Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479084
- Subject:
- NM_133352.2
- Aligned Length:
- 1761
- Identities:
- 1265
- Gaps:
- 387
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGGCCGCTGCCGGGCGCTCCTGGCGTGGCGGCGGCCGCCGCGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCCCCGGGCTCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTCTGACGAGCACGAACACACGTATCAAGATAAAGAAGAAGTTGTTTTATGGATGAATACTGTTGGGCCCTACC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACAATCGCCAAGAAACATATAAATACTTTTCACTTCCATTCTGTGTGGGGTCAAAAAAAAGTATCAGTCATTAC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CATGAAACTTTGGGAGAAGCACTTCAAGGAGTTGAATTAGAATTTAGTGGCCTGGACATTAAATTTAAAGATGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGTGATGCCAGGCACTTACTGTGAAATTGACTTAGATAAAGAGAAGAGAGATGCGTTTGTGTATGCTATCAAGA 370
Query 1 -----------------ATGCACATAGATGATTTACCAATATGGGGTATTGTTGGTGAGGCTGATGAAAATGGA 57
|||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 371 ATCACTATTGGTATCAGATGTACATAGATGACTTACCAATATGGGGTATTGTTGGTGAAGCAGATGAAAATGGG 444
Query 58 GAAGATTACTATCTTTGGACCTATAAAAAACTTGAAATAGGTTTTAATGGAAATCGAATTGTTGATGTTAATCT 131
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGATTACTATCTTTGGACCTACAAAAAACTTGAAATAGGCTTTAATGGAAATCGAATTGTTGATGTTAATCT 518
Query 132 AACTAGTGAAGGAAAGGTGAAACTGGTTCCAAATACTAAAATCCAGATGTCATATTCAGTAAAATGGAAAAAGT 205
||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 AACTAGTGAAGGAAAGGTCAAGCTGGTTCCAAATACTAAAATACAGATGTCATATTCGGTAAAATGGAAAAAAT 592
Query 206 CAGATGTGAAATTTGAAGATCGATTTGACAAATATCTTGATCCGTCCTTTTTTCAACATCGGATTCATTGGTTT 279
|.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||.||||||
Sbjct 593 CGGATGTAAAATTTGAAGATCGATTCGATAAATATCTTGATCCATCCTTTTTTCAGCATAGGATTCACTGGTTT 666
Query 280 TCAATTTTCAACTCCTTCATGATGGTGATCTTCTTGGTGGGCTTAGTTTCAATGATTTTAATGAGAACATTAAG 353
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 TCAATTTTTAATTCCTTCATGATGGTGATCTTCTTAGTGGGATTAGTTTCAATGATTTTAATGAGAACTTTAAG 740
Query 354 AAAAGATTATGCTCGGTACAGTAAAGAGGAAGAAATGGATGATATGGATAGAGACCTAGGAGATGAATATGGAT 427
.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 741 GAAAGATTATGCCCGATACAGTAAAGAAGAAGAAATGGATGACATGGACAGAGACCTAGGAGACGAGTATGGCT 814
Query 428 GGAAACAGGTGCATGGAGATGTATTTAGACCATCAAGTCACCCACTGATATTTTCCTCTCTGATTGGTTCTGGA 501
||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 815 GGAAGCAGGTGCATGGAGATGTGTTCAGACCGTCAAGTCACCCTCTGATCTTCTCCTCCCTCATTGGCTCTGGA 888
Query 502 TGTCAGATATTTGCTGTGTCTCTCATCGTTATTATTGTTGCAATGATAGAAGATTTATATACTGAGAGGGGATC 575
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 889 TGTCAGATATTTGCTGTGTCTCTCATTGTTATTATTGTTGCCATGATAGAGGACTTATATACAGAGAGGGGGTC 962
Query 576 AATGCTCAGTACAGCCATATTTGTCTATGCTGCTACGTCTCCAGTGAATGGTTATTTTGGAGGAAGTCTGTATG 649
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATGCTCAGCACAGCCATATTTGTCTATGCTGCTACATCGCCAGTGAACGGGTACTTTGGAGGAAGTCTGTATG 1036
Query 650 CTAGACAAGGAGGAAGGAGATGGATAAAGCAGATGTTTATTGGGGCATTCCTTATCCCAGCTATGGTGTGTGGC 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTAGACAAGGAGGAAGGAGATGGATAAAGCAGATGTTTATCGGGGCATTCCTTATCCCAGCTATGGTGTGTGGC 1110
Query 724 ACTGCCTTCTTCATCAATTTCATAGCCATTTATTACCATGCTTCAAGAGCCATTCCTTTTGGAACAATGGTGGC 797
|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTGCATTCTTCATCAACTTTATAGCCATTTATTACCATGCCTCTAGAGCCATTCCTTTTGGAACAATGGTGGC 1184
Query 798 CGTTTGTTGCATCTGTTTTTTTGTTATTCTTCCTCTAAATCTTGTTGGTACAATACTTGGCCGAAATCTGTCAG 871
||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1185 CGTTTGTTGCATCTGTTTCTTTGTTATCCTTCCTCTAAATCTCGTTGGTACAATACTGGGTCGAAATCTGTCGG 1258
Query 872 GTCAGCCCAACTTTCCTTGTCGTGTCAATGCTGTGCCTCGTCCTATACCGGAGAAAAAATGGTTCATGGAGCCT 945
|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259 GTCAGCCCAACTTCCCTTGTCGTGTCAATGCCGTGCCTCGTCCCATCCCGGAGAAAAAATGGTTTATGGAGCCT 1332
Query 946 GCGGTTATTGTTTGCCTGGGTGGAATTTTACCTTTTGGTTCAATCTTTATTGAAATGTATTTCATCTTCACGTC 1019
||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333 GCAGTTATTGTTTGCCTGGGAGGAATTTTACCTTTTGGATCAATCTTTATTGAAATGTACTTCATCTTCACGTC 1406
Query 1020 TTTCTGGGCATATAAGATCTATTATGTCTATGGCTTCATGATGCTGGTGCTGGTTATCCTGTGCATTGTGACTG 1093
.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTTCTGGGCATATAAGATCTACTATGTCTATGGCTTCATGATGCTGGTGCTGGTCATCCTGTGCATTGTGACTG 1480
Query 1094 TCTGTGTGACTATTGTGTGCACATATTTTCTACTAAATGCAGAAGATTACAGGTGGCAATGGACAAGTTTTCTC 1167
||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 1481 TCTGTGTGACCATTGTCTGCACATACTTCCTGCTAAACGCAGAGGATTACAGGTGGCAGTGGACGAGTTTCCTG 1554
Query 1168 TCTGCTGCATCAACTGCAATCTATGTTTACATGTATTCCTTTTACTACTATTTTTTCAAAACAAAGATGTATGG 1241
|||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 TCTGCGGCGTCGACCGCGATCTACGTTTACATGTACTCCTTTTACTACTACTTCTTCAAAACCAAGATGTATGG 1628
Query 1242 CTTATTTCAAACATCATTTTACTTTGGATATATGGCGGTATTTAGCACAGCCTTGGGGATAATGTGTGGAGCGA 1315
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629 CTTATTTCAAACATCATTTTACTTTGGCTACATGGCGGTGTTTAGCACAGCCTTGGGGATAATGTGTGGAGCAA 1702
Query 1316 TTGGTTACATGGGAACAAGTGCCTTTGTCCGAAAAATCTATAGTCATGTGAAAATTGAC 1374
|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1703 TCGGTTACATGGGAACAAGTGCCTTTGTTCGAAAAATCTATACTAATGTGAAAATTGAC 1761
