Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478908
• Subject: XM_006518376.3
• Aligned Length: 1130
• Identities: 953
• Gaps: 76

Alignment

Query    1  ATGGCTTTGAACGTTGCCCCAGTCAGAGATACAAAATGGCTGACATTAGAAGTCTGCAGACAGTTTCAAAGAGG  74
            |||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||..|.||.|||||||||||||..||.|||||
Sbjct    1  ATGGCCTTGAACGTTGCCCCCGTGAGAGACACAAAGTGGCTGACGCTGGAGGTCTGCAGACAGTACCAGAGAGG  74

Query   75  AACATGCTCACGCTCTGATGAAGAATGCAAATTTGCTCATCCCCCCAAAAGTTGTCAGGTTGAAAATGGAAGAG  148
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACGTGCTCACGCTCCGACGAAGAATGCAAGTTTGCTCACCCCCCCAAAAGTTGCCAGGTTGAAAATGGAAGAG  148

Query  149  TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTAAAGGGCCGTTGTTCGAGAGAGAACTGCAAGTATCTTCACCCTCCGACACAC  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTCAAGGGCCGCTGTTCAAGAGAGAACTGCAAATATCTTCATCCTCCGACACAC  222

Query  223  TTAAAAACTCAACTAGAAATTAATGGAAGGAACAATTTGATTCAGCAAAAAACTGCAGCAGCAATGCTTGCCCA  296
            ||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  TTAAAAACCCAGCTAGAGATTAATGGGAGGAACAATTTGATCCAGCAAAAAACTGCAGCAGCGATGCTTGCCCA  296

Query  297  GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACACCACTTCATCCAGTGCCCACTTTCCCTGTAGGTCCCGCGATAGGGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACGCCGCTCCATCCTGTGCCCACTTTTCCTGTAGGTCCCACCATAGGGA  370

Query  371  CAAATACGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACCTAGCACCTGTAACCCCTGGAGTTGGGTTGGTCCCAACGGAAATT  444
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..||
Sbjct  371  CAAATGCGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACTTAGCGCCTGTCACCCCTGGAGTTGGGTTAGTCCCAACAGAGGTT  444

Query  445  CTGCCCACCACGCCTGTTATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT  518
            ||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTACCCACTACACCGGTCATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT  518

Query  519  TCTCAGGACTGACAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACCGACTGCC  592
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  TCTCAGGACTGATAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACAGACTGCC  592

Query  593  GCTTTGCACACCCCGCAGACAGCACCATGATCGACACAAGTGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA  666
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTTTGCACACCCGGCAGACAGCACCATGATCGACACAAACGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA  666

Query  667  AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC  740

Query  741  GCAGCACCAAGCCAACCAAGCTGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGGCCTTTCCCC  814
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  741  GCAGCACCAAGCCAACCAGGCCGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGGCCTTCCCTC  814

Query  815  CTGGTGCTCTTCATCCTTTACCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAATGGTACCAGCGCGGTCTTTAACCCC  888
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||.|||||||.||||||
Sbjct  815  CGGGTGCTCTTCATCCCTTACCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAACGGGGCCAGCACGGTCTTCAACCCC  888

Query  889  AGCGTCTTGCACTACCAGCAGGCTCTCACCAGCGCACAGTTGCAGCAACACGCCGCGTTCATTCCAACAGGGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||.|||.|.||||||||.||.||||    
Sbjct  889  AGCGTCTTGCACTACCAGCAGGCTCTGACCAGTGCGCAGCTGCAGCAGCACACGGCGTTCATCCCCACAG----  958

Query  963  AGTTTTGTGCATGACACCCGCTACCAGTATTGTACCCATG--ATGCACAGCGCTACGTCCGCCACTGTCTCTGC  1034
            |...||.||.|..|..|     |.|||.|.||.|   |||  ||||..|                 |..|||||
Sbjct  959  ATAATTCTGAAATAATC-----AACAGAAATGGA---ATGGAATGCCAA-----------------GAATCTGC  1007

Query 1035  ----AGCAACAACTCCTGCAACA-----AGTGT--------CCCC---TTCGCAGCAACA-----GCCACAGCC  1083
                || ||.||||    .||||     |.|||        ||||   |.|.|..|||.|     ||||||   
Sbjct 1008  ATTGAG-AATAACT----AAACATTGTTACTGTACATATTACCCCGTTTCCTCCTCAATAGAATTGCCACA---  1073

Query 1084  AATCAGATAATTCTGAAA--  1101
            ||          |||.|.  
Sbjct 1074  AA----------CTGCATGC  1083