Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479151
• Subject: XM_005261410.4
• Aligned Length: 1335
• Identities: 1255
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ATGTGGCCTGGGAACGCCTGGCGCGCCGCACTCTTCTGGGTGCCCCGCGGCCGCCGCGCACAGTCAGCGCTGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGCCTGGGAACGCCTGGCGCGCCGCACTCTTCTGGGTGCCCCGCGGCCGCCGCGCACAGTCAGCGCTGGC  74

Query   75  CCAGCTGCGTGGCATTCTGGAGGGGGAGCTGGAAGGCATCTGCGGAGCTGGCACTTGGAAGAGTGAGCGGGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCTGCGTGGCATTCTGGAGGGGGAGCTGGAAGGCATCCGCGGAGCTGGCACTTGGAAGAGTGAGCGGGTCA  148

Query  149  TCACGTCCCGTCAGGGGCCGCACATCCGCGTGGACGGCGTCTCCGG----------------------------  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  149  TCACGTCCCGTCAGGGGCCGCACATCCGCGTGGACGGCGTCTCCGGAGGGCCTGGCACTGTCATCTTTCCAGGC  222

Query  195  --------------------------------------------------AGGAATCCTTAACTTCTGTGCCAA  218
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCCCTTGCCCCACCTGAGCTGCTGTATCCATCTCCTCTCCTTCACCTCAGGAATCCTTAACTTCTGTGCCAA  296

Query  219  CAACTACCTGGGCCTGAGCAGCCACCCTGAGGTGATCCAGGCAGGTCTGCAGGCTCTGGAGGAGTTTGGAGCTG  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAACTACCTGGGCCTGAGCAGCCACCCTGAGGTGATCCAGGCAGGTCTGCAGGCTCTGGAGGAGTTTGGAGCTG  370

Query  293  GCCTCAGCTCTGTCCGCTTTATCTGTGGAACCCAGAGCATCCACAAGAATCTAGAAGCAAAAATAGCCCGCTTC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTCAGCTCTGTCCGCTTTATCTGTGGAACCCAGAGCATCCACAAGAATCTAGAAGCAAAAATAGCCCGCTTC  444

Query  367  CACCAGCGGGAGGATGCCATCCTCTATCCCAGCTGTTATGACGCCAACGCCGGCCTCTTTGAGGCCCTGCTGAC  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACCAGCGGGAGGATGCCATCCTCTATCCCAGCTGTTATGACGCCAACGCCGGCCTCTTTGAGGCCCTGCTGAC  518

Query  441  CCCAGAGGACGCAGTCCTGTCGGACGAGCTGAACCATGCCTCCATCATCGACGGCATCCGGCTGTGCAAGGCCC  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCAGAGGACGCAGTCCTGTCGGACGAGCTGAACCATGCCTCCATCATCGACGGCATCCGGCTGTGCAAGGCCC  592

Query  515  ACAAGTACCGCTATCGCCACCTGGACATGGCCGACCTAGAAGCCAAGCTGCAGGAGGCCCAGAAGCATCGGCTG  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAGTACCGCTATCGCCACCTGGACATGGCCGACCTAGAAGCCAAGCTGCAGGAGGCCCAGAAGCATCGGCTG  666

Query  589  CGCCTGGTGGCCACTGATGGGGCCTTTTCCATGGATGGCGACATCGCACCCCTGCAGGAGATCTGCTGCCTCGC  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCCTGGTGGCCACTGATGGGGCCTTTTCCATGGATGGCGACATCGCACCCCTGCAGGAGATCTGCTGCCTCGC  740

Query  663  CTCTAGATATGGTGCCCTGGTCTTCATGGATGAATGCCATGCCACTGGCTTCCTGGGGCCCACAGGACGGGGCA  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCTAGATATGGTGCCCTGGTCTTCATGGATGAATGCCATGCCACTGGCTTCCTGGGGCCCACAGGACGGGGCA  814

Query  737  CAGATGAGCTGCTGGGTGTGATGGACCAGGTCACCATCATCAACTCCACCCTGGGGAAGGCCCTGGGTGGAGCA  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGATGAGCTGCTGGGTGTGATGGACCAGGTCACCATCATCAACTCCACCCTGGGGAAGGCCCTGGGTGGAGCA  888

Query  811  TCAGGGGGCTACACGACAGGGCCTGGGCCCCTGGTGTCCCTGCTGCGGCAGCGCGCCCGGCCATACCTCTTCTC  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGGGGGCTACACGACAGGGCCTGGGCCCCTGGTGTCCCTGCTGCGGCAGCGCGCCCGGCCATACCTCTTCTC  962

Query  885  CAACAGTCTGCCACCTGCTGTCGTTGGCTGCGCCTCCAAGGCCCTAGATCTGCTGATGGGGAGTAACACCATTG  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAACAGTCTGCCACCTGCTGTCGTTGGCTGCGCCTCCAAGGCCCTAGATCTGCTGATGGGGAGTAACACCATTG  1036

Query  959  TCCAGTCTATGGCTGCCAAGACCCAGAGGTTCCGTAGTAAGATGGAAGCTGCTGGCTTCACTATCTCGGGAGCC  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCAGTCTATGGCTGCCAAGACCCAGAGGTTCCGTAGTAAGATGGAAGCTGCTGGCTTCACTATCTCGGGAGCC  1110

Query 1033  AGTCACCCCATCTGCCCTGTGATGCTGGGTGATGCCCGGCTGGCCTCTCGCATGGCGGATGACATGCTGAAGAG  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTCACCCCATCTGCCCTGTGATGCTGGGTGATGCCCGGCTGGCCTCTCGCATGGCGGATGACATGCTGAAGAG  1184

Query 1107  AGGCATCTTTGTCATCGGGTTCAGCTACCCCGTGGTCCCCAAGGGCAAGGCCTGGATCCGGGTACAGATCTCAG  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGCATCTTTGTCATCGGGTTCAGCTACCCCGTGGTCCCCAAGGGCAAGGCCCGGATCCGGGTACAGATCTCAG  1258

Query 1181  CAGTGCATAGCGAGGAAGACATTGACCGCTGCGTGGAGGCCTTCGTGGAAGTGGGGCGACTGCACGGGGCACTG  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGTGCATAGCGAGGAAGACATTGACCGCTGCGTGGAGGCCTTCGTGGAAGTGGGGCGACTGCACGGGGCACTG  1332

Query 1255  CCC  1257
            |||
Sbjct 1333  CCC  1335