Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479033
• Subject: NM_001349217.2
• Aligned Length: 1486
• Identities: 1247
• Gaps: 230

Alignment

Query    1  ATGTCAGTGGACATGAATAGCCAGGGGTCTGACAGCAATGAAGAGGACTATGACCCAAATTGTGAGGAAGAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAAGAAGAAGAAGACGACCCTGGGGACATAGAGGACTATTACGTGGGAGTAGCCAGCGATGTGGAGCAGCAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGGCTGATGCCTTTGATCCCGAGGAGTACCAGTTCACTTGCTTGACCTACAAGGAATCTGAGGGTGCCCTCAAT  222
                                                                                    ||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2

Query  223  GAGCACATG--ACCAGCTTAGCTTCTGTCCT-----AAAGGTATCTCATTCAGTTGCTAAACTTATATTAGTTA  289
            |..||| ||  |.|||||  ||.||...|||     |..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    3  GCTCAC-TGCCATCAGCT--GCATCCTCCCTATGGCACTGGTATCTCATTCAGTTGCTAAACTTATATTAGTTA  73

Query  290  ATTTCCACTGGCAAGTTTCAGAGATATTGGACAGATACAAGTCCAATTCTGCTCAACTGCTTGTTGAGGCTCGA  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  ATTTCCACTGGCAAGTTTCAGAGATATTGGACAGATACAAGTCCAATTCTGCTCAACTGCTTGTTGAGGCTCGA  147

Query  364  GTTCAGCCTAATCCATCAAAACATGTTCCCACATCCCATCCCCCTCACCACTGTGCAGTGTGTATGCAGTTTGT  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GTTCAGCCTAATCCATCAAAACATGTTCCCACATCCCATCCCCCTCACCACTGTGCAGTGTGTATGCAGTTTGT  221

Query  438  GCGAAAGGAAAACCTACTCTCTCTGGCCTGTCAGCACCAGTTTTGCCGCAGCTGCTGGGAGCAGCACTGCTCAG  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GCGAAAGGAAAACCTACTCTCTCTGGCCTGTCAGCACCAGTTTTGCCGCAGCTGCTGGGAGCAGCACTGCTCAG  295

Query  512  TTCTCGTCAAGGACGGCGTGGGCGTGGGAGTCTCTTGCATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGAC  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  TTCTCGTCAAGGACGGCGTGGGCGTGGGAGTCTCTTGCATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGAC  369

Query  586  TTTGTGTTTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGA  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  TTTGTGTTTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGA  443

Query  660  GAGTCATTACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTC  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GAGTCATTACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTC  517

Query  734  GCCGAGTACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGAC  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  GCCGAGTACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGAC  591

Query  808  TGTGCCACAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACAC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  TGTGCCACAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACAC  665

Query  882  TAAAGACTGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  TAAAGACTGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTA  739

Query  956  AACACGACTTCTGCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTAC  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AACACGACTTCTGCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTAC  813

Query 1030  AAGGAGAATCCTGACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AAGGAGAATCCTGACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTA  887

Query 1104  CTTTGAGAGGTGGGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGA  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CTTTGAGAGGTGGGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGA  961

Query 1178  TTCAGGAGAGGGTCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTG  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TTCAGGAGAGGGTCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTG  1035

Query 1252  GCCAAGTGTCGATACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCT  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GCCAAGTGTCGATACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCT  1109

Query 1326  GTTTGAATACCAGCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCT  1399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GTTTGAATACCAGCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCT  1183

Query 1400  ATGACAGAGGGGACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCAT  1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ATGACAGAGGGGACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCAT  1257

Query 1474  GACACC  1479
            ||||||
Sbjct 1258  GACACC  1263