Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478908
• Subject: XM_006518375.3
• Aligned Length: 1101
• Identities: 1027
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCTTTGAACGTTGCCCCAGTCAGAGATACAAAATGGCTGACATTAGAAGTCTGCAGACAGTTTCAAAGAGG  74
            |||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||..|.||.|||||||||||||..||.|||||
Sbjct    1  ATGGCCTTGAACGTTGCCCCCGTGAGAGACACAAAGTGGCTGACGCTGGAGGTCTGCAGACAGTACCAGAGAGG  74

Query   75  AACATGCTCACGCTCTGATGAAGAATGCAAATTTGCTCATCCCCCCAAAAGTTGTCAGGTTGAAAATGGAAGAG  148
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACGTGCTCACGCTCCGACGAAGAATGCAAGTTTGCTCACCCCCCCAAAAGTTGCCAGGTTGAAAATGGAAGAG  148

Query  149  TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTAAAGGGCCGTTGTTCGAGAGAGAACTGCAAGTATCTTCACCCTCCGACACAC  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTCAAGGGCCGCTGTTCAAGAGAGAACTGCAAATATCTTCATCCTCCGACACAC  222

Query  223  TTAAAAACTCAACTAGAAATTAATGGAAGGAACAATTTGATTCAGCAAAAAACTGCAGCAGCAATGCTTGCCCA  296
            ||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  TTAAAAACCCAGCTAGAGATTAATGGGAGGAACAATTTGATCCAGCAAAAAACTGCAGCAGCGATGCTTGCCCA  296

Query  297  GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACACCACTTCATCCAGTGCCCACTTTCCCTGTAGGTCCCGCGATAGGGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACGCCGCTCCATCCTGTGCCCACTTTTCCTGTAGGTCCCACCATAGGGA  370

Query  371  CAAATACGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACCTAGCACCTGTAACCCCTGGAGTTGGGTTGGTCCCAACGGAAATT  444
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..||
Sbjct  371  CAAATGCGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACTTAGCGCCTGTCACCCCTGGAGTTGGGTTAGTCCCAACAGAGGTT  444

Query  445  CTGCCCACCACGCCTGTTATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT  518
            ||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTACCCACTACACCGGTCATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT  518

Query  519  TCTCAGGACTGACAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACCGACTGCC  592
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  TCTCAGGACTGATAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACAGACTGCC  592

Query  593  GCTTTGCACACCCCGCAGACAGCACCATGATCGACACAAGTGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA  666
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTTTGCACACCCGGCAGACAGCACCATGATCGACACAAACGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA  666

Query  667  AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC  740

Query  741  GCAGCACCAAGCCAACCAAGCTGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGGCCTTTCCCC  814
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  741  GCAGCACCAAGCCAACCAGGCCGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGGCCTTCCCTC  814

Query  815  CTGGTGCTCTTCATCCTTTACCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAATGGTACCAGCGCGGTCTTTAACCCC  888
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||.|||||||.||||||
Sbjct  815  CGGGTGCTCTTCATCCCTTACCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAACGGGGCCAGCACGGTCTTCAACCCC  888

Query  889  AGCGTCTTGCACTACCAGCAGGCTCTCACCAGCGCACAGTTGCAGCAACACGCCGCGTTCATTCCAACAGGGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||.|||.|.||||||||.||.||||||||
Sbjct  889  AGCGTCTTGCACTACCAGCAGGCTCTGACCAGTGCGCAGCTGCAGCAGCACACGGCGTTCATCCCCACAGGGTC  962

Query  963  AGTTTTGTGCATGACACCCGCTACCAGTATTGTACCCATGATGCACAGCGCTACGTCCGCCACTGTCTCTGCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTTTTGTGCATGACACCCGCTACCAGTATTGTACCCATGATGCACAGCGCTACGTCCGCCACTGTCTCTGCAG  1036

Query 1037  CAACAACTCCTGCAACAAGTGTCCCCTTCGCAGCAACAGCCACAGCCAATCAGATAATTCTGAAA  1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAACAACTCCTGCAACAAGTGTCCCCTTCGCAGCAACAGCCACAGCCAATCAGATAATTCTGAAA  1101