Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479151
• Subject: XM_017028676.2
• Aligned Length: 1485
• Identities: 1255
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  ATGTGGCCTGGGAACGCCTGGCGCGCCGCACTCTTCTGGGTGCCCCGCGGCCGCCGCGCACAGTCAGCGCTGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGCCTGGGAACGCCTGGCGCGCCGCACTCTTCTGGGTGCCCCGCGGCCGCCGCGCACAGTCAGCGCTGGC  74

Query   75  CCAGCTGCGTGGCATTCTGGAGGGGGAGCTGGAAGGCATCTGCGGAGCTGGCACTTGGAAGAGTGAGCGGGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCTGCGTGGCATTCTGGAGGGGGAGCTGGAAGGCATCCGCGGAGCTGGCACTTGGAAGAGTGAGCGGGTCA  148

Query  149  TCACGTCCCGTCAGGGGCCGCACATCCGCGTGGACGGCGTCTCCGGAGGAATCCTTAACTTCTGTGCCAACAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCACGTCCCGTCAGGGGCCGCACATCCGCGTGGACGGCGTCTCCGGAGGAATCCTTAACTTCTGTGCCAACAAC  222

Query  223  TACCTGGGCCTGAGCAGCCACCCTGAGGTGATCCAGGCAGGTCTGCAGGCTCTGGAGGAGTTTGGAGCTGGCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACCTGGGCCTGAGCAGCCACCCTGAGGTGATCCAGGCAGGTCTGCAGGCTCTGGAGGAGTTTGGAGCTGGCCT  296

Query  297  CAGCTCTGTCCGCTTTATCTGTGGAACCCAGAGCATCCACAAGAATCTAGAAGCAAAAATAGCCCGCTTCCACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCTCTGTCCGCTTTATCTGTGGAACCCAGAGCATCCACAAGAATCTAGAAGCAAAAATAGCCCGCTTCCACC  370

Query  371  AGCGGGAGGATGCCATCCTCTATCCCAGCTGTTATGACGCCAACGCCGGCCTCTTTG-----------------  427
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct  371  AGCGGGAGGATGCCATCCTCTATCCCAGCTGTTATGACGCCAACGCCGGCCTCTTTGAGAGCAGGGCGCTGGTC  444

Query  428  --------------------------------------------------------------------------  427
                                                                                      
Sbjct  445  CAGCCCGGCACTGAGACACGGGGGCCCCAGAGAGAAGCACAGAACACCTTGCCTCTCTACCCAGAGGAGCGCCC  518

Query  428  --------------------------------------------------------------------------  427
                                                                                      
Sbjct  519  TGGCTGGCAGTACAGTTTTTTGATTTGCTGGAGTCCCGGTCAAGGGAGAAGCCCAGGGTGGTTAAATGATGGCT  592

Query  428  ---------------------AGGCCCTGCTGACCCCAGAGGACGCAGTCCTGTCGGACGAGCTGAACCATGCC  480
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTACGCTCACTGCCTCCCTCCAGGCCCTGCTGACCCCAGAGGACGCAGTCCTGTCGGACGAGCTGAACCATGCC  666

Query  481  TCCATCATCGACGGCATCCGGCTGTGCAAGGCCCACAAGTACCGCTATCGCCACCTGGACATGGCCGACCTAGA  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCATCATCGACGGCATCCGGCTGTGCAAGGCCCACAAGTACCGCTATCGCCACCTGGACATGGCCGACCTAGA  740

Query  555  AGCCAAGCTGCAGGAGGCCCAGAAGCATCGGCTGCGCCTGGTGGCCACTGATGGGGCCTTTTCCATGGATGGCG  628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCCAAGCTGCAGGAGGCCCAGAAGCATCGGCTGCGCCTGGTGGCCACTGATGGGGCCTTTTCCATGGATGGCG  814

Query  629  ACATCGCACCCCTGCAGGAGATCTGCTGCCTCGCCTCTAGATATGGTGCCCTGGTCTTCATGGATGAATGCCAT  702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATCGCACCCCTGCAGGAGATCTGCTGCCTCGCCTCTAGATATGGTGCCCTGGTCTTCATGGATGAATGCCAT  888

Query  703  GCCACTGGCTTCCTGGGGCCCACAGGACGGGGCACAGATGAGCTGCTGGGTGTGATGGACCAGGTCACCATCAT  776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCACTGGCTTCCTGGGGCCCACAGGACGGGGCACAGATGAGCTGCTGGGTGTGATGGACCAGGTCACCATCAT  962

Query  777  CAACTCCACCCTGGGGAAGGCCCTGGGTGGAGCATCAGGGGGCTACACGACAGGGCCTGGGCCCCTGGTGTCCC  850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAACTCCACCCTGGGGAAGGCCCTGGGTGGAGCATCAGGGGGCTACACGACAGGGCCTGGGCCCCTGGTGTCCC  1036

Query  851  TGCTGCGGCAGCGCGCCCGGCCATACCTCTTCTCCAACAGTCTGCCACCTGCTGTCGTTGGCTGCGCCTCCAAG  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCTGCGGCAGCGCGCCCGGCCATACCTCTTCTCCAACAGTCTGCCACCTGCTGTCGTTGGCTGCGCCTCCAAG  1110

Query  925  GCCCTAGATCTGCTGATGGGGAGTAACACCATTGTCCAGTCTATGGCTGCCAAGACCCAGA-------------  985
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 1111  GCCCTAGATCTGCTGATGGGGAGTAACACCATTGTCCAGTCTATGGCTGCCAAGACCCAGAGGTGCGACTCCCA  1184

Query  986  -----------------------------GGTTCCGTAGTAAGATGGAAGCTGCTGGCTTCACTATCTCGGGAG  1030
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGGGCAGGCTCGGGGGCGGAGAGACGTGGTTCCGTAGTAAGATGGAAGCTGCTGGCTTCACTATCTCGGGAG  1258

Query 1031  CCAGTCACCCCATCTGCCCTGTGATGCTGGGTGATGCCCGGCTGGCCTCTCGCATGGCGGATGACATGCTGAAG  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAGTCACCCCATCTGCCCTGTGATGCTGGGTGATGCCCGGCTGGCCTCTCGCATGGCGGATGACATGCTGAAG  1332

Query 1105  AGAGGCATCTTTGTCATCGGGTTCAGCTACCCCGTGGTCCCCAAGGGCAAGGCCTGGATCCGGGTACAGATCTC  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGAGGCATCTTTGTCATCGGGTTCAGCTACCCCGTGGTCCCCAAGGGCAAGGCCCGGATCCGGGTACAGATCTC  1406

Query 1179  AGCAGTGCATAGCGAGGAAGACATTGACCGCTGCGTGGAGGCCTTCGTGGAAGTGGGGCGACTGCACGGGGCAC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCAGTGCATAGCGAGGAAGACATTGACCGCTGCGTGGAGGCCTTCGTGGAAGTGGGGCGACTGCACGGGGCAC  1480

Query 1253  TGCCC  1257
            |||||
Sbjct 1481  TGCCC  1485