Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479266
• Subject: NM_144851.5
• Aligned Length: 1936
• Identities: 1666
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAA  74
            ||||||||.|..||||||.||.|||.||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||..||||...||||.
Sbjct    1  ATGGATGACACAGCTGATGGGGTGAAGATGGACGCTGGGGAGGTGACCTTAGTGAACCACGGCTCCACTTTCAG  74

Query   75  AACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCA  148
            ||||||||.||.||||||..||||.|||||||||||.||||||..|||||||||||||||||..||..|||.||
Sbjct   75  AACCCACCGCCCGCCACAGTCAGGCTTTCCAGAGGAGCAGCTTCTGCTTTCTGACCAGCAGAGCTTGCCTTTCA  148

Query  149  GGCAAGG-ACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGA  221
            ||||.|| || |||.||..|||||||.||.|||||.||||||||..||||.|||..||||...|||.|||||||
Sbjct  149  GGCAGGGTAC-TTTAGATGGATCTTTCACGTGTTCTACAAGAAGCCCAGCCTATCGTCCAGATTATCACTCAGA  221

Query  222  TAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGA  295
            |||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  222  TAACCCTTCCTCAGACAGTTTCCTTGGCTCAGGTGACGTAAGAACCTTTGGTCAAAGTGCAAATGGACAATGGA  295

Query  296  GAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGA  369
            |||||||.||.|||.|||||.|||||.|...|||||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct  296  GAAATTCCACTCCAGCGTCAGGCTCAGCGCCACAAAAACCAAGAAATAGCCGAAGTCTTTGCCTCGAAACCCGG  369

Query  370  AAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAA  443
            |||||||||||||||||||||||||..||||.|||.|||||.||.||.||||||||..|.|||||.||||||||
Sbjct  370  AAGACCTCAAGTGGATTATCAAACACCTTTGTGGGCAAGTCCAATCACCACTGCCACATGTCTGCGTATGAAAA  443

Query  444  ATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTCTTGAGCCCCAAGA  517
            .||.|||||.|||||.||||..|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  444  GTCATTTCCCATTAAGCCTGCCCCAAGTCCATCCTGGAGTGGGTCATGTCGTCGGAGTCTTTTAAGCCCTAAGA  517

Query  518  AAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGA-AAGAGAGGTTTACAGACAGCT  590
            |||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||.|.|||||||||||
Sbjct  518  AAACTCAGAGGCGACATTTCAGCACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAGAAG-GAGATCTACAGACAGCT  590

Query  591  GCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGAT  664
            |||.|||||||||||||||||.|||||...|.||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.|
Sbjct  591  GCTGCAGATGGTCACAGGGAAGCAGTTCTGTGTAGCGAAACCCACCACACATTTTCCGTTACGCCTGTCTCGGT  664

Query  665  GTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATT  738
            ||||||||||||.|||.||..|||||||||||||.|||||.|.|||.||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct  665  GTCTTAGTTCCAATAAGAACTCTTTGAAAGACTCGCTGTTGAGAAACGGAAACTCTTGTGCATCTCATGTCATT  738

Query  739  GGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTC  812
            ||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||...|||||.|||.||||||||||||.|.||||
Sbjct  739  GGTTCTGATACGTCATCCTCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTGCACAGGAGCAGTTGTCCCACAGTGCACATTC  812

Query  813  CCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACC  886
            |||.||.|||..|||||||||||||||.||||||||||||||.||||            ||||.||.|||||||
Sbjct  813  CCTGTCATCTGGTACCCCAGATGTTGCCTTTGGATCCAAAGACTCTG------------ATCCTCACCATCACC  874

Query  887  ACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTA  960
            .|.|||..||.|||||||||.|||.||||.||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  875  TCGCTGCACCTCATCAGCCAAATAGCTTACCAGCATCAAATACACAGTCCGAAGGGTCAGACTCTGTGATTTTA  948

Query  961  CTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAGAATT  1034
            ||.|||||||||||.||.|||||||||.||.||||..||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  949  CTTAAAGTGAAAGAATCTCAGACTCCAGCTTCCAGCCCTACGTTCTTCCAGGCAGAGCTATGGATCAAAGAATT  1022

Query 1035  AACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGC  1108
            ||||||.|||||||..||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||..||||||
Sbjct 1023  AACTAGCGTTTATGACTCTCGAGCTCGGGAAAGATTGCGCCGGATTGAAGAGCAGAAAGCATTGGCACTACAGC  1096

Query 1109  TTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTT  1182
            |||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||.|||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1097  TTCAAAACCAGCGACTGCAGGAGCAGGAACATGCAGTACTTGACTCCGTAGAGCTTCACCTTCGTGTGCCTCTT  1170

Query 1183  GAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACA--AAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGAT  1254
            |||||||||||||||||.||.|.||.||||||||| ||  ||||||| |.||..|..|.|||||.||||||||.
Sbjct 1171  GAAAAGGAGATTCCTGTCACAGCTGCCCAAGAAAC-CAGGAAAAAAA-GCCACCAGCTGACTGACAGTGAAGAC  1242

Query 1255  GAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGT  1328
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1243  GAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAAAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAACGGTAACCAGGATGAAGT  1316

Query 1329  TCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATG  1402
            .||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1317  CCTCAGTGAGGCATTCCGCTTGACCATTACACGCAAAGACATTCAGACTCTAAACCATCTAAACTGGCTCAATG  1390

Query 1403  ATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCA  1476
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1391  ATGAGATCATCAATTTCTACATGAACATGCTAATGGAACGCAGTAAAGAGAAGGGGTTTCCAAGTGTACATGCG  1464

Query 1477  TTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGA  1550
            |||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1465  TTTAATACCTTCTTCTTCACTAAGCTAAAAACAGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGCTGGACAAAGAAGGTGGA  1538

Query 1551  TGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTA  1624
            ||||||.||.|||||.||||||.||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1539  TGTATTCTCCGTTGATATTCTTCTGGTGCCCATTCACTTGGGTGTGCACTGGTGTCTAGCTGTTGTAGACTTTA  1612

Query 1625  GAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATAC  1698
            |||.|||||.|||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1613  GAAGGAAGAGTATCACCTACTATGATTCTATGGGTGGAATAAACAACGAGGCCTGCAGGATCCTCTTGCAATAC  1686

Query 1699  CTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAG  1772
            |||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1687  CTAAAACAAGAAAGTGTTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAACGGCTGGCAGCTCTTCAGCAAGAAGAG  1760

Query 1773  CCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCA  1846
            ||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1761  CCAGGAAATCCCACAGCAGATGAATGGGAGTGACTGTGGAATGTTTGCTTGCAAATATGCTGACTGCATTACCA  1834

Query 1847  AAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCAC  1920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1835  AAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATATTTCCGAAAGCGAATGGTCTGGGAGATCCTCCAC  1908

Query 1921  CGAAAACTCTTG  1932
            ||.||.||||||
Sbjct 1909  CGGAAGCTCTTG  1920