Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479026
• Subject: XM_011521305.3
• Aligned Length: 1743
• Identities: 1740
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGATATTATAAAGGGAAACCTAGATGGAATTTCAAAACCAGCTTCAAATTCAAGAATACGCCCTGGGAGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATATTATAAAGGGAAACCTAGATGGAATTTCAAAACCAGCTTCAAATTCAAGAATACGCCCTGGGAGCAG  74

Query   75  AAGTTCAAATGCTTCTTTGGAGGTGCTCTCAACAGAACCAGGATCCTTCAAGGTCGATACTGCAAGCAACTTGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGTTCAAATGCTTCTTTGGAGGTGCTCTCAACAGAACCAGGATCCTTCAAGGTCGATACTGCAAGCAACTTGA  148

Query  149  ACTCTGGTAAAGAGGACCACTCCGAAAGCAGTAATACAGAGAACAGAAGAACTAGTAATGATGATAAGCAGGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTCTGGTAAAGAGGACCACTCCGAAAGCAGTAATACAGAGAACAGAAGAACTAGTAATGATGATAAGCAGGAA  222

Query  223  AGCTGCTCTGAGAAAATAAAATTGGCTGAAGAGGGATCAGATGAAGATCTGGATTTGGTTCAACATCAGATAAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTGCTCTGAGAAAATAAAATTGGCTGAAGAGGGATCAGATGAAGATCTGGATTTGGTTCAACATCAGATAAT  296

Query  297  CTCTGAGTGTTCAGATGAACCCAAATTAAAAGAATTAGATTCTCAACTTCAAGATGCTATTCAGAAGATGAAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCTGAGTGTTCAGATGAACCCAAATTAAAAGAATTAGATTCTCAACTTCAAGATGCTATTCAGAAGATGAAAA  370

Query  371  AACTTGATAAAATATTGGCAAAGAAACAACGCAGAGAAAAAGAAATTAAGAAGCAAGGTCTAGAAATGAGAATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACTTGATAAAATATTGGCAAAGAAACAACGCAGAGAAAAAGAAATTAAGAAGCAAGGTCTAGAAATGAGAATA  444

Query  445  AAGCTGTGGGAAGAAATTAAGTCTGCAAAATATAGTGAAGCTTGGCAAAGTAAAGAGGAGATGGAAAATACAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCTGTGGGAAGAAATTAAGTCTGCAAAATATAGTGAAGCTTGGCAAAGTAAAGAGGAGATGGAAAATACAAA  518

Query  519  AAAATTTTTATCTTTGACTGCTGTTTCTGAAGAAACTGTTGGTCCTTCTCATGAGGAGGAAGACACCTTTTCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAATTTTTATCTTTGACTGCTGTTTCTGAAGAAACTGTTGGTCCTTCTCATGAGGAGGAAGACACCTTTTCCT  592

Query  593  CAGTGTTTCATACTCAAATCCCTCCAGAAGAATATGAAATGCAGATGCAGAAACTCAATAAAGATTTTACCTGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGTGTTTCATACTCAAATCCCTCCAGAAGAATATGAAATGCAGATGCAGAAACTCAATAAAGATTTTACCTGT  666

Query  667  GATGTGGAAAGAAATGAGTCATTGATCAAATCAGGAAAGAAACCTTTCTCGAATACAGAAAAGATTGAGCTCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGTGGAAAGAAATGAGTCATTGATCAAATCAGGAAAGAAACCTTTCTCGAATACAGAAAAGATTGAGCTCAG  740

Query  741  GGGTAAACACAACCAGGATTTTATTAAGAGAAACATTGAGTTGGCCAAGGAATCAAGAAACCCAGTGGTTATGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGTAAACACAACCAGGATTTTATTAAGAGAAACATTGAGTTGGCCAAGGAATCAAGAAACCCAGTGGTTATGG  814

Query  815  TTGACAGAGAGAAGAAAAGGCTGGTTGAGCTTTTGAAGGACTTGGATGAGAAAGATTCCGGGCTCTCCAGTTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGACAGAGAGAAGAAAAGGCTGGTTGAGCTTTTGAAGGACTTGGATGAGAAAGATTCCGGGCTCTCCAGTTCT  888

Query  889  GAGGGTGATCAGTCTGGCTGGGTGGTCCCAGTAAAAGGATATGAACTTGCAGTCACCCAGCATCAGCAGCTTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGGGTGATCAGTCTGGCTGGGTGGTCCCAGTAAAAGGATATGAACTTGCAGTCACCCAGCATCAGCAGCTTGC  962

Query  963  TGAAATTGATATAAAACTCCAAGAACTCTCTGCAGCCTCCCCTACAATTTCCAGTTTTTCTCCAAGACTTGAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAATTGATATAAAACTCCAAGAACTCTCTGCAGCCTCCCCTACAATTTCCAGTTTTTCTCCAAGACTTGAAA  1036

Query 1037  ATCGGAATAATCAGAAACCTGACCATGATGGTGAAAGAAATATGGAAGTAACTCCAGGAGAAAAGATACTTAGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCGGAATAATCAGAAACCTGACCGTGATGGTGAAAGAAATATGGAAGTAACTCCAGGAGAAAAGATACTTAGG  1110

Query 1111  AACACCAAAGAGCAACGCGATCTGCATAATCGGCTGAGAGAGATTGATGAAAAGCTGAAAATGATGAAGGAAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACACCAAAGAGCAACGCGATCTGCATAATCGGCTGAGAGAGATTGATGAAAAGCTGAAAATGATGAAGGAAAA  1184

Query 1185  TGTGTTAGAGTCCACATCACGTCTCTCTGAAGAACAGTTAAAGTGTCTTCTGGATGAATGCATACTTAAACAAA  1258
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTGTTAGAGTCCACATCATGTCTCTCTGAAGAACAGTTAAAGTGTCTTCTGGATGAATGCATACTTAAACAAA  1258

Query 1259  AATCCATCATTAAACTTTCTTCAGAAAGAAAAAAGGAAGACATTGAGGACGTAACACCTGTGTTCCCCCAGCTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AATCCATCATTAAACTTTCTTCAGAAAGAAAAAAGGAAGACATTGAGGACGTAACACCTGTGTTCCCCCAGCTT  1332

Query 1333  TCCAGGTCCATCATCTCTAAATTGCTAAATGAATCAGAAACAAAGGTCCAGAAAACTGAGGTAGAAGATGCAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCAGGTCCATCATCTCTAAATTGCTAAATGAATCAGAAACAAAGGTCCAGAAAACTGAGGTAGAAGATGCAGA  1406

Query 1407  TATGCTTGAGAGTGAAGAATGTGAAGCTTCTAAAGGCTACTATCTCACTAAAGCCTTGACTGGACATAATATGT  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407  TATGCTTGAGAGTGAAGAATGTGAAGCTTCTAAAGGCTACTATCTCACTAAAGCCTTGACTGGACATAACATGT  1480

Query 1481  CAGAAGCTCTTGTCACTGAAGCAGAGAATATGAAATGCCTTCAATTTTCCAAGGACGTTATTATTAGTGACACA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGAAGCTCTTGTCACTGAAGCAGAGAATATGAAATGCCTTCAATTTTCCAAGGACGTTATTATTAGTGACACA  1554

Query 1555  AAAGACTATTTTATGTCGAAGACTCTTGGCATTGGGAGACTGAAAAGGCCCTCCTTCTTAGATGATCCACTGTA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAAGACTATTTTATGTCGAAGACTCTTGGCATTGGGAGACTGAAAAGGCCCTCCTTCTTAGATGATCCACTGTA  1628

Query 1629  TGGTATCAGTGTGAGCCTTTCATCAGAAGACCAACATCTGAAACTCAGTTCTCCAGAGAATACAATAGCAGATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGTATCAGTGTGAGCCTTTCATCAGAAGACCAACATCTGAAACTCAGTTCTCCAGAGAATACAATAGCAGATG  1702

Query 1703  AGCAGGAGACTAAAGATGCAGCAGAAGAATGTAAAGAACCC  1743
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCAGGAGACTAAAGATGCAGCAGAAGAATGTAAAGAACCC  1743