Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478893
• Subject: NM_001114120.3
• Aligned Length: 2433
• Identities: 1581
• Gaps: 852

Alignment

Query    1  ATGGAGAGTCAGGGTGTGCCTCCCGGGCCTTATCGGGCCACCAAGCTGTGGAATGAAGTTACCACATCTTTTCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGTCAGGGTGTGCCTCCCGGGCCTTATCGGGCCACCAAGCTGTGGAATGAAGTTACCACATCTTTTCG  74

Query   75  AGCAGGAATGCCTCTAAGAAAACACAGACAACACTTTAAAAAATATGGCAATTGTTTCACAGCAGGAGAAGCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCAGGAATGCCTCTAAGAAAACACAGACAACACTTTAAAAAATATGGCAATTGTTTCACAGCAGGAGAAGCAG  148

Query  149  TGGATTGGCTTTATGACCTATTAAGAAATAATAGCAATTTTGGTCCTGAAGTTACAAGGCAACAGACTATCCAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGATTGGCTTTATGACCTATTAAGAAATAATAGCAATTTTGGTCCTGAAGTTACAAGGCAACAGACTATCCAA  222

Query  223  CTGTTGAGGAAATTTCTTAAGAATCATGTAATTGAAGATATCAAAGGGAGGTGGGGATCAGAAAATGTTGATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGTTGAGGAAATTTCTTAAGAATCATGTAATTGAAGATATCAAAGGGAGGTGGGGATCAGAAAATGTTGATGA  296

Query  297  TAACAACCAGCTCTTCAGATTTCCTGCAACTTCGCCACTTAAAACTCTACCACGAAGGTATCCAGAATTGAGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAACAACCAGCTCTTCAGATTTCCTGCAACTTCGCCACTTAAAACTCTACCACGAAGGTATCCAGAATTGAGAA  370

Query  371  AAAACAACATAGAGAACTTTTCCAAAGATAAAGATAGCATTTTTAAATTACGAAACTTATCTCGTAGAACTCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAACAACATAGAGAACTTTTCCAAAGATAAAGATAGCATTTTTAAATTACGAAACTTATCTCGTAGAACTCCT  444

Query  445  AAAAGGCATGGATTACATTTATCTCAGGAAAATGGCGAGAAAATAAAGCATGAAATAATCAATGAAGATCAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAAGGCATGGATTACATTTATCTCAGGAAAATGGCGAGAAAATAAAGCATGAAATAATCAATGAAGATCAAGA  518

Query  519  AAATGCAATTGATAATAGAGAACTAAGCCAGGAAGATGTTGAAGAAGTTTGGAGATATGTTATTCTGATCTACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATGCAATTGATAATAGAGAACTAAGCCAGGAAGATGTTGAAGAAGTTTGGAGATATGTTATTCTGATCTACC  592

Query  593  TGCAAACCATTTTAGGTGTGCCATCCCTAGAAGAAGTCATAAATCCAAAACAAGTAATTCCCCAATATATAATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCAAACCATTTTAGGTGTGCCATCCCTAGAAGAAGTCATAAATCCAAAACAAGTAATTCCCCAATATATAATG  666

Query  667  TACAACATGGCCAATACAAGTAAACGTGGAGTAGTTATACTACAAAACAAATCAGATGACCTCCCTCACTGGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACAACATGGCCAATACAAGTAAACGTGGAGTAGTTATACTACAAAACAAATCAGATGACCTCCCTCACTGGGT  740

Query  741  ATTATCTGCCATGAAGTGCCTAGCAAATTGGCCAAGAAGCAATGATATGAATAATCCAACTTATGTTGGATTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTATCTGCCATGAAGTGCCTAGCAAATTGGCCAAGAAGCAATGATATGAATAATCCAACTTATGTTGGATTTG  814

Query  815  AACGAGATGTATTCAGAACAATCGCAGATTATTTTCTAGATCTCCCTGAACCTCTACTTACTTTTGAATATTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACGAGATGTATTCAGAACAATCGCAGATTATTTTCTAGATCTCCCTGAACCTCTACTTACTTTTGAATATTAC  888

Query  889  GAATTATTTGTAAACATTTTGG----------------------------------------------------  910
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct  889  GAATTATTTGTAAACATTTTGGTTGTTTGTGGCTACATCACAGTTTCAGATAGATCCAGTGGGATACATAAAAT  962

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct  963  TCAAGATGATCCACAGTCTTCAAAATTCCTTCACTTAAACAATTTGAATTCCTTCAAATCAACTGAGTGCCTTC  1036

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct 1037  TTCTCAGTCTGCTTCATAGAGAAAAAAACAAAGAAGAATCAGATTCTACTGAGAGACTACAGATAAGCAATCCA  1110

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct 1111  GGATTTCAAGAAAGATGTGCTAAGAAAATGCAGCTAGTTAATTTAAGAAACAGAAGAGTGAGTGCTAATGACAT  1184

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct 1185  AATGGGAGGAAGTTGTCATAATTTAATAGGGTTAAGTAATATGCATGATCTATCCTCTAACAGCAAACCAAGGT  1258

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct 1259  GCTGTTCTTTGGAAGGAATTGTAGATGTGCCAGGGAATTCAAGTAAAGAGGCATCCAGTGTCTTTCATCAATCT  1332

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct 1333  TTTCCGAACATAGAAGGACAAAATAATAAACTGTTTTTAGAGTCTAAGCCCAAACAGGAATTCCTGTTGAATCT  1406

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct 1407  TCATTCAGAGGAAAATATTCAAAAGCCATTCAGTGCTGGTTTTAAGAGAACCTCTACTTTGACTGTTCAAGACC  1480

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct 1481  AAGAGGAGTTGTGTAATGGGAAATGCAAGTCAAAACAGCTTTGTAGGTCTCAGAGTTTGCTTTTAAGAAGTAGT  1554

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct 1555  ACAAGAAGGAATAGTTATATCAATACACCAGTGGCTGAAATTATCATGAAACCAAATGTTGGACAAGGCAGCAC  1628

Query  911  --------------------------------------------------------------------------  910
                                                                                      
Sbjct 1629  AAGTGTGCAAACAGCTATGGAAAGTGAACTCGGAGAGTCTAGTGCCACAATCAATAAAAGACTCTGCAAAAGTA  1702

Query  911  ------------------------------------------------------------GCTTGCTGCAACCT  924
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct 1703  CAATAGAACTTTCAGAAAATTCTTTACTTCCAGCTTCTTCTATGTTGACTGGCACACAAAGCTTGCTGCAACCT  1776

Query  925  CATTTAGAGAGGGTTGCCATCGATGCTCTACAGTTATGTTGTTTGTTACTTCCCCCACCAAATCGTAGAAAGCT  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CATTTAGAGAGGGTTGCCATCGATGCTCTACAGTTATGTTGTTTGTTACTTCCCCCACCAAATCGTAGAAAGCT  1850

Query  999  TCAACTTTTAATGCGTATGATTTCCCGAATGAGTCAAAATGTTGATATGCCCAAACTTCATGATGCAATGGGTA  1072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCAACTTTTAATGCGTATGATTTCCCGAATGAGTCAAAATGTTGATATGCCCAAACTTCATGATGCAATGGGTA  1924

Query 1073  CGAGGTCACTGATGATACATACCTTTTCTCGATGTGTGTTATGCTGTGCTGAAGAAGTGGATCTTGATGAGCTT  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGAGGTCACTGATGATACATACCTTTTCTCGATGTGTGTTATGCTGTGCTGAAGAAGTGGATCTTGATGAGCTT  1998

Query 1147  CTTGCTGGAAGATTAGTTTCTTTCTTAATGGATCATCATCAGGAAATTCTTCAAGTACCCTCTTACTTACAGAC  1220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTTGCTGGAAGATTAGTTTCTTTCTTAATGGATCATCATCAGGAAATTCTTCAAGTACCCTCTTACTTACAGAC  2072

Query 1221  TGCAGTGGAAAAACATCTTGACTACTTAAAAAAGGGACATATTGAAAATCCTGGAGATGGACTATTTGCTCCTT  1294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGCAGTGGAAAAACATCTTGACTACTTAAAAAAGGGACATATTGAAAATCCTGGAGATGGACTATTTGCTCCTT  2146

Query 1295  TGCCAACTTACTCATACTGTAAGCAGATTAGTGCTCAGGAGTTTGATGAGCAAAAAGTTTCTACCTCTCAAGCT  1368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCCAACTTACTCATACTGTAAGCAGATTAGTGCTCAGGAGTTTGATGAGCAAAAAGTTTCTACCTCTCAAGCT  2220

Query 1369  GCAATTGCAGAACTTTTAGAAAATATTATTAAAAACAGGAGTTTACCTCTAAAGGAGAAAAGAAAAAAACTAAA  1442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GCAATTGCAGAACTTTTAGAAAATATTATTAAAAACAGGAGTTTACCTCTAAAGGAGAAAAGAAAAAAACTAAA  2294

Query 1443  ACAGTTTCAGAAGGAATATCCTTTGATATATCAGAAAAGATTTCCAACCACGGAGAGTGAAGCAGCACTTTTTG  1516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ACAGTTTCAGAAGGAATATCCTTTGATATATCAGAAAAGATTTCCAACCACGGAGAGTGAAGCAGCACTTTTTG  2368

Query 1517  GTGACAAACCTACAATCAAGCAACCAATGCTGATTTTAAGAAAACCAAAGTTCCGTAGTCTAAGA  1581
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GTGACAAACCTACAATCAAGCAACCAATGCTGATTTTAAGAAAACCAAAGTTCCGTAGTCTAAGA  2433