Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479184
• Subject: XM_005255865.4
• Aligned Length: 3462
• Identities: 3338
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTTGGATTGAAGCCGCCTCTGTATTACTTACCAGGGTCCTCACTGAGCAGCGAGTCGTCCCCCGTGTCCTC  74

Query    1  -------------------------------------------------ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTG  25
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCGGCCACCAACCACAGCTCCCCCGCCAGCACACCCAAGCGCGTGCCCATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTG  148

Query   26  GGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGG  99
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGG  222

Query  100  AGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCT  173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCT  296

Query  174  CCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCC  247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCC  370

Query  248  CCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCC  321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCC  444

Query  322  AGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTCACT  395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTCACT  518

Query  396  GCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCC  469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCC  592

Query  470  CCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACC  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACC  666

Query  544  CCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCT  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCT  740

Query  618  CTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACG  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACG  814

Query  692  AGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAG  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAG  888

Query  766  GAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGA  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGA  962

Query  840  GCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCC  913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCC  1036

Query  914  TGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACC  987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACC  1110

Query  988  CCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGT  1061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGT  1184

Query 1062  GCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTG  1135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTG  1258

Query 1136  CCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAG  1209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAG  1332

Query 1210  AAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCC  1283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCC  1406

Query 1284  CCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTG  1357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTG  1480

Query 1358  GCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCC  1431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCC  1554

Query 1432  ACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCA  1505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCA  1628

Query 1506  CAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCC  1579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCC  1702

Query 1580  CGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCA  1653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCA  1776

Query 1654  CCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAA  1727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAA  1850

Query 1728  GTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGAC  1801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGAC  1924

Query 1802  CCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAGTTC  1875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAGTTC  1998

Query 1876  CTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGG  1949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGG  2072

Query 1950  GTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGG  2023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGG  2146

Query 2024  CCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACC  2097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACC  2220

Query 2098  CAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTC  2171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTC  2294

Query 2172  GCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATG  2245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATG  2368

Query 2246  AGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGCGCT  2319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGCGCT  2442

Query 2320  GAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGT  2393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGT  2516

Query 2394  GGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCT  2467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCT  2590

Query 2468  CTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGTCTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAG  2541
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGTTGCTGCTTCCTTGTCTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAG  2664

Query 2542  CTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCT  2615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCT  2738

Query 2616  GAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTC  2689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTC  2812

Query 2690  CTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACAT  2763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACAT  2886

Query 2764  CAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTC  2837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTC  2960

Query 2838  TGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCC  2911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCC  3034

Query 2912  CTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGG  2985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGG  3108

Query 2986  GACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCA  3059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCA  3182

Query 3060  AGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGA  3133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGA  3256

Query 3134  CACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCG  3207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  CACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCG  3330

Query 3208  GAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACGAAA  3281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACGAAA  3404

Query 3282  GTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGATATCCCAGG  3339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGATATCCCAGG  3462