Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479184
• Subject: XM_005255863.4
• Aligned Length: 3687
• Identities: 3338
• Gaps: 348

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGGGCATGAAGACCTGGTCGTCTCTGCTCCAGAACCTCAGCATGAGCCATGAGCCCAAGTCCCCTTCGCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGGGATGCTTTCCACCGCGACCAGGACCACCGCCACCGTCAACCCCCTCACCCCCTCGCCGCTCAATGGCGCCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGGTGCCCAGCGGCAGCCCCGCCACCAGCAGCGCGCTGTCGGCCCAGGCCGCGCCATCCTCCAGCTTTGCCGCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GCGCTGCGCAAGCTCGCCAAACAGGCGGAGGAGCCCAGAGGGTCCTCACTGAGCAGCGAGTCGTCCCCCGTGTC  296

Query    1  ----------------------------------------------------ATGGGCCCTATCATCGTCCCCC  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCTCCGGCCACCAACCACAGCTCCCCCGCCAGCACACCCAAGCGCGTGCCCATGGGCCCTATCATCGTCCCCC  370

Query   23  CTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGG  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGG  444

Query   97  AGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCC  170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCC  518

Query  171  GCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCT  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCT  592

Query  245  CCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCC  318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCC  666

Query  319  CCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTC  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTC  740

Query  393  ACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCT  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCT  814

Query  467  TCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCC  888

Query  541  ACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGA  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGA  962

Query  615  GCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGG  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGG  1036

Query  689  ACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAG  1110

Query  763  AAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCG  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCG  1184

Query  837  CGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCT  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCT  1258

Query  911  TCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTG  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTG  1332

Query  985  ACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCC  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCC  1406

Query 1059  GGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTG  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTG  1480

Query 1133  CTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAG  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAG  1554

Query 1207  GAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCG  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCG  1628

Query 1281  GCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAG  1354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAG  1702

Query 1355  GTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCA  1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCA  1776

Query 1429  CCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCT  1502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCT  1850

Query 1503  GCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCT  1576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCT  1924

Query 1577  GCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCG  1650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCG  1998

Query 1651  CCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGA  1724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGA  2072

Query 1725  GAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCG  1798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCG  2146

Query 1799  GACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAG  1872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAG  2220

Query 1873  TTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAA  1946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAA  2294

Query 1947  AGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCG  2020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCG  2368

Query 2021  TGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACC  2094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACC  2442

Query 2095  ACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCC  2168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCC  2516

Query 2169  GTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTG  2242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTG  2590

Query 2243  ATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGC  2316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGC  2664

Query 2317  GCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGC  2390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGC  2738

Query 2391  AGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAG  2464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  AGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAG  2812

Query 2465  CCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGTCTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGG  2538
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGTTGCTGCTTCCTTGTCTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGG  2886

Query 2539  AAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAG  2612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAG  2960

Query 2613  GCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACA  2686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACA  3034

Query 2687  TTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCA  2760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCA  3108

Query 2761  CATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCT  2834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCT  3182

Query 2835  GTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCG  2908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCG  3256

Query 2909  CCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGAC  2982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  CCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGAC  3330

Query 2983  CGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTG  3056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  CGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTG  3404

Query 3057  GCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTAC  3130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTAC  3478

Query 3131  AGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTG  3204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  AGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTG  3552

Query 3205  GCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACG  3278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  GCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACG  3626

Query 3279  AAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGATATCCCAGG  3339
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  AAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGATATCCCAGG  3687