Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478909
• Subject: XM_017025685.1
• Aligned Length: 2910
• Identities: 2389
• Gaps: 519

Alignment

Query    1  ATGCTGCTGTTCTTTACTTTGGGATTGCTTATACATTTTGTGTTCTTCGCCTCCATCTTTGACATTTATTTTAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCTGTTCTTTACTTTGGGATTGCTTATACATTTTGTGTTCTTCGCCTCCATCTTTGACATTTATTTTAC  74

Query   75  ATCTCCTTTGGTTCATGGAATGACTCCTCAGTTTACACCATTGCCTCCTCCAGCGAGAAGATTAGTGTTGTTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCTCCTTTGGTTCATGGAATGACTCCTCAGTTTACACCATTGCCTCCTCCAGCGAGAAGATTAGTGTTGTTTG  148

Query  149  TTGCTGATGGCCTTCGAGCAGATGCACTTTACGAATTAGATGAAAATGGAAACTCTAGAGCACCGTTTATTAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGCTGATGGCCTTCGAGCAGATGCACTTTACGAATTAGATGAAAATGGAAACTCTAGAGCACCGTTTATTAGG  222

Query  223  AATATCATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGCATATCTCATACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCAGGTCATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATATCATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGCATATCTCATACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCAGGTCATGT  296

Query  297  AGCTCTGATAGCTGGGTTTTATGAAGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAGGAAAATCCTGTAGAGTTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCTCTGATAGCTGGGTTTTATGAAGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAGGAAAATCCTGTAGAGTTTG  370

Query  371  ATTCTCTTTTTAATGAAAGTAAATACACATGGAGCTGGGGAAGCCCAGATATCCTGCCTATGTTTGCCAAAGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCTCTTTTTAATGAAAGTAAATACACATGGAGCTGGGGAAGCCCAGATATCCTGCCTATGTTTGCCAAAGGT  444

Query  445  GCTAGTGGAGACCACGTTTATACATATAGTTATGATGCTAAAAGAGAGGATTTTGGTGCTCAAGATGCAACAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTAGTGGAGACCACGTTTATACATATAGTTATGATGCTAAAAGAGAGGATTTTGGTGCTCAAGATGCAACAAA  518

Query  519  ACTGGATACGTGGGTTTTTGATAATGTTAAGGACTTCTTTCATCATGCCAGAAACAACCAGTCTTTGTTTTCTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTGGATACGTGGGTTTTTGATAATGTTAAGGACTTCTTTCATCATGCCAGAAACAACCAGTCTTTGTTTTCTA  592

Query  593  AAATAAATGAAGAGAAAATAGTTTTTTTCTTACATTTATTAGGAATAGATACAAACGGACATGCTCATCGACCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATAAATGAAGAGAAAATAGTTTTTTTCTTACATTTATTAGGAATAGATACAAACGGACATGCTCATCGACCA  666

Query  667  TCCTCGAGAGACTACAAGGACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTTAAAGAAATCGTGTCTATGTTTAACCA  740
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCTCGAGAGACTACAAGCACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTTAAAGAAATCGTGTCTATGTTTAACCA  740

Query  741  TTTCTATGGAAATGATGGGAAAACAACATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATG  814
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCTATGGAAATGATGGGAAAACAACATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATG  814

Query  815  GGGCTGGTCATCCTTCAGAGACTTTAACTCCTTTAGTCACTTGGGGAGCTGGAATCAAGTATCCCCAAAGAGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCTGGTCATCCTTCAGAGACTTTAACTCCTTTAGTCACTTGGGGAGCTGGAATCAAGTATCCCCAAAGAGTA  888

Query  889  TCAGCTCAGCAATTTGATGATGCATTTTTGAAAGAGTGGAGATTGGAGAATTGGAAGAGGCTAGATGTCAATCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGCTCAGCAATTTGATGATGCATTTTTGAAAGAGTGGAGATTGGAGAATTGGAAGAGGCTAGATGTCAATCA  962

Query  963  GGCTGATATTGCACCATTGATGACTTCCCTTATTGGAGTTCCCTTTCCTCTTAACTCAGTGGGAATCCTTCCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCTGATATTGCACCATTGATGACTTCCCTTATTGGAGTTCCCTTTCCTCTTAACTCAGTGGGAATCCTTCCTG  1036

Query 1037  TGGATTATCTTAACAACACTGATCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACAAATGCAGTACAGATTCTTGAACAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGATTATCTTAACAACACTGATCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACAAATGCAGTACAGATTCTTGAACAG  1110

Query 1111  TTCAAGGTGAAAATGACTCAGAAGAAAGAAGTTACTTTACCATTTTTGTTTACACCATTTAAACTGCTTTCTGA  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 1111  TTCAAGGTGAAAATGACTCAGAAGAAAGAAGTTACTTTACCATTTTTGTTTACACCATTTA-------------  1171

Query 1185  TTCCAAACAGTTCAACATTTTAAGAAAAGCAAGATCTTATATAAAACACAGAAAGTTTGATGAAGTGGTCTCCC  1258
                                                                                      
Sbjct 1172  --------------------------------------------------------------------------  1171

Query 1259  TTTGCAAGGAGCTAATTCATCTTGCATTGAAAGGATTGTCCTATTATCACACATATGACAGATTCTTTTTGGGC  1332
                                                                                      
Sbjct 1172  --------------------------------------------------------------------------  1171

Query 1333  GTCAATGTTGTTATTGGTTTTGTGGGATGGATATCTTATGCCTCTTTGTTGATCATCAAGTCTCATTCCAACCT  1406
                                                                                      
Sbjct 1172  --------------------------------------------------------------------------  1171

Query 1407  TATAAAAGGTGTTAGTAAAGAAGTGAAGAAACCAAGCCATCTCCTGCCTTGTAGTTTTGTAGCTATTGGCATTT  1480
                                                                                      
Sbjct 1172  --------------------------------------------------------------------------  1171

Query 1481  TAGTAGCATTTTTTCTGCTGATTCAAGCCTGTCCCTGGACATATTATGTATATGGTTTGTTGCCACTGCCAATA  1554
                                                                                      
Sbjct 1172  --------------------------------------------------------------------------  1171

Query 1555  TGGTATGCGGTTCTAAGAGAATTTCAAGTTATTCAGGACCTTGTTGTATCAGTGTTGACCTATCCTCTGAGCCA  1628
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  -------------------AATTTCAAGTTATTCAGGACCTTGTTGTATCAGTGTTGACCTATCCTCTGAGCCA  1226

Query 1629  TTTTGTTGGGTACCTGTTAGCCTTTACCCTGGGAATTGAAGTATTAGTTCTCAGTTTTTTCTACCGCTATATGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227  TTTTGTTGGGTACCTGTTAGCCTTTACCCTGGGAATTGAAGTATTAGTTCTCAGTTTTTTCTACCGCTATATGC  1300

Query 1703  TTACCGCTGGACTTACTGCCTTTGCAGCTTGGCCATTTCTCACTCGGCTGTGGACTCGAGCAAAGATGACCTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301  TTACCGCTGGACTTACTGCCTTTGCAGCTTGGCCATTTCTCACTCGGCTGTGGACTCGAGCAAAGATGACCTCA  1374

Query 1777  CTGAGTTGGACTTTCTTCTCTTTGCTCCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCGGTTGTAGGTCGAAAGCCAGACAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375  CTGAGTTGGACTTTCTTCTCTTTGCTCCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCGGTTGTAGGTCGAAAGCCAGACAT  1448

Query 1851  CTCTCTAGTGATGGGTGCAGGCTTGCTGGTTCTTCTGTTATCCCTGTGTGTTGTAACATCTCTCATGAAAAGAA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449  CTCTCTAGTGATGGGTGCAGGCTTGCTGGTTCTTCTGTTATCCCTGTGTGTTGTAACATCTCTCATGAAAAGAA  1522

Query 1925  AAGATAGCTTTATAAAGGAAGAGCTATTGGTACATCTGTTACAGGTGCTGAGCACAGTGCTCTCCATGTATGTT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1523  AAGATAGCTTTATAAAGGAAGAGCTATTGGTACATCTGTTACAGGTGCTGAGCACAGTGCTCTCCATGTATGTT  1596

Query 1999  GTGTATAGCACTCAGAGTAGTCTACTCAGGAAGCAAGGACTGCCTCTCATGAATCAAATTATTAGCTGGGCAAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597  GTGTATAGCACTCAGAGTAGTCTACTCAGGAAGCAAGGACTGCCTCTCATGAATCAAATTATTAGCTGGGCAAC  1670

Query 2073  ATTAGCCTCTTCCTTGGTTGTGCCACTACTGAGTTCTCCAGTTCTCTTTCAGCGATTGTTCAGCATACTTCTTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671  ATTAGCCTCTTCCTTGGTTGTGCCACTACTGAGTTCTCCAGTTCTCTTTCAGCGATTGTTCAGCATACTTCTTT  1744

Query 2147  CATTGATGTCAACCTACCTACTTCTAAGCACAGGGTATGAAGCTCTCTTTCCACTAGTGTTGTCTTGTTTGATG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745  CATTGATGTCAACCTACCTACTTCTAAGCACAGGGTATGAAGCTCTCTTTCCACTAGTGTTGTCTTGTTTGATG  1818

Query 2221  TTTGTCTGGATAAACATAGAACAAGAAACTCTACAACAATCTGGTGTTTGCTGTAAACAAAAGCTCACCAGTAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1819  TTTGTCTGGATAAACATAGAACAAGAAACTCTACAACAATCTGGTGTTTGCTGTAAACAAAAGCTCACCAGTAT  1892

Query 2295  CCAGTTCTCTTATAATACTGATATAACTCAGTTTCGACAGCTATATCTGGATGACATCCGTAGGGCCTTTTTCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893  CCAGTTCTCTTATAATACTGATATAACTCAGTTTCGACAGCTATATCTGGATGACATCCGTAGGGCCTTTTTCC  1966

Query 2369  TTGTTTTCTTCTTAGTGACAGCATTTTTTGGAACTGGAAATATAGCTTCTATTAACAGCTTTGATCTTGCCTCT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967  TTGTTTTCTTCTTAGTGACAGCATTTTTTGGAACTGGAAATATAGCTTCTATTAACAGCTTTGATCTTGCCTCT  2040

Query 2443  GTCTATTGCTTTCTGACTGTGTTCAGTCCTTTTATGATGGGAGCCCTGATGATGTGGAAGATTTTAATCCCCTT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041  GTCTATTGCTTTCTGACTGTGTTCAGTCCTTTTATGATGGGAGCCCTGATGATGTGGAAGATTTTAATCCCCTT  2114

Query 2517  TGTTCTTGTTATGTGTGCTTTTGAAGCAGTTCAGTTGACTACTCAGTTATCGTCAAAAAGCCTTTTTCTCATTG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115  TGTTCTTGTTATGTGTGCTTTTGAAGCAGTTCAGTTGACTACTCAGTTATCGTCAAAAAGCCTTTTTCTCATTG  2188

Query 2591  TTCTCGTCATATCAGACATTATGGCTTTGCATTTTTTCTTCTTGGTCAAGGATTATGGCAGCTGGCTTGATATT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2189  TTCTCGTCATATCAGACATTATGGCTTTGCATTTTTTCTTCTTGGTCAAGGATTATGGCAGCTGGCTTGATATT  2262

Query 2665  GGGACAA-------------------------------------------------------------------  2671
            |||||||                                                                   
Sbjct 2263  GGGACAAGGCAACTCCTGGCATGTACTGCCTGGTTATTTATGTACATATCTGCCTCTCCCAATAGACTGTGGAT  2336

Query 2672  --------------------------------------------------GCATCAGCCACTATGTGATTGTCA  2695
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337  GCTCTCAGATCCAGGATTGGATTTGAATCTCTTACATGCCATACGTGCTTGCATCAGCCACTATGTGATTGTCA  2410

Query 2696  TGTCCATGACCATCTTTTTGGTGTTCCTCAATGGCCTGGCCCAGCTGCTCACAACGAAGAAACTCAGACTATGT  2769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2411  TGTCCATGACCATCTTTTTGGTGTTCCTCAATGGCCTGGCCCAGCTGCTCACAACGAAGAAACTCAGACTATGT  2484

Query 2770  GGCAAACCCAAAAGTCACTTCATG  2793
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2485  GGCAAACCCAAAAGTCACTTCATG  2508