Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478879
• Subject: NM_144926.5
• Aligned Length: 2769
• Identities: 2150
• Gaps: 342

Alignment

Query    1  ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT  74
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGGGGACTCCCAAGGCCCAGCACCCGCCGCCTTCCCAGCTGCTGCTCCTAATTCTGCTGAGCTGTGCCTGGAT  74

Query   75  CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG  148
            ..||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGATGAGATGATGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACTCCCACAGTGGCCTCTGAGG  148

Query  149  CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCCG  222
            .|||||||||.|||||.||||||||..|||||.|||.||||||||||||.||||.|.||||.||||||||.||.
Sbjct  149  ACCTGGCTGAGCTGCTCCATGGGGCTTTGCTGCGGAAGGGCCCAGAGATCGGCTTCTTGCCGGGATCTGACCCA  222

Query  223  GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG  296
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||..||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  223  GACCCCACACTAGCCACCCCTCCAGCCGGCCAGACTCTTGCAGCACCTTCCCTGCCACGTGCCACTGAGCCAGG  296

Query  297  GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA  370
            |||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  297  GACAGGGCCTCTGACGACAGCTGTCACCCCCAAGGGAGTCAGGGGGGCAGGCCCCACCGCGCCAGAGCTGCTGA  370

Query  371  CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA  444
            ||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||..||||.||||||||||..||.|||||..|||||||||||
Sbjct  371  CCCCACCCCCTGGAACTACAGCCCCGCCCCCGCCTGGCCCCGCCTCCCCAGTCCCACCCCTCAGGCCTGAGGGA  444

Query  445  GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCA--------  510
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||        
Sbjct  445  GGAGAGGAGGAAACCACCACCACCATCATCACCACAACAACTGTCACCACCACTGTCACCAGCCCAGTTCTGTG  518

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  519  CAATAACAACATCTCGGAGGGCGAAGGGTTTGTGGAGTCTCCGGACTTGGGGAGCACTGCCAGCCGCTCCGTGG  592

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  593  AGCTCCTAGATTGCACCTACAGCATCCATGTCTACCCTGGTTATGGCATTGAGATTCAGGTGCAGACACTCAAC  666

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  667  CTGTCTCAGGAGGAAGAACTTCTGGTGTTGGCCGGTGGGGGTTCTCCAGGCCTGGCCCCCAGACTCCTGGCCAA  740

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  741  TTCCTCCATGCTGGGAGAAGGACAAGTGCTGCGGAGCCCAACAAACCGGCTGCTCCTGCATTTCCAGAGTCCTC  814

Query  511  --------------------------------------GCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCG  546
                                                  ||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct  815  GAGTCCCAAGGGGCAATGGCTTCAGGATTCACTATCAGGCATACCTTCTGAGCTGCGGCTTCCCACCCCGGCCA  888

Query  547  GCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCA  620
            |||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  889  GCCCACGGGGATGTGAGCGTGACAGACTTGCATCCTGGGGGCACTGCCACCTTCCACTGTGACTCAGGATACCA  962

Query  621  GCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCA  694
            |||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||..||||||.||||.|||||.|
Sbjct  963  GCTACAGGGTGAGGAGACCCTCATTTGCCTCAATGGTACCCGGCCAGCCTGGACTGGTGAACCCCCTAGCTGTA  1036

Query  695  TGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTA  768
            ..|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|.|
Sbjct 1037  CAGCATCTTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACACTGGGTCGCATTGTATCCCCTGAGCCTGGGGGAGCTGCA  1110

Query  769  GGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGT  842
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct 1111  GGGCCCAACCTCACCTGCCGCTGGGTCATTGAAGCGGCCGAGGGACGCCGGCTTCACCTACACTTTGAGAGAGT  1184

Query  843  CTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATT  916
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1185  CTCACTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGAAGCCCCCTGTCCCCTGTGATTTACGACT  1258

Query  917  CGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAG  990
            |.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1259  CTGACATGGATGATGTCCCTGAACGCGGTCTCATCAGTGATGCCCAGTCCCTCTACGTAGAACTGCTTTCAGAG  1332

Query  991  ACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCT  1064
            |||||.|||||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||
Sbjct 1333  ACACCAGCCAACCCCCTGCTGCTCAGCCTCCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGACCGCTGCTTCCCCCCGTTCCT  1406

Query 1065  GGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAG  1138
            |||.||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||..|.||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1407  GGCTCACGGCAATGTGACCACTACAGATCCTGAGTTCCACCCAGGAGCACTGGCCACCTTCTCATGCCTCCCAG  1480

Query 1139  GATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGAC  1212
            |||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GATATGCTCTGGAGCCACCAGGACCCCCCAATGCTATCGAATGTGTGGATCCCACCGAACCCCACTGGAACGAC  1554

Query 1213  ACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTG  1286
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1555  ACAGAGCCAGCCTGCAAGGCCATGTGTGGAGGAGAGCTGTCTGAGCCAGCTGGTGTGGTACTCTCTCCCGACTG  1628

Query 1287  GCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC  1360
            |||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCCCAGAGTTACAGCCCTGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCCTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC  1702

Query 1361  AAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTC  1434
            |||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1703  AAGTTGAAATCTTGAATGTTCGCGAAGGGGATATGCTAACACTGTTCGACGGGGACGGTCCGAGCGCTCGAGTC  1776

Query 1435  TTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCA  1508
            .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1777  CTGGCCCAGCTGCGAGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTCCTCTCCTCTGGACCTGATCTCACTCTGCAGTTTCA  1850

Query 1509  GGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACG  1582
            ||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851  GGCACCCCCTGGTCCCCCAAATCCGGGCCTAGGCCAGGGTTTCGTGTTACATTTCAAAGAGGTCCCGAGAAACG  1924

Query 1583  ACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACG  1656
            |.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1925  ATACGTGCCCGGAGCTACCACCACCTGAGTGGGGCTGGAGGACAGCATCCCACGGGGACCTTATCCGGGGTACA  1998

Query 1657  GTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTC  1730
            |||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1999  GTGCTCACCTATCAATGCGAGCCTGGCTATGAACTACTGGGATCAGACATCCTCACTTGCCAATGGGACCTGTC  2072

Query 1731  TTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACC  1804
            .||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.||.|
Sbjct 2073  CTGGAGCGCGGCGCCACCTGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATCACCAATGGCCATC  2146

Query 1805  GCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAG  1878
            |.||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 2147  GGACTGCCTCAGATGCTGGTTTCCCTGTGGGCTCCCACGTCCAGTATCGCTGTCTGCCAGGGTACAGCCTGGAA  2220

Query 1879  GGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGC  1952
            ||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGAGCAGCTGTGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGTGATCGGGTCCCCAAATGCGC  2294

Query 1953  CTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACC  2026
            |||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2295  CTTAAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCCGGTGTTCCTGAGAATGGTTACCAAACTCTGTACAAGCATCACTACC  2368

Query 2027  AGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTG  2100
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2369  AAGCGGGCGAGTCGCTACGCTTCTTCTGCTACGAGGGCTTTGAGCTCATCGGCGAGGTCACCATCACATGTGTA  2442

Query 2101  CCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCG  2174
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCCGGTCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTGGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCG  2516

Query 2175  AAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGC  2248
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||..|||||||||||.
Sbjct 2517  AAAACTGGAAGTGACCCAGACTACAGACCCATCACGGCAGCTGGAGGGTGGTAATCTCGCTTTGGCCATCCTGT  2590

Query 2249  TGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTT  2322
            ||||.||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 2591  TGCCCCTGGGCTTGGTCATTGTCCTTGGCATTGGCGTTTACATATACTACACTAAGCTACAAGGAAAATCCCTC  2664

Query 2323  TTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGC  2396
            ||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2665  TTTGGCTTCTCGGGTTCTCACTCTTACAGTCCCATTACGGTGGAGTCAGACTTCAGCAACCCACTGTATGAAGC  2738

Query 2397  TGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2427
            ||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGGGGATACGAGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2769