Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479002
- Subject:
- XM_011249276.2
- Aligned Length:
- 1354
- Identities:
- 1214
- Gaps:
- 59
Alignment
Query 1 ATGAGGCGACGAAGGAGGCGGGACGGCTTTTACCCAGCCCCGGACTTCCGAGACAGGGAAGCTGAGGACATGGC 74
||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGCGACGACGGAGGCGGGACGGCTTTTACCTAGCGCCTGACTTCCGACACAGGGAAGCTGAGGACATGGC 74
Query 75 AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAGGACGCGGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAAGATGCAGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT 148
Query 149 TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC 222
Query 223 TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA 296
Query 297 AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAAATATTTGCCATGAAGG 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAGATATTTGCCATGAAGG 370
Query 371 TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTAAGAAATGCTAAAGATACAGCTCATACAAAAGCAGAACGGAATATTCTGGAG 444
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 371 TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTGAGGAATGCTAAGGACACGGCCCACACGAAAGCAGAGCGGAACATTCTGGAG 444
Query 445 GAAGTAAAGCATCCCTTCATCGTGGATTTAATTTATGCCTTTCAGACTGGTGGAAAACTCTACCTCATCCTTGA 518
|||||.||.||.||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 445 GAAGTGAAACACCCTTTCATTGTGGACCTGATTTATGCCTTTCAGACCGGAGGAAAGCTCTACCTCATCCTCGA 518
Query 519 GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTTATGGAAGACACTGCCTGCTTTT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 519 GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTCATGGAAGACACAGCGTGCTTTT 592
Query 593 ACTTGGCAGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAGGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG 666
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTTGGCTGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAAGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG 666
Query 667 AATATCATGCTTAATCACCAAGGTCATGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG 740
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACATCATGCTTAATCACCAAGGTCACGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG 740
Query 741 AACAGTCACACACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTGATGAGAAGTGGCCACAATC 814
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 741 AACAGTCACGCACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTAATGAGAAGCGGCCACAACC 814
Query 815 GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCCCCATTCACTGGGGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCTCCATTCACTGGGGAG 888
Query 889 AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTCAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCCAG 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 889 AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTTAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCTCG 962
Query 963 AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTGGGAGCTGGTCCTGGGGACGCTGGAGAAG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 963 AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTTGGAGCTGGCCCTGGGGATGCTGGAGAAG 1036
Query 1037 TTCAAGCTCATCCATTCTTTAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGAAAGGTGGAGCCCCCCTTTAAA 1110
|.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1037 TCCAAGCTCATCCTTTTTTCAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGGAAGGTGGAACCTCCCTTTAAG 1110
Query 1111 CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTAAGTCAGTTTGATTCCAAGTTTACACGTCAGACACCTGTCGACAGCCC 1184
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTGAGTCAGTTTGATTCAAAGTTTACACGTCAGACACCTGTTGACAGCCC 1184
Query 1185 AGATGACTCAACTCTCAGTGAAAGTGCCAATCAGGTCTTTCTGGGTTTTACATATGTGGCTCCA-TCTGTACTT 1257
.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||| ||....|||| ||| ||.
Sbjct 1185 TGATGACTCCACTCTCAGTGAAAGTGCCAACCAGGTCTTTCTGG----------TGCAAGTCCAGTCT---CTC 1245
Query 1258 GAAAGTGTGAAAGAAAAGTTTTCCTTTGAACCAAAAATCCGATCACCTCGAAGATTTATTGGCAGCCCACGAAC 1331
.|| |.||.|| ||| |.||||| ||.| .|||||..||.|||
Sbjct 1246 CAA------ACAGCAA-----TCC-----AGCAAAA-------CAGC-------------AGCAGCAGACCAAC 1283
Query 1332 ACCTGTCAGTACTGCTATGTGC 1353
| ..||||.| .|||
Sbjct 1284 A--ATTCAGCA----AATG--- 1296