Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000478909
Subject:
XR_387174.3
Aligned Length:
3358
Identities:
2309
Gaps:
693

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GACCTGGCCAGAGAGTTATCGCGAGAGCAGCGAAGGCCTGGGGCAGGTTGGGGGCGTTCCCTGGAGCAGTAGAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTGGAGGTCGCTGAGGGGTACGATTTGGCTGTGGTTTTTGAGGGTTGAAGGGAACCCTCCCGACATCTTTCACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCCCTGGGTCCTGCCTTCGTTCTGAGGAGGTCCCGTTCCCAAGACTGGGCCTGAGCCGGATAGTTCTCAGTGAC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TCCTGTAAAAAGGTCGTCTTACCCCACAAAGAAATCATGACCCACAAGTTGAGAACTGCTGACTTAGAAGGACA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TTCTCCATCCTTATGATAGTTAATTCTTCAGACCAGGAAGAATAAGATATGTCCATAATTCTTATCTTTCATAT  370

Query    1  ----------------------------------------------------------------------ATGC  4
                                                                                  ||||
Sbjct  371  TTTCAAGATCAAGGTCATTATTTGTATCAAATACTGCTTCAACTTCTCTTGCAGGTAGCCCAGTGTGGATATGC  444

Query    5  TGCTGTTCTTTACTTTGGGATTGCTTATACATTTTGTGTTCTTCGCCTCCATCTTTGACATTTATTTTACATCT  78
            |||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCTGTTTTTTGCTTTGGGATTGCTTATCCATTTTGTGTTCTTCGCTTCCATCTTTGACATTTATTTTACATCT  518

Query   79  CCTTTGGTTCATGGAATGACTCCTCAGTTTACACCATTGCCTCCTCCAGCGAGAAGATTAGTGTTGTTTGTTGC  152
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||.|.||||||||
Sbjct  519  CCTTTGGTTCATGGAATGACTCCCCAGTTTACACCTTTGCCTCCTCCAGCAAAAAGATTAGTGCTATTTGTTGC  592

Query  153  TGATGGCCTTCGAGCAGATGCACTTTACGAATTAGATGAAAATGGAAACTCTAGAGCACCGTTTATTAGGAATA  226
            |||||||||..||||||||.|.|||||.||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||||||.
Sbjct  593  TGATGGCCTGAGAGCAGATACTCTTTATGAATTAGATGAAGATGGAAACTCCAGAGCACCTTTCATTAGGAATG  666

Query  227  TCATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGCATATCTCATACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCAGGTCATGTAGCT  300
            |.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  667  TTATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGAGTATCTCACACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCTGGCCATGTAGCC  740

Query  301  CTGATAGCTGGGTTTTATGAAGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAGGAAAATCCTGTAGAGTTTGATTC  374
            .||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  741  TTGATAGCTGGATTTTATGAGGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAAGAAAATCCTGTAGAATTTGACTC  814

Query  375  TCTTTTTAATGAAAGTAAATACACATGGAGCTGGGGAAGCCCAGATATCCTGCCTATGTTTGCCAAAGGTGCTA  448
            |||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTTTTTAATGAAAGCAAGTACACGTGGAGCTGGGGGAGTCCAGATATCTTGCCCATGTTTGCCAAAGGTGCTA  888

Query  449  GTGGAGACCACGTTTATACATATAGTTATGATGCTAAAAGAGAGGATTTTGGTGCTCAAGATGCAACAAAACTG  522
            ||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  889  GTGGTGACCATGTCTATACATATAGTTACGATGCTCAAAGAGAAGATTTTGGTGCCCACGATGCCACAAAACTG  962

Query  523  GATACGTGGGTTTTTGATAATGTTAAGGACTTCTTTCATCATGCCAGAAACAACCAGTCTTTGTTTTCTAAAAT  596
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||..|||.|||||||||||.||||||||..|.|||.|
Sbjct  963  GATACGTGGGTTTTTGATAAAGTTAAGGACTTCTTTGATGCTGCAAGAAACAACCAATCTTTGTTCACAAAAGT  1036

Query  597  AAATGAAGAGAAAATAGTTTTTTTCTTACATTTATTAGGAATAGATACAAACGGACATGCTCATCGACCATCCT  670
            |||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1037  AAATGAAGAAAAAGTAGTTTTTTTCTTACATTTATTGGGAATAGATACAAATGGACATGCTCATCGACCATCGT  1110

Query  671  CGAGAGACTACAAGGACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTTAAAGAAATCGTGTCTATGTTTAACCATTTC  744
            |.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||.
Sbjct 1111  CAAGGGAATATAAGGACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTGAAGGAAATCGTATCAATTTTCAAGCATTTT  1184

Query  745  TATGGAAATGATGGGAAAACAACATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATGGGGC  818
            ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATGGAGATGATGGGAAAACAGCATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATGGGGC  1258

Query  819  TGGTCATCCTTCAGAGACTTTAACTCCTTTAGTCACTTGGGGAGCTGGAATCAAGTATCCCCAAAGAGTATCAG  892
            |||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|.|||.||||..|||||||
Sbjct 1259  TGGTCATCCGTCAGAGACTTTAACTCCGTTCGTTACTTGGGGAGCTGGAATCAAATTTCCTCAAAATGTATCAG  1332

Query  893  CTCAGCAATTTGATGATGCATTTTTGAAAGAGTGGAGATTGGAGAATTGGAAGAGGCTAGATGTCAATCAGGCT  966
            |||||||||.||||||||..|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||..||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCAGCAATATGATGATGAGTTTTTAAAAGAATGGAGATTGGAAAACTGGAAAAGGAGAGATGTCAATCAGGCT  1406

Query  967  GATATTGCACCATTGATGACTTCCCTTATTGGAGTTCCCTTTCCTCTTAACTCAGTGGGAATCCTTCCTGTGGA  1040
            |||||||||||..|||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||.
Sbjct 1407  GATATTGCACCTCTGATGGCATCCCTTATTGGAGTCCCCTTTCCTCTTAATTCGGTGGGAATACTTCCTGTGGG  1480

Query 1041  TTATCTTAACAACACTGATCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACAAATGCAGTACAGATTCTTGAACAGTTCA  1114
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTATCTTAACAACACTGGTCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACCAATGCAGTACAGATTCTTGAACAGTTCA  1554

Query 1115  AGGTGAAAATGACTCAGAAGAAAGAAGTTACTTTACCATTTTTGTTTACACCATTTAAACTGCTTTCTGATTCC  1188
            |||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||.
Sbjct 1555  AGGTGAAAATGACTCAGAAAAAAGAAGCCACTTTACCGTTTTTGTTTACACCATTTAAGTTGCTTTCTGATTCT  1628

Query 1189  AAACAGTTCAACATTTTAAGAAAAGCAAGATCTTATATAAAACACAG-AAAGTTTGATGAAGTGGTCTCCCTTT  1261
            .||||..|..|||||||||||||||||||||||||.|||||||| || |||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1629  CAACAACTGGACATTTTAAGAAAAGCAAGATCTTACATAAAACA-AGAAAAATTTGATGAAGTAGTGTCCCTCT  1701

Query 1262  GCAAGGAGCTAATTCATCTTGCATTGAAAGGATTGTCCTATTATCACACATATGACAGATTCTTTTTGGGCGTC  1335
            |..|||||||.|||.|.||.||..|||.||||||||||||||||||.||.|||||||||.|.|||.|||||.||
Sbjct 1702  GTGAGGAGCTGATTGACCTCGCCCTGAGAGGATTGTCCTATTATCATACTTATGACAGACTGTTTCTGGGCATC  1775

Query 1336  AATGTTGTTATTGGTTTTGTGGGATGGATATCTTATGCCTCTTTGTTGATCATCAAGTCTCATTCCAACCTTAT  1409
            |||||||...|||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.||   |||
Sbjct 1776  AATGTTGCAGTTGGTTTTGTGGGATGGATGTCTTATACTTCTTTGTTAATCATCAAGTCGCATTCTAA---TAT  1846

Query 1410  ---AAAAGGTGTTAGTAAAGAAGTGAAGAAACCAAGCCATCTCCTGCCTTGTAGTTTTGTAGCTATTGGCATTT  1480
               ||||||...|||.||.||||..|||||.|||..|..||||||||.||.|||.||..||||||.|||..|.|
Sbjct 1847  CCCAAAAGGCACTAGGAAGGAAGGTAAGAAGCCACACTGTCTCCTGCTTTATAGCTTCATAGCTACTGGTGTCT  1920

Query 1481  TAGTAGCATTTTTTCTGCTGATTCAAGCCTGTCCCTGGACATATTATGTATATGGTTTGTTGCCACTGCCAATA  1554
            |||||||||..||.|||.||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||..|.|||.|||||.||||.|||
Sbjct 1921  TAGTAGCATGCTTCCTGATGATCCAAGCCTGTCCCTGGACTTACTATGTGTACTGCTTGCTGCCAGTGCCTATA  1994

Query 1555  TGGTATGCGGTTCTAAGAGAATTTCAAGTTATTCAGGACCTTGTTGTATCAGTGTTGACCTATCCTCTGAGCCA  1628
            ||||||||.||||||||||||..|.||||||||||.|||||.||||.||||.|.|||||.|.|||||.||||||
Sbjct 1995  TGGTATGCAGTTCTAAGAGAACATGAAGTTATTCAAGACCTGGTTGAATCACTATTGACTTTTCCTCGGAGCCA  2068

Query 1629  TTTTGTTGGGTACCTGTTAGCCTTTACCCTGGGAATTGAAGTATTAGTTCTCAGTTTTTTCTACCGCTATATGC  1702
            ||||||||..|||.||.|.|.|||||||.||||.|||||||||.|.||.||||||||.|||||||||||.|||.
Sbjct 2069  TTTTGTTGCCTACTTGCTTGTCTTTACCTTGGGTATTGAAGTACTGGTGCTCAGTTTCTTCTACCGCTACATGT  2142

Query 1703  TTACCGCTGGACTTACTGCCTTTGCAGCTTGGCCATTTCTCACTCGGCTGTGGACTCGAGCAAAGATGACCTCA  1776
            |.||.||.|||||.|.||..|||||||..|||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||||..
Sbjct 2143  TGACAGCGGGACTGATTGTGTTTGCAGGCTGGCCGTTTCTCACTCAGCTGTGGACCCGAGCAAAGATCACCTTC  2216

Query 1777  CTGAGTTGGACTTTCTTCTCTTTGCTCCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCGGTTGTAGGTCGAAAGCCAGACAT  1850
            |||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||||||.||.|
Sbjct 2217  CTGAGTTGGGCTTTCTTCTCTTTGCTTCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCTGTCGTGGGTAGAAAGCCAAACCT  2290

Query 1851  CTCTCTAGTGATGGGTGCAGGCTTGCTGGTTCTTCTGTTATCCCTGTGTGTTGTAACATCTCTCATGAAAAGAA  1924
            .||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|.||.|||..||||||||||.|||||...|||||||
Sbjct 2291  TTCTCTAGTAATGGGTGCTGGATTCCTGGTTCTTCTGCTGTCGCTGGCTGTTGTAACAACTCTCGGAAAAAGAA  2364

Query 1925  AAGATAGCTTTATAAAGGAAGAGCTATTGGTACATCTGTTACAGGTGCTGAGCACAGTGCTCTCCATGTATGTT  1998
            |...||..||..||||||..|||||.|||||||.||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 2365  ACATTAAATTGGTAAAGGGCGAGCTGTTGGTACTTCTGTTACAGATGCTGAGTACAGTGCTCTCTATGTATGTG  2438

Query 1999  GTGTATAGCACTCAGAGTAGTCTACTCAGGAAGCAAGGACTGCCTCTCATGAATCAAATTATTAGCTGGGCAAC  2072
            |||||||||||.||....|||||..|.|.|||..||||.||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||
Sbjct 2439  GTGTATAGCACCCACCACAGTCTGTTAAAGAAAGAAGGCCTGCCTCTTATGAATCAGATTGTGAGCTGGGCAAC  2512

Query 2073  ATTAGCCTCTTCCTTGGTTGTGCCACTACTGAGTTCTCCAGTTCTCTTTCAGCGATTGTTCAGCATACTTCTTT  2146
            ||||||||||||..||||.|..|||||.|||||.||..|||.|||||.|||||||.||..|||||||||.||.|
Sbjct 2513  ATTAGCCTCTTCTCTGGTGGCACCACTCCTGAGCTCCACAGCTCTCTCTCAGCGACTGGCCAGCATACTCCTCT  2586

Query 2147  CATTGATGTCAACCTACCTACTTCTAAGCACAGGGTATGAAGCTCTCTTTCCACTAGTGTTGTCTTGTTTGATG  2220
            |.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||.||||.|||||||||
Sbjct 2587  CCTTGATGTCCACCTACCTGCTCCTAAGCACTGGGTATGAAGCTCTCTTTCCTTTAGTGCTGTCCTGTTTGATG  2660

Query 2221  TTTGTCTGGATAAACATAGAACAAGAAACTCTACAACAATCTGGTGTTTGCTGTAAACAAAAGCTCACCAGTAT  2294
            |||||||||||..|..|.||||||||.||.||.|||||..|||||||||..||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2661  TTTGTCTGGATCCAAGTGGAACAAGAGACCCTTCAACAGCCTGGTGTTTCTTGTAAACAGAAGCTCACCAGCAT  2734

Query 2295  CCAGTTCTCTTATAATACTGATATAACTCAGTTTCGACAGCTATATCTGGATGACATCCGTAGGGCCTTTTTCC  2368
            |||||||.|.|.|.|.|||||||||.|||||||.||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2735  CCAGTTCACCTGTGACACTGATATAGCTCAGTTCCGACAGCTCTGTCCGGATGACATCCGTAGGGCCTTTTTCC  2808

Query 2369  TTGTTTTCTTCTTAGTGACAGCATTTTTTGGAACTGGAAATATAGCTTCTATTAACAGCTTTGATCTTGCCTCT  2442
            |.||||||||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2809  TAGTTTTCTTTTTATTAACTGCATTTTTTGGAACTGGAAATATAGCTTCTATTAACAGCTTCGACCTTGCCTCT  2882

Query 2443  GTCTATTGCTTTCTGACTGTGTTCAGTCCTTTTATGATGGGAGCCCTGATGATGTGGAAGATTTTAATCCCCTT  2516
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2883  GTGTATTGCTTTCTGACTGTGTTTAGTCCTTTCATGATGGGAGCGCTCATGATGTGGAAGATTTTAATTCCTTT  2956

Query 2517  TGTTCTTGTTATGTGTGCTTTTGAAGCAGTTCAGTTGACTACTCAGTTATCGTCAAAA----------------  2574
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.|.||.||||||                
Sbjct 2957  TGTTCTTGTGATGTGTGCTTTTGAAGCAGTTCAGATAACTACACAGCTGTCCTCAAAAGGCCCACAGGGAACAG  3030

Query 2575  --------------------------------------------------------------------------  2574
                                                                                      
Sbjct 3031  GTTACATTCGTTTAAGAAATGGTGTATGTATTAAGATGATCTGTCCATGAAGTCATTCATCAACTGTTTCAATT  3104

Query 2575  -------------------------------AGCCTTTTTCTCATTGTTCTCGTCATATCAGACATTATGGCTT  2617
                                           ||.||||||||..||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 3105  AACAATGGCTCTGCTTGGAGACACAGACATTAGTCTTTTTCTTGTTGTTCTCATCATATCAGACATCATGGCTT  3178

Query 2618  TGCATTTTTTCTTCTTGGTCAAGGATTATGGCAGCTGGCTTGATATTGGGACAAGCATCAGCCACTATGTGATT  2691
            ||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||                      
Sbjct 3179  TGCATTTTTTCTTCCTGGTCAAGGATTCTGGCAGCTGGCTTGATATTGGAAC----------------------  3230

Query 2692  GTCATGTCCATGACCATCTTTTTGGTGTTCCTCAATGGCCTGGCCCAGCTGCTCACAACGAAGAAACTCAGACT  2765
                                                                                      
Sbjct 3231  --------------------------------------------------------------------------  3230

Query 2766  ATGTGGCAAACCCAAAAGTCACTTCATG  2793
                                        
Sbjct 3231  ----------------------------  3230