Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479266
• Subject: XM_006520880.2
• Aligned Length: 2110
• Identities: 1667
• Gaps: 194

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAAACCCCCTTAACTGCCGCCGTCTCCTTACCTGGCTCATCGCCTCTTGGATTCTGTGTCTTTACTAAAGC  74

Query    1  ----------------------ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAG  52
                                  ||||||||.|..||||||.||.|||.||||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct   75  CAGTGATGTGAAGAGACCTGAAATGGATGACACAGCTGATGGGGTGAAGATGGACGCTGGGGAGGTGACCTTAG  148

Query   53  TGAACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCT  126
            ||||||||..||||...||||.||||||||.||.||||||..||||.|||||||||||.||||||..|||||||
Sbjct  149  TGAACCACGGCTCCACTTTCAGAACCCACCGCCCGCCACAGTCAGGCTTTCCAGAGGAGCAGCTTCTGCTTTCT  222

Query  127  GACCAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGG-ACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTT  199
            ||||||||||..||..|||.||||||.|| || |||.||..|||||||.||.|||||.||||||||..||||.|
Sbjct  223  GACCAGCAGAGCTTGCCTTTCAGGCAGGGTAC-TTTAGATGGATCTTTCACGTGTTCTACAAGAAGCCCAGCCT  295

Query  200  ATAATCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGC  273
            ||..||||...|||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.
Sbjct  296  ATCGTCCAGATTATCACTCAGATAACCCTTCCTCAGACAGTTTCCTTGGCTCAGGTGACGTAAGAACCTTTGGT  369

Query  274  CAGAGTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCG  347
            ||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||.|||||.|...|||||||.|||||||.|||||
Sbjct  370  CAAAGTGCAAATGGACAATGGAGAAATTCCACTCCAGCGTCAGGCTCAGCGCCACAAAAACCAAGAAATAGCCG  443

Query  348  AAGTCTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACT  421
            ||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||.|||.|||||.||.||.||||
Sbjct  444  AAGTCTTTGCCTCGAAACCCGGAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACACCTTTGTGGGCAAGTCCAATCACCACT  517

Query  422  GCCATGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGT  495
            ||||..|.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||..|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  518  GCCACATGTCTGCGTATGAAAAGTCATTTCCCATTAAGCCTGCCCCAAGTCCATCCTGGAGTGGGTCATGTCGT  591

Query  496  CGAAGTCTCTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGA  569
            ||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  CGGAGTCTTTTAAGCCCTAAGAAAACTCAGAGGCGACATTTCAGCACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGA  665

Query  570  -AAGAGAGGTTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACAT  642
             ||| |||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||...|.||||.|||||||||||||||
Sbjct  666  GAAG-GAGATCTACAGACAGCTGCTGCAGATGGTCACAGGGAAGCAGTTCTGTGTAGCGAAACCCACCACACAT  738

Query  643  TTTCCTTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAA  716
            |||||.||||.|||||||||.|||||||||||||.|||.||..|||||||||||||.|||||.|.|||.|||||
Sbjct  739  TTTCCGTTACGCCTGTCTCGGTGTCTTAGTTCCAATAAGAACTCTTTGAAAGACTCGCTGTTGAGAAACGGAAA  812

Query  717  CTCTTGTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAAC  790
            |||||||||||||||..|||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||...|||||.|
Sbjct  813  CTCTTGTGCATCTCATGTCATTGGTTCTGATACGTCATCCTCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTGCACAGGAGC  886

Query  791  AGCTGTCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACT  864
            ||.||||||||||||.|.|||||||.||.|||..|||||||||||||||.||||||||||||||.||||     
Sbjct  887  AGTTGTCCCACAGTGCACATTCCCTGTCATCTGGTACCCCAGATGTTGCCTTTGGATCCAAAGACTCTG-----  955

Query  865  CTTCATCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGA  938
                   ||||.||.|||||||.|.|||..||.|||||||||.|||.||||.||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  956  -------ATCCTCACCATCACCTCGCTGCACCTCATCAGCCAAATAGCTTACCAGCATCAAATACACAGTCCGA  1022

Query  939  AGGATCAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTT---------------  997
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.||.||||.|               
Sbjct 1023  AGGGTCAGACTCTGTGATTTTACTTAAAGTGAAAGAATCTCAGACTCCAGCTTCCAGATACCTCAGTCCATTGA  1096

Query  998  ---------------------------------------------------------------CTACTTTCTTC  1008
                                                                           ||||.||||||
Sbjct 1097  AGAGACGTTCTTGCCCCTACATTATTCCTTATTCAGCAGTCATGGATCTGCTCTCTAGCAGCCCTACGTTCTTC  1170

Query 1009  CAGGCAGAGCTGTGGATCAAAGAATTAACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGA  1082
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.||.|||||||||||||.||||||
Sbjct 1171  CAGGCAGAGCTATGGATCAAAGAATTAACTAGCGTTTATGACTCTCGAGCTCGGGAAAGATTGCGCCGGATTGA  1244

Query 1083  AGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAG  1156
            |||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||.|||.||.|
Sbjct 1245  AGAGCAGAAAGCATTGGCACTACAGCTTCAAAACCAGCGACTGCAGGAGCAGGAACATGCAGTACTTGACTCCG  1318

Query 1157  TAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACA--AAAAAAAG  1228
            ||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|.||.||||||||| ||  ||||||| 
Sbjct 1319  TAGAGCTTCACCTTCGTGTGCCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTCACAGCTGCCCAAGAAAC-CAGGAAAAAAA-  1390

Query 1229  GTCATAAATTAACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTA  1302
            |.||..|..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1391  GCCACCAGCTGACTGACAGTGAAGACGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAAAAAGAAATAAAGAATGTA  1464

Query 1303  TTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAAC  1376
            ||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1465  TTTCGTAACGGTAACCAGGATGAAGTCCTCAGTGAGGCATTCCGCTTGACCATTACACGCAAAGACATTCAGAC  1538

Query 1377  TCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAG  1450
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1539  TCTAAACCATCTAAACTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAACATGCTAATGGAACGCAGTAAAG  1612

Query 1451  AGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCA  1524
            |||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1613  AGAAGGGGTTTCCAAGTGTACATGCGTTTAATACCTTCTTCTTCACTAAGCTAAAAACAGCTGGTTATCAGGCA  1686

Query 1525  GTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACA  1598
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct 1687  GTGAAACGCTGGACAAAGAAGGTGGATGTATTCTCCGTTGATATTCTTCTGGTGCCCATTCACTTGGGTGTGCA  1760

Query 1599  CTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATG  1672
            ||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1761  CTGGTGTCTAGCTGTTGTAGACTTTAGAAGGAAGAGTATCACCTACTATGATTCTATGGGTGGAATAAACAACG  1834

Query 1673  AAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAAT  1746
            |.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1835  AGGCCTGCAGGATCCTCTTGCAATACCTAAAACAAGAAAGTGTTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAAC  1908

Query 1747  GGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGC  1820
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1909  GGCTGGCAGCTCTTCAGCAAGAAGAGCCAGGAAATCCCACAGCAGATGAATGGGAGTGACTGTGGAATGTTTGC  1982

Query 1821  CTGCAAATATGCTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGA  1894
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1983  TTGCAAATATGCTGACTGCATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATATTTCCGAA  2056

Query 1895  AGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG  1932
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2057  AGCGAATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGGAAGCTCTTG  2094