Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478893
- Subject:
- NM_001172093.1
- Aligned Length:
- 1587
- Identities:
- 1384
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGGAGAGTCAGGGTGTGCCTCCCGGGCCTTATCGGGCCACCAAGCTGTGGAATGAAGTTACCACATCTTTTCG 74
||||||.|||||||||..||||..||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCGTCAGGGTGCTCCTCTTGGACCTTACCGGGCCACCAAGCTGTGGAATGAAGTAACCACATCTTTTCG 74
Query 75 AGCAGGAATGCCTCTAAGAAAACACAGACAACACTTTAAAAAATATGGCAATTGTTTCACAGCAGGAGAAGCAG 148
||.||||||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||||..|||||..
Sbjct 75 AGTAGGAATGCCTTTAAGAAAACATAGACAACATTTAAAAAAATATAGCAATTGTTTCACTGCAGTTGAAGCTA 148
Query 149 TGGATTGGCTTTATGACCTATTAAGAAATAATAGCAATTTTGGTCCTGAAGTTACAAGGCAACAGACTATCCAA 222
|.||||||||||||||.||.|||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 149 TAGATTGGCTTTATGATCTGTTAAGAAGTAATAGTAATTTTGGTCCTGAAGTTACAAGACAACAGACTATTCAA 222
Query 223 CTGTTGAGGAAATTTCTTAAGAATCATGTAATTGAAGATATCAAAGGGAGGTGGGGATCAGAAAATGTTGATGA 296
||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||...|||||||
Sbjct 223 CTATTGAGAAAATTTCTTAAGAATCATGTGATTGAAGATATCAAAGGTAGATGGGGATCGGAAAGCCTTGATGA 296
Query 297 TAACAACCAGCTCTTCAGATTTCCTGCAACTTCGCCACTTAAAACTCTACCACGAAGGTATCCAGAATTGAGAA 370
.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||.|||..||.|||||.|.|..|
Sbjct 297 CAACAATCAACTATTCAGATTTCCTGCAACTTCTCCACTTAAAACTTTTCCACAAAGACATACAGAAATCAAGA 370
Query 371 AAAACAACATAGAGAACTTTTCCAAAGATAAAGATAGCATTTTTAAATTACGAAACTTATCTCGTAGAACTCCT 444
|||.|||||.||||.|||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||..|.||||.||
Sbjct 371 AAACCAACACAGAGTACTTTTCCAAAGACAAAGATGGTATTTTTAAATTACGAAACTTATCTCAAAAAACTTCT 444
Query 445 AAAAGGCATGGATTACATTTATCTCAGGAAAATGGCGAGAAAATAAAGCATGA---AATAATCAATGAAGATCA 515
||.|.||.||||||||||||.||||||||||||...||.||.|||||.||||| |||||.|||||||||||.
Sbjct 445 AAGAAGCGTGGATTACATTTCTCTCAGGAAAATACAGAAAAGATAAATCATGAAAGAATAACCAATGAAGATCT 518
Query 516 AGAAAATGCAATTGATAATAGAGAACTAAGCCAGGAAGATGTTGAAGAAGTTTGGAGATATGTTATTCTGATCT 589
|||||.||||..|||.||...||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|
Sbjct 519 AGAAATTGCACCTGACAACCAAGAAATAAGCCAGGAAGATGTTGAAGAAGTTTGGAGATACGTTATTATGATAT 592
Query 590 ACCTGCAAACCATTTTAGGTGTGCCATCCCTAGAAGAAGTCATAAATCCAAAACAAGTAATTCCCCAATATATA 663
|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 593 ACCTGCAAACCATTTTAAGTTTGCCATCCATAGAAGAACTCTTAAACCCAAACCAAGTAATTCCTCAATATATA 666
Query 664 ATGTACAACATGGCCAATACAAGTAAACGTGGAGTAGTTATACTACAAAACAAATCAGATGACCTCCCTCACTG 737
|||||||||||||||||.||||||||.|.||||||.||.|||||||||.||||||||||.||.||.||.||.||
Sbjct 667 ATGTACAACATGGCCAACACAAGTAAGCATGGAGTGGTCATACTACAAGACAAATCAGACGATCTTCCACATTG 740
Query 738 GGTATTATCTGCCATGAAGTGCCTAGCAAATTGGCCAAGAAGCAATGATATGAATAATCCAACTTATGTTGGAT 811
|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|..|||||||.||||||||||||||
Sbjct 741 GGTTTTATCTGCAATGAAGTGCCTAGCAAATTGGCCAAGAAGTAATGACACCAATAATCTAACTTATGTTGGAT 814
Query 812 TTGAACGAGATGTATTCAGAACAATCGCAGATTATTTTCTAGATCTCCCTGAACCTCTACTTACTTTTGAATAT 885
|||||||.||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 TTGAACGTGATGTATTCAAAACAATTGCAGATTATTTTCTAAATCTCCCTGAACCTCTACTTACATTTGAATAT 888
Query 886 TACGAATTATTTGTAAACATTTTGGGCTTGCTGCAACCTCATTTAGAGAGGGTTGCCATCGATGCTCTACAGTT 959
||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 889 TATGAATTATTTGTGAACATTTTGGGTTTGCTGCAACCTCACTTAGAGAGGGTTGCCATCAATGCTCTACAGTT 962
Query 960 ATGTTGTTTGTTACTTCCCCCACCAAATCGTAGAAAGCTTCAACTTTTAATGCGTATGATTTCCCGAATGAGTC 1033
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|||||||||
Sbjct 963 ATGTTGTTTGTTACTTCCCCCACCAAATCGTAGAAAGCTTCAACTCTTAATGCGCATGATTTCTAGAATGAGTC 1036
Query 1034 AAAATGTTGATATGCCCAAACTTCATGATGCAATGGGTACGAGGTCACTGATGATACATACCTTTTCTCGATGT 1107
||||||||||||||||||||||||||||...|||.|||||.||.|||.||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1037 AAAATGTTGATATGCCCAAACTTCATGAACAAATAGGTACAAGATCATTGATGATAAATACTTTTTCTCGATGT 1110
Query 1108 GTGTTATGCTGTGCTGAAGAAGTGGATCTTGATGAGCTTCTTGCTGGAAGATTAGTTTCTTTCTTAATGGATCA 1181
||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||..||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1111 GTACTATGTTGTGCTGAAGAAGTGGATCTTGATGAGCTTCTGGCTTCAAGATTAGTTTCTTTCCTAATGGATCA 1184
Query 1182 TCATCAGGAAATTCTTCAAGTACCCTCTTACTTACAGACTGCAGTGGAAAAACATCTTGACTACTTAAAAAAGG 1255
|||||||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1185 TCATCAGGAAATTCTTCAAGTACCCACTTATTTACAAGCTGCAGTGGAGAAACATCTTGACTACATTAAAAAGG 1258
Query 1256 GACATATTGAAAATCCTGGAGATGGACTATTTGCTCCTTTGCCAACTTACTCATACTGTAAGCAGATTAGTGCT 1329
|..||.||.||||||.|||||||||||||.|||.||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259 GCAATGTTAAAAATCATGGAGATGGACTAGTTGTTCCTTTGCCAACATATTCTTACTGTAAACAGATTAGTGCT 1332
Query 1330 CAGGAGTTTGATGAGCAAAAAGTTTCTACCTCTCAAGCTGCAATTGCAGAACTTTTAGAAAATATTATTAAAAA 1403
.|.||.||||||||.||.|||.||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.|.||.
Sbjct 1333 AAAGAATTTGATGAACAGAAAATTTCAACTTCCCAAGCTGCAATTGCAGAACTTTTGGAGAATATTGTCAGAAG 1406
Query 1404 CAGGAGTTTACCTCTAAAGGAGAAAAGAAAAAAACTAAAACAGTTTCAGAAGGAATATCCTTTGATATATCAGA 1477
.|..||.||..||||||||||||||||||.||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1407 TAAAAGCTTGTCTCTAAAGGAGAAAAGAAGAAAATTGAAACAGTTTCAGAAGGAATACCCCTTGATATATCAGA 1480
Query 1478 AAAGATTTCCAACCACGGAGAGTGAAGCAGCACTTTTTGGTGACAAACCTACAATCAAGCAACCAATGCTGATT 1551
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 1481 AAAGATTTCCAACCACTGAGAGTGAAGCAGCACTTTTTGATGATAAACCTACAATCAAGCAACCGATGCTGAAT 1554
Query 1552 TTAAGAAAACCAAAGTTCCGTAGTCTAAGA--- 1581
||||||||.||.|||.|.|..|||||..|.
Sbjct 1555 TTAAGAAACCCCAAGCTTCACAGTCTGCGTTAC 1587