Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479184
• Subject: XM_011522966.3
• Aligned Length: 3642
• Identities: 3338
• Gaps: 303

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCCATGAGCCCAAGTCCCCTTCGCTAGGGATGCTTTCCACCGCGACCAGGACCACCGCCACCGTCAACCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTCACCCCCTCGCCGCTCAATGGCGCCCTGGTGCCCAGCGGCAGCCCCGCCACCAGCAGCGCGCTGTCGGCCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGGCCGCGCCATCCTCCAGCTTTGCCGCCGCGCTGCGCAAGCTCGCCAAACAGGCGGAGGAGCCCAGAGGGTCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TCACTGAGCAGCGAGTCGTCCCCCGTGTCCTCTCCGGCCACCAACCACAGCTCCCCCGCCAGCACACCCAAGCG  296

Query    1  -------ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCG  67
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTGCCCATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCG  370

Query   68  CTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGA  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGA  444

Query  142  GGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCT  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCT  518

Query  216  GCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACC  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACC  592

Query  290  TCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTAC  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTAC  666

Query  364  CACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTCACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTA  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTCACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTA  740

Query  438  CCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTG  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTG  814

Query  512  CCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTG  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTG  888

Query  586  CACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTC  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTC  962

Query  660  TGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGC  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGC  1036

Query  734  GTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAG  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAG  1110

Query  808  GAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCT  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCT  1184

Query  882  GCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTG  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTG  1258

Query  956  AGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCG  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCG  1332

Query 1030  CCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCA  1406

Query 1104  TGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGT  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGT  1480

Query 1178  GGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAG  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAG  1554

Query 1252  GTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCAC  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCAC  1628

Query 1326  CAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGA  1399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGA  1702

Query 1400  TTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTG  1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTG  1776

Query 1474  GAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGT  1547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGT  1850

Query 1548  GCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCC  1621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCC  1924

Query 1622  CTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCC  1695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCC  1998

Query 1696  GGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCC  1769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCC  2072

Query 1770  ACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGG  1843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGG  2146

Query 1844  CCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAG  1917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAG  2220

Query 1918  GAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGA  1991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGA  2294

Query 1992  GGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGC  2065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGC  2368

Query 2066  TAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAG  2139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAG  2442

Query 2140  CGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAG  2213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAG  2516

Query 2214  ACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCC  2287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCC  2590

Query 2288  TGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGT  2361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGT  2664

Query 2362  GCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGT  2435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGT  2738

Query 2436  CTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGT  2509
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2739  CTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGTTGCTGCTTCCTTGT  2812

Query 2510  CTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAG  2583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAG  2886

Query 2584  CTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCA  2657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCA  2960

Query 2658  CTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGT  2731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGT  3034

Query 2732  GGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTG  2805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTG  3108

Query 2806  CAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAA  2879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAA  3182

Query 2880  CATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAA  2953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAA  3256

Query 2954  GGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAA  3027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  GGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAA  3330

Query 3028  GATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGA  3101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGA  3404

Query 3102  AGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCC  3175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  AGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCC  3478

Query 3176  TGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAG  3249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  TGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAG  3552

Query 3250  CGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCT  3323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  CGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCT  3626

Query 3324  GAAGGGATATCCCAGG  3339
            ||||||||||||||||
Sbjct 3627  GAAGGGATATCCCAGG  3642