Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478909
• Subject: XM_017321076.1
• Aligned Length: 2798
• Identities: 2419
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGCTGCTGTTCTTTACTTTGGGATTGCTTATACATTTTGTGTTCTTCGCCTCCATCTTTGACATTTATTTTAC  74
            |||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCTGTTTTTTGCTTTGGGATTGCTTATCCATTTTGTGTTCTTCGCTTCCATCTTTGACATTTATTTTAC  74

Query   75  ATCTCCTTTGGTTCATGGAATGACTCCTCAGTTTACACCATTGCCTCCTCCAGCGAGAAGATTAGTGTTGTTTG  148
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||.|.||||
Sbjct   75  ATCTCCTTTGGTTCATGGAATGACTCCCCAGTTTACACCTTTGCCTCCTCCAGCAAAAAGATTAGTGCTATTTG  148

Query  149  TTGCTGATGGCCTTCGAGCAGATGCACTTTACGAATTAGATGAAAATGGAAACTCTAGAGCACCGTTTATTAGG  222
            |||||||||||||..||||||||.|.|||||.||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct  149  TTGCTGATGGCCTGAGAGCAGATACTCTTTATGAATTAGATGAAGATGGAAACTCCAGAGCACCTTTCATTAGG  222

Query  223  AATATCATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGCATATCTCATACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCAGGTCATGT  296
            |||.|.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  AATGTTATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGAGTATCTCACACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCTGGCCATGT  296

Query  297  AGCTCTGATAGCTGGGTTTTATGAAGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAGGAAAATCCTGTAGAGTTTG  370
            |||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  297  AGCCTTGATAGCTGGATTTTATGAGGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAAGAAAATCCTGTAGAATTTG  370

Query  371  ATTCTCTTTTTAATGAAAGTAAATACACATGGAGCTGGGGAAGCCCAGATATCCTGCCTATGTTTGCCAAAGGT  444
            |.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  ACTCTCTTTTTAATGAAAGCAAGTACACGTGGAGCTGGGGGAGTCCAGATATCTTGCCCATGTTTGCCAAAGGT  444

Query  445  GCTAGTGGAGACCACGTTTATACATATAGTTATGATGCTAAAAGAGAGGATTTTGGTGCTCAAGATGCAACAAA  518
            ||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  445  GCTAGTGGTGACCATGTCTATACATATAGTTACGATGCTCAAAGAGAAGATTTTGGTGCCCACGATGCCACAAA  518

Query  519  ACTGGATACGTGGGTTTTTGATAATGTTAAGGACTTCTTTCATCATGCCAGAAACAACCAGTCTTTGTTTTCTA  592
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||..|||.|||||||||||.||||||||..|.|
Sbjct  519  ACTGGATACGTGGGTTTTTGATAAAGTTAAGGACTTCTTTGATGCTGCAAGAAACAACCAATCTTTGTTCACAA  592

Query  593  AAATAAATGAAGAGAAAATAGTTTTTTTCTTACATTTATTAGGAATAGATACAAACGGACATGCTCATCGACCA  666
            ||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGTAAATGAAGAAAAAGTAGTTTTTTTCTTACATTTATTGGGAATAGATACAAATGGACATGCTCATCGACCA  666

Query  667  TCCTCGAGAGACTACAAGGACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTTAAAGAAATCGTGTCTATGTTTAACCA  740
            ||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||
Sbjct  667  TCGTCAAGGGAATATAAGGACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTGAAGGAAATCGTATCAATTTTCAAGCA  740

Query  741  TTTCTATGGAAATGATGGGAAAACAACATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATG  814
            |||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTTTATGGAGATGATGGGAAAACAGCATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATG  814

Query  815  GGGCTGGTCATCCTTCAGAGACTTTAACTCCTTTAGTCACTTGGGGAGCTGGAATCAAGTATCCCCAAAGAGTA  888
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|.|||.||||..|||
Sbjct  815  GGGCTGGTCATCCGTCAGAGACTTTAACTCCGTTCGTTACTTGGGGAGCTGGAATCAAATTTCCTCAAAATGTA  888

Query  889  TCAGCTCAGCAATTTGATGATGCATTTTTGAAAGAGTGGAGATTGGAGAATTGGAAGAGGCTAGATGTCAATCA  962
            |||||||||||||.||||||||..|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||..||||||||||||
Sbjct  889  TCAGCTCAGCAATATGATGATGAGTTTTTAAAAGAATGGAGATTGGAAAACTGGAAAAGGAGAGATGTCAATCA  962

Query  963  GGCTGATATTGCACCATTGATGACTTCCCTTATTGGAGTTCCCTTTCCTCTTAACTCAGTGGGAATCCTTCCTG  1036
            |||||||||||||||..|||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  GGCTGATATTGCACCTCTGATGGCATCCCTTATTGGAGTCCCCTTTCCTCTTAATTCGGTGGGAATACTTCCTG  1036

Query 1037  TGGATTATCTTAACAACACTGATCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACAAATGCAGTACAGATTCTTGAACAG  1110
            |||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGGTTATCTTAACAACACTGGTCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACCAATGCAGTACAGATTCTTGAACAG  1110

Query 1111  TTCAAGGTGAAAATGACTCAGAAGAAAGAAGTTACTTTACCATTTTTGTTTACACCATTTAAACTGCTTTCTGA  1184
            |||||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1111  TTCAAGGTGAAAATGACTCAGAAAAAAGAAGCCACTTTACCGTTTTTGTTTACACCATTTAAGTTGCTTTCTGA  1184

Query 1185  TTCCAAACAGTTCAACATTTTAAGAAAAGCAAGATCTTATATAAAACACAG-AAAGTTTGATGAAGTGGTCTCC  1257
            |||..||||..|..|||||||||||||||||||||||||.|||||||| || |||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1185  TTCTCAACAACTGGACATTTTAAGAAAAGCAAGATCTTACATAAAACA-AGAAAAATTTGATGAAGTAGTGTCC  1257

Query 1258  CTTTGCAAGGAGCTAATTCATCTTGCATTGAAAGGATTGTCCTATTATCACACATATGACAGATTCTTTTTGGG  1331
            ||.||..|||||||.|||.|.||.||..|||.||||||||||||||||||.||.|||||||||.|.|||.||||
Sbjct 1258  CTCTGTGAGGAGCTGATTGACCTCGCCCTGAGAGGATTGTCCTATTATCATACTTATGACAGACTGTTTCTGGG  1331

Query 1332  CGTCAATGTTGTTATTGGTTTTGTGGGATGGATATCTTATGCCTCTTTGTTGATCATCAAGTCTCATTCCAACC  1405
            |.|||||||||...|||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.||  
Sbjct 1332  CATCAATGTTGCAGTTGGTTTTGTGGGATGGATGTCTTATACTTCTTTGTTAATCATCAAGTCGCATTCTAA--  1403

Query 1406  TTAT---AAAAGGTGTTAGTAAAGAAGTGAAGAAACCAAGCCATCTCCTGCCTTGTAGTTTTGTAGCTATTGGC  1476
             |||   ||||||...|||.||.||||..|||||.|||..|..||||||||.||.|||.||..||||||.|||.
Sbjct 1404  -TATCCCAAAAGGCACTAGGAAGGAAGGTAAGAAGCCACACTGTCTCCTGCTTTATAGCTTCATAGCTACTGGT  1476

Query 1477  ATTTTAGTAGCATTTTTTCTGCTGATTCAAGCCTGTCCCTGGACATATTATGTATATGGTTTGTTGCCACTGCC  1550
            .|.||||||||||..||.|||.||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||..|.|||.|||||.||||
Sbjct 1477  GTCTTAGTAGCATGCTTCCTGATGATCCAAGCCTGTCCCTGGACTTACTATGTGTACTGCTTGCTGCCAGTGCC  1550

Query 1551  AATATGGTATGCGGTTCTAAGAGAATTTCAAGTTATTCAGGACCTTGTTGTATCAGTGTTGACCTATCCTCTGA  1624
            .|||||||||||.||||||||||||..|.||||||||||.|||||.||||.||||.|.|||||.|.|||||.||
Sbjct 1551  TATATGGTATGCAGTTCTAAGAGAACATGAAGTTATTCAAGACCTGGTTGAATCACTATTGACTTTTCCTCGGA  1624

Query 1625  GCCATTTTGTTGGGTACCTGTTAGCCTTTACCCTGGGAATTGAAGTATTAGTTCTCAGTTTTTTCTACCGCTAT  1698
            ||||||||||||..|||.||.|.|.|||||||.||||.|||||||||.|.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1625  GCCATTTTGTTGCCTACTTGCTTGTCTTTACCTTGGGTATTGAAGTACTGGTGCTCAGTTTCTTCTACCGCTAC  1698

Query 1699  ATGCTTACCGCTGGACTTACTGCCTTTGCAGCTTGGCCATTTCTCACTCGGCTGTGGACTCGAGCAAAGATGAC  1772
            |||.|.||.||.|||||.|.||..|||||||..|||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1699  ATGTTGACAGCGGGACTGATTGTGTTTGCAGGCTGGCCGTTTCTCACTCAGCTGTGGACCCGAGCAAAGATCAC  1772

Query 1773  CTCACTGAGTTGGACTTTCTTCTCTTTGCTCCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCGGTTGTAGGTCGAAAGCCAG  1846
            ||..|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||||||.
Sbjct 1773  CTTCCTGAGTTGGGCTTTCTTCTCTTTGCTTCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCTGTCGTGGGTAGAAAGCCAA  1846

Query 1847  ACATCTCTCTAGTGATGGGTGCAGGCTTGCTGGTTCTTCTGTTATCCCTGTGTGTTGTAACATCTCTCATGAAA  1920
            ||.|.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|.||.|||..||||||||||.|||||...|||
Sbjct 1847  ACCTTTCTCTAGTAATGGGTGCTGGATTCCTGGTTCTTCTGCTGTCGCTGGCTGTTGTAACAACTCTCGGAAAA  1920

Query 1921  AGAAAAGATAGCTTTATAAAGGAAGAGCTATTGGTACATCTGTTACAGGTGCTGAGCACAGTGCTCTCCATGTA  1994
            |||||...||..||..||||||..|||||.|||||||.||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1921  AGAAACATTAAATTGGTAAAGGGCGAGCTGTTGGTACTTCTGTTACAGATGCTGAGTACAGTGCTCTCTATGTA  1994

Query 1995  TGTTGTGTATAGCACTCAGAGTAGTCTACTCAGGAAGCAAGGACTGCCTCTCATGAATCAAATTATTAGCTGGG  2068
            |||.|||||||||||.||....|||||..|.|.|||..||||.||||||||.||||||||.|||.|.|||||||
Sbjct 1995  TGTGGTGTATAGCACCCACCACAGTCTGTTAAAGAAAGAAGGCCTGCCTCTTATGAATCAGATTGTGAGCTGGG  2068

Query 2069  CAACATTAGCCTCTTCCTTGGTTGTGCCACTACTGAGTTCTCCAGTTCTCTTTCAGCGATTGTTCAGCATACTT  2142
            ||||||||||||||||..||||.|..|||||.|||||.||..|||.|||||.|||||||.||..|||||||||.
Sbjct 2069  CAACATTAGCCTCTTCTCTGGTGGCACCACTCCTGAGCTCCACAGCTCTCTCTCAGCGACTGGCCAGCATACTC  2142

Query 2143  CTTTCATTGATGTCAACCTACCTACTTCTAAGCACAGGGTATGAAGCTCTCTTTCCACTAGTGTTGTCTTGTTT  2216
            ||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||.||||.|||||
Sbjct 2143  CTCTCCTTGATGTCCACCTACCTGCTCCTAAGCACTGGGTATGAAGCTCTCTTTCCTTTAGTGCTGTCCTGTTT  2216

Query 2217  GATGTTTGTCTGGATAAACATAGAACAAGAAACTCTACAACAATCTGGTGTTTGCTGTAAACAAAAGCTCACCA  2290
            |||||||||||||||..|..|.||||||||.||.||.|||||..|||||||||..||||||||.||||||||||
Sbjct 2217  GATGTTTGTCTGGATCCAAGTGGAACAAGAGACCCTTCAACAGCCTGGTGTTTCTTGTAAACAGAAGCTCACCA  2290

Query 2291  GTATCCAGTTCTCTTATAATACTGATATAACTCAGTTTCGACAGCTATATCTGGATGACATCCGTAGGGCCTTT  2364
            |.|||||||||.|.|.|.|.|||||||||.|||||||.||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291  GCATCCAGTTCACCTGTGACACTGATATAGCTCAGTTCCGACAGCTCTGTCCGGATGACATCCGTAGGGCCTTT  2364

Query 2365  TTCCTTGTTTTCTTCTTAGTGACAGCATTTTTTGGAACTGGAAATATAGCTTCTATTAACAGCTTTGATCTTGC  2438
            |||||.||||||||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2365  TTCCTAGTTTTCTTTTTATTAACTGCATTTTTTGGAACTGGAAATATAGCTTCTATTAACAGCTTCGACCTTGC  2438

Query 2439  CTCTGTCTATTGCTTTCTGACTGTGTTCAGTCCTTTTATGATGGGAGCCCTGATGATGTGGAAGATTTTAATCC  2512
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2439  CTCTGTGTATTGCTTTCTGACTGTGTTTAGTCCTTTCATGATGGGAGCGCTCATGATGTGGAAGATTTTAATTC  2512

Query 2513  CCTTTGTTCTTGTTATGTGTGCTTTTGAAGCAGTTCAGTTGACTACTCAGTTATCGTCAAAAAGCCTTTTTCTC  2586
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.|.||.||||||.|.||||||||.
Sbjct 2513  CTTTTGTTCTTGTGATGTGTGCTTTTGAAGCAGTTCAGATAACTACACAGCTGTCCTCAAAAGGTCTTTTTCTT  2586

Query 2587  ATTGTTCTCGTCATATCAGACATTATGGCTTTGCATTTTTTCTTCTTGGTCAAGGATTATGGCAGCTGGCTTGA  2660
            .||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2587  GTTGTTCTCATCATATCAGACATCATGGCTTTGCATTTTTTCTTCCTGGTCAAGGATTCTGGCAGCTGGCTTGA  2660

Query 2661  TATTGGGACAAGCATCAGCCACTATGTGATTGTCATGTCCATGACCATCTTTTTGGTGTTCCTCAATGGCCTGG  2734
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.||.||||||||||
Sbjct 2661  TATTGGAACAAGCATCAGCCACTATGTGATTGTCATGTCCATGACCATCTTCCTGGTATTTCTTAATGGCCTGG  2734

Query 2735  CCCAGCTGCTCACAACGAAGAAACTCAGACTATGTGGCAAACCCAAAAGTCA-CTTCATG  2793
            |.||..||||||||||.|||||||||..|||.|||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 2735  CACAATTGCTCACAACAAAGAAACTCCAACTGTGTGGCAAACCCAAAAGTCATCTT-ATG  2793