Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479214
• Subject: XM_017023381.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1396
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAG----  70
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGGTAC  74

Query   71  --------------TTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC  130
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGCTGTGGGACATTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC  148

Query  131  TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG  222

Query  205  GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC  296

Query  279  GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA  370

Query  353  AAGTGCGATGCGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCAC  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTGCGATGCGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCAC  444

Query  427  CACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCAT  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCAT  518

Query  501  CGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGA  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGA  592

Query  575  ACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACG  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACG  666

Query  649  GCTGAGAAGATGGCGCTAACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGG  722
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCGAGAAGATGGCGCTCACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGG  740

Query  723  GCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAAT  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAAT  814

Query  797  TTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGC  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGC  888

Query  871  AAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTC  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTC  962

Query  945  AGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACT  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACT  1036

Query 1019  ACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAG  1092
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1037  ACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTA---------  1101

Query 1093  GGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCA  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  GGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCA  1175

Query 1167  GATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCG  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  GATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCG  1249

Query 1241  CGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTG  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  CGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTG  1323

Query 1315  AGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCA  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  AGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCA  1397

Query 1389  CGGGGCCATCCAGATTCAG  1407
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1398  CGGGGCCATCCAGATTCAG  1416