Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479214
• Subject: XM_024450329.1
• Aligned Length: 1473
• Identities: 1096
• Gaps: 375

Alignment

Query    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGTTGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGACTAGAAATCAATTGCCAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTGGATAGCATTGAAGCCAAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCACGAACAAGCAGCACAGCCC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACAAAGTGCGATGCGCTGTGC  370
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------ATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACAAAGTGCGATGCGCTGTGC  61

Query  371  CTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   62  CTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGC  135

Query  445  GGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  GGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCT  209

Query  519  CATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  CATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGG  283

Query  593  TACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCTGAGAAGATGGCGCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  284  TACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCCGAGAAGATGGCGCTC  357

Query  667  ACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  ACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAA  431

Query  741  GAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  GAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCG  505

Query  815  ACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  ACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGC  579

Query  889  CTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  CTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGCAC  653

Query  963  CCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGCAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  CCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGCAC  727

Query 1037  AGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGACACCTCCACATCGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  AGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGACACCTCCACATCGCC  801

Query 1111  CAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGGCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  CAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGGCA  875

Query 1185  GGACGGT------------------------------------------------------------------C  1192
            |||||||                                                                  |
Sbjct  876  GGACGGTCAGCTTCTAGAGGCCACCCGCATCCCCTGCCTCCTGGCCCCATCCGTCTTCAAAGCCAGCAGTGGCC  949

Query 1193  AGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCA  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  AGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCA  1023

Query 1267  CTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCACACGGCCGGGGCACAGAC  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  CTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCACACGGCCGGGGCACAGAC  1097

Query 1341  GGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCATCCAGATTCAG  1407
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  GGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCATCCAGATTCAG  1164