Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479120
• Subject: NM_001314041.1
• Aligned Length: 3153
• Identities: 1901
• Gaps: 984

Alignment

Query    1  ATGGGGAGCCGGACGCCAGAGTCCCCTCTCCACGCCGTGCAGCTGCGCTGGGGCCCCCGGCGCCGACCCCCGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTGCCGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCCGCCGCCACCCAGGGTCGGGGGCTTCAACTTAGACGCGGAGGCCCCAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGTACTCTCGGGGCCCCCGGGCTCCTTCTTCGGATTCTCAGTGGAGTTTTACCGGCCGGGAACAGACGGGGTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGTGTGCTGGTGGGAGCACCCAAGGCTAATACCAGCCAGCCAGGAGTGCTGCAGGGTGGTGCTGTCTACCTCTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TCCTTGGGGTGCCAGCCCCACACAGTGCACCCCCATTGAATTTGACAGCAAAGGCTCTCGGCTCCTGGAGTCCT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CACTGTCCAGCTCAGAGGGAGAGGAGCCTGTGGAGTACAAGTCCTTGCAGTGGTTCGGGGCAACAGTTCGAGCC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CATGGCTCCTCCATCTTGGCATGCGCTCCACTGTACAGCTGGCGCACAGAGAAGGAGCCACTGAGCGACCCCGT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  GGGCACCTGCTACCTCTCCACAGATAACTTCACCCGAATTCTGGAGTATGCACCCTGCCGCTCAGATTTCAGCT  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  GGGCAGCAGGACAGGGTTACTGCCAAGGAGGCTTCAGTGCCGAGTTCACCAAGACTGGCCGTGTGGTTTTAGGT  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  GGACCAGGAAGCTATTTCTGGCAAGGCCAGATCCTGTCTGCCACTCAGGAGCAGATTGCAGAATCTTATTACCC  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  CGAGTACCTGATCAACCTGGTTCAGGGGCAGCTGCAGACTCGCCAGGCCAGTTCCATCTATGATGACAGCTACC  814
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  815  TAGGATACTCTGTGGCTGTTGGTGAATTCAGTGGTGATGACACAGAAGACTTTGTTGCTGGTGTGCCCAAAGGG  888
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  889  AACCTCACTTACGGCTATGTCACCATCCTTAATGGCTCAGACATTCGATCCCTCTACAACTTCTCAGGGGAACA  962
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  963  GATGGCCTCCTACTTTGGCTATGCAGTGGCCGCCACAGACGTCAATGGGGACGGGCTGGATGACTTGCTGGTGG  1036
             ||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||...||||||.||.|||||.||||||.|.|||||.|
Sbjct    1  -ATGGCCTCCTACTTCGGCTATGCTGTGGCTGCCACTGATACCAATGGAGATGGGCTAGATGACCTACTGGTAG  73

Query 1037  GGGCACCCCTGCTCATGGATCGGACCCCTGACGGGCGGCCTCAGGAGGTGGGCAGGGTCTACGTCTACCTGCAG  1110
            |||||||||||||||||||.|||||..||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct   74  GGGCACCCCTGCTCATGGAGCGGACAGCTGATGGGAGACCTCAGGAGGTGGGCAGGGTCTACATCTATCTGCAG  147

Query 1111  CACCCAGCCGGCATAGAGCCCACGCCCACCCTTACCCTCACTGGCCATGATGAGTTTGGCCGATTTGGCAGCTC  1184
            |.||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||..|||||||.||||||||
Sbjct  148  CGCCCAGCGGGCATAGATCCCACACCCACCCTCACCCTCACTGGGCAAGATGAGTTCAGCCGATTCGGCAGCTC  221

Query 1185  CTTGACCCCCCTGGGGGACCTGGACCAGGATGGCTACAATGATGTGGCCATCGGGGCTCCCTTTGGTGGGGAGA  1258
            ||||||.|||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||.
Sbjct  222  CTTGACACCCTTGGGGGACCTGGACCAAGACGGCTACAATGATGTCGCCATTGGGGCTCCATTTGGTGGGGAGG  295

Query 1259  CCCAGCAGGGAGTAGTGTTTGTATTTCCTGGGGGCCCAGGAGGGCTGGGCTCTAAGCCTTCCCAGGTTCTGCAG  1332
            |||||||||||||.||.|||.||||.||.||.|||||||||||.|||.||.||||.||||||||||||.|||||
Sbjct  296  CCCAGCAGGGAGTCGTATTTATATTCCCGGGAGGCCCAGGAGGACTGAGCACTAAACCTTCCCAGGTTTTGCAG  369

Query 1333  CCCCTGTGGGCAGCCAGCCACACCCCAGACTTCTTTGGCTCTGCCCTTCGAGGAGGCCGAGACCTGGATGGCAA  1406
            ||.||.||||||||..|||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  370  CCTCTTTGGGCAGCTGGCCGTACCCCAGACTTCTTTGGCTCTGCCCTTCGAGGAGGACGAGATCTGGATGGCAA  443

Query 1407  TGGATATCCTGATCTGATTGTGGGGTCCTTTGGTGTGGACAAGGCTGTGGTATACAGGGGCCGCCCCATCGTGT  1480
            ||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||.||||||.|.|
Sbjct  444  TGGATACCCTGATCTAATCGTTGGATCCTTTGGTGTGGACAAGGCTCTGGTGTACAGAGGGCGGCCCATCATAT  517

Query 1481  CCGCTAGTGCCTCCCTCACCATCTTCCCCGCCATGTTCAACCCAGAGGAGCGGAGCTGCAGCTTAGAGGGGAAC  1554
            |.||.||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||.||||||
Sbjct  518  CTGCCAGCGCATCTCTCACCATCTTCCCCTCCATGTTCAACCCAGAGGAGCGCAGTTGCAGCCTGGAAGGGAAC  591

Query 1555  CCTGTGGCCTGCATCAACCTTAGCTTCTGCCTCAATGCTTCTGGAAAACACGTTGCTGACTCCATTGGTTTCAC  1628
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..|..||||.||.||.|||..
Sbjct  592  CCTGTGTCCTGCATCAACCTTAGCTTCTGCCTCAATGCCTCTGGAAAACATGTCCCCAACTCTATAGGCTTCGA  665

Query 1629  AGTGGAACTTCAGCTGGACTGGCAGAAGCAGAAGGGAGGGGTACGGCGGGCACTGTTCCTGGCCTCCAGGCAGG  1702
            .||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||.|||||
Sbjct  666  GGTGGAACTCCAACTGGACTGGCAGAAGCAAAAGGGAGGGGTCCGGCGGGCACTGTTCCTGACTTCCAAGCAGG  739

Query 1703  CAACCCTGACCCAGACCCTGCTCATCCAGAATGGGGCTCGAGAGGATTGCAGAGAGATGAAGATCTACCTCAGG  1776
            |.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  740  CCACCCTTACCCAGACCCTGCTTATCCAGAATGGGGCTCGGGAGGACTGCAGGGAGATGAAGATCTACCTCAGG  813

Query 1777  AACGAGTCAGAATTTCGAGACAAACTCTCGCCGATTCACATCGCTCTCAACTTCTCCTTGGACCCCCAAGC-CC  1849
            ||.||.||||||||..|||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||| ||
Sbjct  814  AATGAATCAGAATTCAGAGACAAACTCTCCCCAATTCACATTGCCCTCAACTTCTCCTTGGACCCCAAAGCTCC  887

Query 1850  CAGTGGACAGCCACGGCCTCAGGCCAGCCCTACATTATCAGAGCAAGAGCCGGATAGAGGACAAGGCTCAGATC  1923
            || ||||||||||.||||||.||||||..|||||.||.||.|||||.|||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct  888  CA-TGGACAGCCATGGCCTCCGGCCAGTTCTACACTACCAAAGCAAAAGCAGGATAGAGGACAAGGCCCAGATC  960

Query 1924  TTGCTGGACTGTGGAGAAGACAACATCTGTGTGCCTGACCTGCAGCTGGAAGTGTTTGGGGAGCAGAACCATGT  1997
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||.||||.|||||
Sbjct  961  TTGCTGGACTGTGGTGAAGACAATATCTGTGTGCCTGACCTGCAGCTGGATGTGTATGGGGAGAAGAAACATGT  1034

Query 1998  GTACCTGGGTGACAAGAATGCCCTGAACCTCACTTTCCATGCCCAGAATGTGGGTGAGGGTGGCGCCTATGAGG  2071
            ||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||.||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1035  GTACCTGGGTGACAAGAACGCACTGAACCTGACATTCCATGCCCAAAATCTGGGTGAGGGCGGTGCCTATGAAG  1108

Query 2072  CTGAGCTTCGGGTCACCGCCCCTCCAGAGGCTGAGTACTCAGGACTCGTCAGACACCCAGGGAACTTCTCCAGC  2145
            |.||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  CCGAGCTTCGGGTCACAGCCCCTCTAGAGGCCGAGTACTCAGGACTTGTCAGACACCCAGGGAACTTCTCCAGC  1182

Query 2146  CTGAGCTGTGACTACTTTGCCGTGAACCAGAGCCGCCTGCTGGTGTGTGACCTGGGCAACCCCATGAAGGCAGG  2219
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 1183  CTGAGCTGTGACTACTTTGCTGTGAACCAGAGCCGCCAGCTGGTGTGTGACCTGGGCAACCCCATGAAG-----  1251

Query 2220  AGCCAGTCTGTGGGGTGGCCTTCGGTTTACAGTCCCTCATCTCCGGGACACTAAGAAAACCATCCAGTTTGACT  2293
                   ||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|..|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  -------CTCTGGGGTGGCCTTCGGTTCACTGTTCCTCATCTTCAAGACACAAAGAAAACCATCCAGTTTGACT  1318

Query 2294  TCCAGATCCTCAGCAAGAATCTCAACAACTCGCAAAGCGACGTGGTTTCCTTTCGGCTCTCCGTGGAGGCTCAG  2367
            |.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.|||||||.|||||.|..|||||.|||||||||||.
Sbjct 1319  TTCAGATCCTCAGCAAGAACCTGAACAACTCACAAAGCAACGTGGTCTCCTTCCCACTCTCGGTGGAGGCTCAA  1392

Query 2368  GCCCAGGTCACCCTGAACGGTGTCTCCAAGCCTGAGGCAGTGCTATTCCCAGTAAGCGACTGGCATCCCCGAGA  2441
            |||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||.||||.|.|||
Sbjct 1393  GCCCAGGTCTCCCTTAATGGTGTCTCCAAGCCTGAAGCTGTGATTTTCCCAGTCAGCGACTGGAATCCTCAAGA  1466

Query 2442  CCAGCCTCAGAAGGAGGAGGACCTGGGACCTGCTGTCCACCATGTCTATGAGCTCATCAACCAAGGCCCCAGCT  2515
            ||||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1467  CCAGCCTCAGAAGGAGGAAGACTTGGGCCCAGCTGTCCACCATGTCTACGAGCTCATCAACCAGGGGCCCAGCT  1540

Query 2516  CCATTAGCCAGGGTGTGCTGGAACTCAGCTGTCCCCAGGCTCTGGAAGGTCAGCAGCTCCTATATGTGACCAGA  2589
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||..
Sbjct 1541  CCATCAGCCAGGGTGTGCTGGAGCTCAGCTGTCCACAGGCTCTGGAAGGCCAACAGCTCCTCTATGTGACCAAG  1614

Query 2590  GTTACGGGACT---CAACTGCACCACCAA--TCACCCCATTAACCCAAAGGGCCTGGAGTTGGATCCCGAGGGT  2658
            ||.||.|||||   ||||||||||.||||  .||||||  .|||.||.|||||||||||||||||||.|||...
Sbjct 1615  GTGACAGGACTCAGCAACTGCACCTCCAACTACACCCC--CAACTCACAGGGCCTGGAGTTGGATCCAGAGACC  1686

Query 2659  TCCCTGCACCACCAGCAAAAACGGGAAGCTCCAAGCCGCAGCTCTGCTTCCTCGGGACCTCAGATCCTGAAATG  2732
            ||.|..|||||||.|||.|||||.||.||||||.|..|.||.|||.||.||||.|||.|.||..|.||||||||
Sbjct 1687  TCTCCACACCACCTGCAGAAACGAGAGGCTCCAGGGAGGAGTTCTACTGCCTCAGGAACACAAGTTCTGAAATG  1760

Query 2733  CCCGGAGGCTGAGTGTTTCAGGCTGCGCTGTGAGCTCGGGCCCCTGCACCAACAAGAGAGCCAAAGTCTGCAGT  2806
            |||.||.||..|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||..||||||||||..|||||||||.
Sbjct 1761  CCCTGAAGCCAAGTGTTTCAGGCTGCGCTGTGAGTTTGGGCCACTGCACCGCCAAGAGAGCCGTAGTCTGCAGC  1834

Query 2807  TGCATTTCCGAGTCTGGGCCAAGACTTTCTTGCAGCGGGAGCACCAGCCATTTAGCCTGCAGTGTGAGGCTGTG  2880
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1835  TGCATTTCCGAGTCTGGGCCAAGACCTTCTTGCAGCGGGAATACCAGCCATTTAGCCTTCAGTGTGAGGCTGTA  1908

Query 2881  TACAAAGCCCTGAAGATGCCCTACCGAATCCTGCCTCGGCAGCTGCCCCAAAAAGAGCGTCAGGTGGCCACAGC  2954
            ||..||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||..|.|.|||||||||||||||
Sbjct 1909  TATGAAGCTCTGAAGATGCCCTACCAGATCCTGCCTCGGCAGCTTCCCCAAAAGAAACTTCAGGTGGCCACAGC  1982

Query 2955  TGTGCAATGGACCAAGGCAGAAGGCAGCTATGGCGTCCCACTGTGGATCATCATCCTAGCCATCCTGTTTGGCC  3028
            .|||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1983  CGTGCAGTGGACCAAGGCAGAAGGCAGCAATGGTGTCCCGTTGTGGATCATCATCCTAGCCATTCTTTTTGGCC  2056

Query 3029  TCCTGCTCCTAGGTCTACTCATCTACATCCTCTACAAGCTTGGATTCTTCAAACGCTCCCTCCCATATGGCACC  3102
            ||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 2057  TCCTGCTCCTAGGTCTGCTCATCTACGTCCTCTACAAGCTCGGCTTCTTCAAACGTTCCCTCCCCTACGGCACA  2130

Query 3103  GCCATGGAAAAAGCTCAGCTCAAGCCTCCAGCCACCTCTGATGCC  3147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2131  GCCATGGAAAAAGCTCAGCTCAAGCCTCCAGCCACCTCAGATGCC  2175