Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479151
• Subject: XM_017028674.2
• Aligned Length: 1563
• Identities: 1255
• Gaps: 306

Alignment

Query    1  ATGTGGCCTGGGAACGCCTGGCGCGCCGCACTCTTCTGGGTGCCCCGCGGCCGCCGCGCACAGTCAGCGCTGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGCCTGGGAACGCCTGGCGCGCCGCACTCTTCTGGGTGCCCCGCGGCCGCCGCGCACAGTCAGCGCTGGC  74

Query   75  CCAGCTGCGTGGCATTCTGGAGGGGGAGCTGGAAGGCATCTGCGGAGCTGGCACTTGGAAGAGTGAGCGGGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCTGCGTGGCATTCTGGAGGGGGAGCTGGAAGGCATCCGCGGAGCTGGCACTTGGAAGAGTGAGCGGGTCA  148

Query  149  TCACGTCCCGTCAGGGGCCGCACATCCGCGTGGACGGCGTCTCCGG----------------------------  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  149  TCACGTCCCGTCAGGGGCCGCACATCCGCGTGGACGGCGTCTCCGGAGGGCCTGGCACTGTCATCTTTCCAGGC  222

Query  195  --------------------------------------------------AGGAATCCTTAACTTCTGTGCCAA  218
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCCCTTGCCCCACCTGAGCTGCTGTATCCATCTCCTCTCCTTCACCTCAGGAATCCTTAACTTCTGTGCCAA  296

Query  219  CAACTACCTGGGCCTGAGCAGCCACCCTGAGGTGATCCAGGCAGGTCTGCAGGCTCTGGAGGAGTTTGGAGCTG  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAACTACCTGGGCCTGAGCAGCCACCCTGAGGTGATCCAGGCAGGTCTGCAGGCTCTGGAGGAGTTTGGAGCTG  370

Query  293  GCCTCAGCTCTGTCCGCTTTATCTGTGGAACCCAGAGCATCCACAAGAATCTAGAAGCAAAAATAGCCCGCTTC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTCAGCTCTGTCCGCTTTATCTGTGGAACCCAGAGCATCCACAAGAATCTAGAAGCAAAAATAGCCCGCTTC  444

Query  367  CACCAGCGGGAGGATGCCATCCTCTATCCCAGCTGTTATGACGCCAACGCCGGCCTCTTTG-------------  427
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  445  CACCAGCGGGAGGATGCCATCCTCTATCCCAGCTGTTATGACGCCAACGCCGGCCTCTTTGAGAGCAGGGCGCT  518

Query  428  --------------------------------------------------------------------------  427
                                                                                      
Sbjct  519  GGTCCAGCCCGGCACTGAGACACGGGGGCCCCAGAGAGAAGCACAGAACACCTTGCCTCTCTACCCAGAGGAGC  592

Query  428  --------------------------------------------------------------------------  427
                                                                                      
Sbjct  593  GCCCTGGCTGGCAGTACAGTTTTTTGATTTGCTGGAGTCCCGGTCAAGGGAGAAGCCCAGGGTGGTTAAATGAT  666

Query  428  -------------------------AGGCCCTGCTGACCCCAGAGGACGCAGTCCTGTCGGACGAGCTGAACCA  476
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTCTACGCTCACTGCCTCCCTCCAGGCCCTGCTGACCCCAGAGGACGCAGTCCTGTCGGACGAGCTGAACCA  740

Query  477  TGCCTCCATCATCGACGGCATCCGGCTGTGCAAGGCCCACAAGTACCGCTATCGCCACCTGGACATGGCCGACC  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCCTCCATCATCGACGGCATCCGGCTGTGCAAGGCCCACAAGTACCGCTATCGCCACCTGGACATGGCCGACC  814

Query  551  TAGAAGCCAAGCTGCAGGAGGCCCAGAAGCATCGGCTGCGCCTGGTGGCCACTGATGGGGCCTTTTCCATGGAT  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGAAGCCAAGCTGCAGGAGGCCCAGAAGCATCGGCTGCGCCTGGTGGCCACTGATGGGGCCTTTTCCATGGAT  888

Query  625  GGCGACATCGCACCCCTGCAGGAGATCTGCTGCCTCGCCTCTAGATATGGTGCCCTGGTCTTCATGGATGAATG  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCGACATCGCACCCCTGCAGGAGATCTGCTGCCTCGCCTCTAGATATGGTGCCCTGGTCTTCATGGATGAATG  962

Query  699  CCATGCCACTGGCTTCCTGGGGCCCACAGGACGGGGCACAGATGAGCTGCTGGGTGTGATGGACCAGGTCACCA  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCATGCCACTGGCTTCCTGGGGCCCACAGGACGGGGCACAGATGAGCTGCTGGGTGTGATGGACCAGGTCACCA  1036

Query  773  TCATCAACTCCACCCTGGGGAAGGCCCTGGGTGGAGCATCAGGGGGCTACACGACAGGGCCTGGGCCCCTGGTG  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCATCAACTCCACCCTGGGGAAGGCCCTGGGTGGAGCATCAGGGGGCTACACGACAGGGCCTGGGCCCCTGGTG  1110

Query  847  TCCCTGCTGCGGCAGCGCGCCCGGCCATACCTCTTCTCCAACAGTCTGCCACCTGCTGTCGTTGGCTGCGCCTC  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCCTGCTGCGGCAGCGCGCCCGGCCATACCTCTTCTCCAACAGTCTGCCACCTGCTGTCGTTGGCTGCGCCTC  1184

Query  921  CAAGGCCCTAGATCTGCTGATGGGGAGTAACACCATTGTCCAGTCTATGGCTGCCAAGACCCAGA---------  985
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1185  CAAGGCCCTAGATCTGCTGATGGGGAGTAACACCATTGTCCAGTCTATGGCTGCCAAGACCCAGAGGTGCGACT  1258

Query  986  ---------------------------------GGTTCCGTAGTAAGATGGAAGCTGCTGGCTTCACTATCTCG  1026
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCAGCAGGGCAGGCTCGGGGGCGGAGAGACGTGGTTCCGTAGTAAGATGGAAGCTGCTGGCTTCACTATCTCG  1332

Query 1027  GGAGCCAGTCACCCCATCTGCCCTGTGATGCTGGGTGATGCCCGGCTGGCCTCTCGCATGGCGGATGACATGCT  1100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGAGCCAGTCACCCCATCTGCCCTGTGATGCTGGGTGATGCCCGGCTGGCCTCTCGCATGGCGGATGACATGCT  1406

Query 1101  GAAGAGAGGCATCTTTGTCATCGGGTTCAGCTACCCCGTGGTCCCCAAGGGCAAGGCCTGGATCCGGGTACAGA  1174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAGAGAGGCATCTTTGTCATCGGGTTCAGCTACCCCGTGGTCCCCAAGGGCAAGGCCCGGATCCGGGTACAGA  1480

Query 1175  TCTCAGCAGTGCATAGCGAGGAAGACATTGACCGCTGCGTGGAGGCCTTCGTGGAAGTGGGGCGACTGCACGGG  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTCAGCAGTGCATAGCGAGGAAGACATTGACCGCTGCGTGGAGGCCTTCGTGGAAGTGGGGCGACTGCACGGG  1554

Query 1249  GCACTGCCC  1257
            |||||||||
Sbjct 1555  GCACTGCCC  1563