Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478879
• Subject: NM_012410.4
• Aligned Length: 2600
• Identities: 2325
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT  74

Query   75  CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG  148

Query  149  CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCT------  216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||      
Sbjct  149  CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGGCCTCCCCTT  222

Query  217  ---------------------GATCCG--GACC----------CCACG----CTAGCCACCCCTCCGG----CC  249
                                 ||..||  ||||          |||||    || |..|||.||.|||    |.
Sbjct  223  GGGCCTGAGGGAGGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACT-GTTACCACTACGGTGACCA  295

Query  250  GGCCAG------------AC----TCTCGCAGTGC---------------CCTCC----CTGCCACGGG---CC  285
            |.||||            ||    ||||..||.||               .||||    |||    |||   ||
Sbjct  296  GCCCAGTTCTGTGTAATAACAACATCTCCGAGGGCGAAGGGTATGTGGAGTCTCCAGATCTG----GGGAGCCC  365

Query  286  ACTGAGCCGGGGACA-----GGGC----------CTCTGACAACAGCC--GTC-ACCC---CTAACGG------  332
            ..|.|||||    ||     ||||          |.||.|||.||.||  ||| ||||   || ||||      
Sbjct  366  CGTCAGCCG----CACCCTGGGGCTCCTGGACTGCACTTACAGCATCCATGTCTACCCTGGCT-ACGGCATTGA  434

Query  333  GGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGACCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCC-----------  395
            |.||       ||||      ||   ||||  .|||||.||.| .|.||||||....|||.||           
Sbjct  435  GATC-------CAGG------TG---CAGA--CGCTGAACCTG-TCACAGGAAGAGGAGCTCCTGGTGCTGGCT  489

Query  396  --------ACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGG-------------GCCTGAGGGAGGAG  448
                    |.|    |||||.||||.|.||||   |.||||   |||             ||.||..|.||||.
Sbjct  490  GGTGGGGGATC----CCCAGGCCTGGCCCCCC---GACTCC---TGGCCAACTCATCCATGCTTGGAGAAGGAC  553

Query  449  AGG-----AGGAGACGA--CGACCACCATCATCACCAC-------GACAACTGTTACCACTA----CGGTGAC-  503
            |.|     .||||.|.|  |.|||..|..|.||..|||       |.|.||.|.|.|||  |    |||||.| 
Sbjct  554  AAGTCCTTCGGAGCCCAACCAACCGGCTGCTTCTGCACTTCCAGAGCCCACGGGTCCCA--AGGGGCGGTGGCT  625

Query  504  -CAG--CCCA-------GCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCGGCCCATGGGGACGTGAGTGTG  567
             |||  .|||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  626  TCAGGATCCACTATCAGGCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCGGCCCATGGGGACGTGAGTGTG  699

Query  568  ACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCAGCTGCAGGGAGAGGAGACCCT  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  ACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCAGCTGCAGGGAGAGGAGACCCT  773

Query  642  CATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCATGGCATCCTGTGGTGGCACCA  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  774  CATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCATGGCATCCTGTGGTGGCACCA  847

Query  716  TCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTAGGGCCCAACCTCACCTGCCGT  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  848  TCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTAGGGCCCAACCTCACCTGCCGT  921

Query  790  TGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGTCTCGCTGGATGAGGACAATGA  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  TGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGTCTCGCTGGATGAGGACAATGA  995

Query  864  CCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATTCGGACATGGACGATGTCCCCG  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996  CCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATTCGGACATGGACGATGTCCCCG  1069

Query  938  AGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAGACACCTGCCAATCCCCTGCTG  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070  AGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAGACACCTGCCAATCCCCTGCTG  1143

Query 1012  TTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCTGGCACATGGAAATGTCACTAC  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144  TTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCTGGCACATGGAAATGTCACTAC  1217

Query 1086  CACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAGGATATGCCCTGGAGCCCCCTG  1159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218  CACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAGGATATGCCCTGGAGCCCCCTG  1291

Query 1160  GGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGACACAGAGCCGGCCTGCAAAGCC  1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292  GGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGACACAGAGCCGGCCTGCAAAGCC  1365

Query 1234  ATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTGGCCCCAGAGCTATAGCCCGGG  1307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366  ATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTGGCCCCAGAGCTATAGCCCGGG  1439

Query 1308  CCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCCAAGTTGAGATATTGAATGTGC  1381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440  CCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCCAAGTTGAGATATTGAATGTGC  1513

Query 1382  GGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTCTTGGCCCAGCTGCGGGGACCT  1455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514  GGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTCTTGGCCCAGCTGCGGGGACCT  1587

Query 1456  CAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCAGGCACCGCCCGGGCCCCCAAA  1529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588  CAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCAGGCACCGCCCGGGCCCCCAAA  1661

Query 1530  TCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACGACACGTGCCCCGAGCTGCCAC  1603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662  TCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACGACACGTGCCCCGAGCTGCCAC  1735

Query 1604  CTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACGGTGCTCACCTACCAGTGCGAG  1677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736  CTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACGGTGCTCACCTACCAGTGCGAG  1809

Query 1678  CCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTCTTGGAGCGCCGCGCCGCCCGC  1751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810  CCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTCTTGGAGCGCCGCGCCGCCCGC  1883

Query 1752  CTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACCGCACCGCCTCGGACGCCGGCT  1825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1884  CTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACCGCACCGCCTCGGACGCCGGCT  1957

Query 1826  TCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAGGGGGCAGCCATGCTCACCTGC  1899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1958  TCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAGGGGGCAGCCATGCTCACCTGC  2031

Query 1900  TACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGCCTTGAAGTACGAGCCGTGCCT  1973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032  TACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGCCTTGAAGTACGAGCCGTGCCT  2105

Query 1974  GAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACCAGGCGGGCGAGTCTCTGCGCT  2047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106  GAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACCAGGCGGGCGAGTCTCTGCGCT  2179

Query 2048  TCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTGCCCGGCCACCCCTCCCAGTGG  2121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2180  TCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTGCCCGGCCACCCCTCCCAGTGG  2253

Query 2122  ACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCGAAAACTGGAAGTGACCCAGAC  2195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2254  ACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCGAAAACTGGAAGTGACCCAGAC  2327

Query 2196  CACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGCTGCCTCTAGGCTTGGTCATTG  2269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2328  CACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGCTGCCTCTAGGCTTGGTCATTG  2401

Query 2270  TCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTTTTCGGCTTCTCGGGCTCCCAC  2343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2402  TCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTTTTCGGCTTCTCGGGCTCCCAC  2475

Query 2344  TCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGCTGGGGATACGCGGGAGTATGA  2417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2476  TCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGCTGGGGATACGCGGGAGTATGA  2549

Query 2418  AGTTTCCATC  2427
            ||||||||||
Sbjct 2550  AGTTTCCATC  2559