Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479045
• Subject: XM_017024284.2
• Aligned Length: 2853
• Identities: 2810
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGACTGACTCCAAGTATTTCACAACCAATAAAAAAGGAGAAATATTTGAACTAAAAGCTGAACTCAACAATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTGACTCCAAGTATTTCACAACCAATAAAAAAGGAGAAATATTTGAACTAAAAGCTGAACTCAACAATGA  74

Query   75  AAAGAAAGAAAAGAGAAAGGAGGCTGTGAAGAAAGTGATTGCTGCTATGACCGTGGGGAAGGATGTTAGTTCTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAAGAAAGAAAAGAGAAAGGAGGCTGTGAAGAAAGTGATTGCTGCTATGACCGTGGGGAAGGATGTTAGTTCTC  148

Query  149  TCTTTCCAGACGTAGTGAACTGTATGCAGACTGACAATCTGGAACTAAAGAAGCTTGTGTATCTCTACTTGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTTTCCAGACGTAGTGAACTGTATGCAGACTGACAATCTGGAACTAAAGAAGCTTGTGTATCTCTACTTGATG  222

Query  223  AACTACGCCAAGAGTCAGCCAGACATGGCCATCATGGCTGTAAACAGCTTTGTGAAGGACTGTGAAGATCCTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACTACGCCAAGAGTCAGCCAGACATGGCCATCATGGCTGTAAACAGCTTTGTGAAGGACTGTGAAGATCCTAA  296

Query  297  TCCTTTGATTCGAGCCTTGGCAGTCAGAACCATGGGGTGCATCCGGGTAGACAAAATTACAGAATATCTCTGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTTTGATTCGAGCCTTGGCAGTCAGAACCATGGGGTGCATCCGGGTAGACAAAATTACAGAATATCTCTGTG  370

Query  371  AGCCGCTCCGCAAGTGCTTGAAGGATGAGGATCCCTATGTTCGGAAAACAGCAGCAGTCTGCGTGGCAAAACTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCCGCTCCGCAAGTGCTTGAAGGATGAGGATCCCTATGTTCGGAAAACAGCAGCAGTCTGCGTGGCAAAACTC  444

Query  445  CATGATATCAATGCCCAAATGGTGGAAGATCAGGGATTTCTGGATTCTCTACGGGATCTCATAGCAGATTCAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGATATCAATGCCCAAATGGTGGAAGATCAGGGATTTCTGGATTCTCTACGGGATCTCATAGCAGATTCAAA  518

Query  519  TCCAATGGTGGTGGCTAATGCCGTAGCGGCATTATCTGAAATCAGTGAGTCTCACCCAAACAGCAACTTACTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCAATGGTGGTGGCTAATGCCGTAGCGGCATTATCTGAAATCAGTGAGTCTCACCCAAACAGCAACTTACTTG  592

Query  593  ATCTGAACCCACAGAACATTAATAAGCTGCTGACAGCCCTGAATGAATGCACTGAATGGGGCCAGATTTTCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCTGAACCCACAGAACATTAATAAGCTGCTGACAGCCCTGAATGAATGCACTGAATGGGGCCAGATTTTCATC  666

Query  667  CTGGACTGCCTGTCTAATTACAACCCTAAAGATGATCGGGAGGCTCAGAGCATCTGTGAGCGGGTAACTCCCCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGACTGCCTGTCTAATTACAACCCTAAAGATGATCGGGAGGCTCAGAGCATCTGTGAGCGGGTAACTCCCCG  740

Query  741  GCTATCCCATGCCAACTCAGCAGTGGTGCTTTCAGCGGTAAAAGTCCTAATGAAGTTTCTAGAATTGTTACCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTATCCCATGCCAACTCAGCAGTGGTGCTTTCAGCGGTAAAAGTCCTAATGAAGTTTCTAGAATTGTTACCTA  814

Query  815  AGGATTCTGACTACTACAATATGCTGCTGAAGAAGTTAGCCCCTCCACTTGTCACTTTGCTGTCTGGGGAGCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGATTCTGACTACTACAATATGCTGCTGAAGAAGTTAGCCCCTCCACTTGTCACTTTGCTGTCTGGGGAGCCA  888

Query  889  GAAGTGCAGTATGTCGCCCTGAGGAACATCAACTTAATTGTCCAGAAAAGGCCTGAAATCTTGAAGCAGGAAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGTGCAGTATGTCGCCCTGAGGAACATCAACTTAATTGTCCAGAAAAGGCCTGAAATCTTGAAGCAGGAAAT  962

Query  963  CAAAGTCTTCTTTGTGAAGTACAATGATCCCATCTATGTTAAACTAGAGAAGTTGGACATCATGATTCGTTTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAAGTCTTCTTTGTGAAGTACAATGATCCCATCTATGTTAAACTAGAGAAGTTGGACATCATGATTCGTTTGG  1036

Query 1037  CATCTCAAGCCAACATTGCTCAGGTTCTGGCAGAACTGAAAGAATATGCTACAGAGGTGGATGTTGACTTTGTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATCTCAAGCCAACATTGCTCAGGTTCTGGCAGAACTGAAAGAATATGCTACAGAGGTGGATGTTGACTTTGTT  1110

Query 1111  CGAAAAGCTGTGCGGGCCATTGGACGGTGTGCCATCAAGGTGGAGCAATCTGCAGAGCGCTGTGTAAGCACATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGAAAAGCTGTGCGGGCCATTGGACGGTGTGCCATCAAGGTGGAGCAATCTGCAGAGCGCTGTGTAAGCACATT  1184

Query 1185  GCTTGATCTAATCCAGACCAAAGTGAATTATGTGGTCCAAGAAGCAATTGTTGTCATCAGGGACATCTTCCGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTTGATCTAATCCAGACCAAAGTGAATTATGTGGTCCAAGAAGCAATTGTTGTCATCAGGGACATCTTCCGCA  1258

Query 1259  AATACCCCAACAAGTATGAAAGTATCATCGCCACTCTGTGTGAGAACTTAGACTCGCTGGATGAGCCAGATGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AATACCCCAACAAGTATGAAAGTATCATCGCCACTCTGTGTGAGAACTTAGACTCGCTGGATGAGCCAGATGCT  1332

Query 1333  CGAGCAGCTATGATTTGGATTGTGGGAGAATATGCTGAAAGAATTGACAATGCAGATGAGTTACTAGAAAGCTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGAGCAGCTATGATTTGGATTGTGGGAGAATATGCTGAAAGAATTGACAATGCAGATGAGTTACTAGAAAGCTT  1406

Query 1407  CCTGGAGGGTTTTCACGATGAAAGCACCCAGGTGCAGCTCACTCTGCTTACTGCCATAGTGAAGCTGTTTCTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTGGAGGGTTTTCACGATGAAAGCACCCAGGTGCAGCTCACTCTGCTTACTGCCATAGTGAAGCTGTTTCTCA  1480

Query 1481  AGAAACCATCAGAAACACAGGAGCTAGTCCAGCAGGTCTTGAGTTTGGCAACACAGGATTCTGATAATCCTGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAAACCATCAGAAACACAGGAGCTAGTCCAGCAGGTCTTGAGTTTGGCAACACAGGATTCTGATAATCCTGAC  1554

Query 1555  CTTCGAGACCGGGGCTATATTTATTGGCGCCTTCTCTCAACTGACCCTGTTACAGCTAAAGAAGTAGTCTTGTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTTCGAGACCGGGGCTATATTTATTGGCGCCTTCTCTCAACTGACCCTGTTACAGCTAAAGAAGTAGTCTTGTC  1628

Query 1629  TGAGAAGCCACTGATCTCTGAGGAGACGGACCTTATTGAGCCAACTCTGCTGGATGAGCTAATCTGCCACATTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAGAAGCCACTGATCTCTGAGGAGACGGACCTTATTGAGCCAACTCTGCTGGATGAGCTAATCTGCCACATTG  1702

Query 1703  GTTCTTTGGCCTCTGTGTATCATAAGCCTCCCAATGCTTTTGTGGAAGGAAGTCATGGAATTCATCGTAAACAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTTCTTTGGCCTCTGTGTATCATAAGCCTCCCAATGCTTTTGTGGAAGGAAGTCATGGAATTCATCGTAAACAC  1776

Query 1777  TTGCCAATTCATCATGGGAGCACTGATGCAGGTGACAGCCCTGTTGGCACTACCACTGCAACGAACCTGGAACA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTGCCAATTCATCATGGGAGCACTGATGCAGGTGACAGCCCTGTTGGCACTACCACTGCAACGAACCTGGAACA  1850

Query 1851  GCCTCAGGTTATCCCCTCTCAAGGTGATCTTCTAGGGGATCTTTTAAACCTTGACCTCGGTCCCCCAGTCAATG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCTCAGGTTATCCCCTCTCAAGGTGATCTTCTAGGGGATCTTTTAAACCTTGACCTCGGTCCCCCAGTCAATG  1924

Query 1925  TGCCACAGGTGTCCTCCATGCAGATGGGAGCAGTGGATCTCCTAGGAGGAGGACTAGATAGTCTGCTTGGCAGT  1998
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1925  TGCCACAGGTGTCCTCCATGCAGATGGGAGCAGTGGATCTCCTAGGAGGAGGACTAGATAGTCTG---------  1989

Query 1999  GACCTTGGCGGGGGCATTGGAGGAAGTCCGGCAGTGGGACAATCCTTCATCCCATCATCGGTCCCTGCAACCTT  2072
                                             |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1990  ---------------------------------GTGGGACAATCCTTCATCCCATCATCGGTGCCTGCAACCTT  2030

Query 2073  TGCTCCTTCACCTACACCTGCTGTGGTCAGCAGTGGACTGAATGACCTGTTTGAACTCTCCACAGGGATAGGCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031  TGCTCCTTCACCTACACCTGCTGTGGTCAGCAGTGGACTGAATGACCTGTTTGAACTCTCCACAGGGATAGGCA  2104

Query 2147  TGGCACCTGGTGGATATGTGGCTCCTAAGGCTGTCTGGCTACCTGCAGTAAAGGCTAAAGGCTTGGAGATTTCC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2105  TGGCACCTGGTGGATATGTGGCTCCTAAGGCTGTCTGGCTACCTGCAGTAAAGGCTAAAGGCTTGGAGATTTCC  2178

Query 2221  GGAACATTTACTCACCGCCAAGGGCACATCTATATGGAAATGAACTTCACCAATAAAGCTCTGCAGCACATGAC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2179  GGAACATTTACTCACCGCCAAGGGCACATCTATATGGAAATGAACTTCACCAATAAAGCTCTGCAGCACATGAC  2252

Query 2295  AGATTTTGCAATCCAGTTTAACAAAAATAGCTTTGGTGTCATCCCCAGCACTCCTCTGGCCATCCATACACCAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253  AGATTTTGCAATCCAGTTTAACAAAAATAGCTTTGGTGTCATCCCCAGCACTCCTCTGGCCATCCATACACCAC  2326

Query 2369  TGATGCCAAACCAGAGCATTGATGTCTCCCTGCCTCTCAATACCTTGGGCCCAGTCATGAAGATGGAACCTCTG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2327  TGATGCCAAACCAGAGCATTGATGTCTCCCTGCCTCTCAATACCTTGGGCCCAGTCATGAAGATGGAACCTCTG  2400

Query 2443  AATAACCTCCAGGTGGCTGTGAAAAACAATATCGATGTCTTCTACTTCAGCTGCCTCATCCCACTCAATGTGCT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401  AATAACCTCCAGGTGGCTGTGAAAAACAATATCGATGTCTTCTACTTCAGCTGCCTCATCCCACTCAATGTGCT  2474

Query 2517  TTTTGTAGAAGATGGCAAAATGGAGCGCCAGGTCTTCCTTGCAACATGGAAGGATATTCCCAATGAAAATGAAC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2475  TTTTGTAGAAGATGGCAAAATGGAGCGCCAGGTCTTCCTTGCAACATGGAAGGATATTCCCAATGAAAATGAAC  2548

Query 2591  TTCAGTTTCAGATTAAGGAATGTCATTTAAATGCTGACACTGTTTCCAGCAAGTTGCAAAACAACAATGTTTAT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2549  TTCAGTTTCAGATTAAGGAATGTCATTTAAATGCTGACACTGTTTCCAGCAAGTTGCAAAACAACAATGTTTAT  2622

Query 2665  ACTATTGCCAAGAGGAATGTGGAAGGGCAGGACATGCTGTACCAATCCCTGAAGCTCACTAATGGCATTTGGAT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623  ACTATTGCCAAGAGGAATGTGGAAGGGCAGGACATGCTGTACCAATCCCTGAAGCTCACTAATGGCATTTGGAT  2696

Query 2739  TTTGGCCGAACTACGTATCCAGCCAGGAAACCCCAATTACACGCTGTCACTGAAGTGTAGAGCTCCTGAAGTCT  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2697  TTTGGCCGAACTACGTATCCAGCCAGGAAACCCCAATTACACGCTGTCACTGAAGTGTAGAGCTCCTGAAGTCT  2770

Query 2813  CTCAATACATCTATCAGGTCTACGACAGCATTTTGAAAAAC  2853
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2771  CTCAATACATCTATCAGGTCTACGACAGCATTTTGAAAAAC  2811