312  CCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCGAAAACTGGAAGTGACCCAGACTACAGACCCATCACGGCAGCTGGAGGGT  2385

Query 2224  GGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGCTGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTA  2297
            ||.||.||.||..|||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 2386  GGTAATCTCGCTTTGGCCATCCTGTTGCCCCTGGGCTTGGTCATTGTCCTTGGCATTGGCGTTTACATATACTA  2459

Query 2298  CACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTTTTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGG  2371
            |||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 2460  CACTAAGCTACAAGGAAAATCCCTCTTTGGCTTCTCGGGTTCTCACTCTTACAGTCCCATTACGGTGGAGTCAG  2533

Query 2372  ACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGCTGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2427
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2534  ACTTCAGCAACCCACTGTATGAAGCTGGGGATACGAGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2589