Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479266
• Subject: XM_006520882.3
• Aligned Length: 2014
• Identities: 1667
• Gaps: 98

Alignment

Query    1  ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAA  74
            ||||||||.|..||||||.||.|||.||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||..||||...||||.
Sbjct    1  ATGGATGACACAGCTGATGGGGTGAAGATGGACGCTGGGGAGGTGACCTTAGTGAACCACGGCTCCACTTTCAG  74

Query   75  AACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCA  148
            ||||||||.||.||||||..||||.|||||||||||.||||||..|||||||||||||||||..||..|||.||
Sbjct   75  AACCCACCGCCCGCCACAGTCAGGCTTTCCAGAGGAGCAGCTTCTGCTTTCTGACCAGCAGAGCTTGCCTTTCA  148

Query  149  GGCAAGG-ACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGA  221
            ||||.|| || |||.||..|||||||.||.|||||.||||||||..||||.|||..||||...|||.|||||||
Sbjct  149  GGCAGGGTAC-TTTAGATGGATCTTTCACGTGTTCTACAAGAAGCCCAGCCTATCGTCCAGATTATCACTCAGA  221

Query  222  TAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGA  295
            |||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  222  TAACCCTTCCTCAGACAGTTTCCTTGGCTCAGGTGACGTAAGAACCTTTGGTCAAAGTGCAAATGGACAATGGA  295

Query  296  GAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGA  369
            |||||||.||.|||.|||||.|||||.|...|||||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct  296  GAAATTCCACTCCAGCGTCAGGCTCAGCGCCACAAAAACCAAGAAATAGCCGAAGTCTTTGCCTCGAAACCCGG  369

Query  370  AAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAA  443
            |||||||||||||||||||||||||..||||.|||.|||||.||.||.||||||||..|.|||||.||||||||
Sbjct  370  AAGACCTCAAGTGGATTATCAAACACCTTTGTGGGCAAGTCCAATCACCACTGCCACATGTCTGCGTATGAAAA  443

Query  444  ATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTCTTGAGCCCCAAGA  517
            .||.|||||.|||||.||||..|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  444  GTCATTTCCCATTAAGCCTGCCCCAAGTCCATCCTGGAGTGGGTCATGTCGTCGGAGTCTTTTAAGCCCTAAGA  517

Query  518  AAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGA-AAGAGAGGTTTACAGACAGCT  590
            |||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||.|.|||||||||||
Sbjct  518  AAACTCAGAGGCGACATTTCAGCACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAGAAG-GAGATCTACAGACAGCT  590

Query  591  GCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGAT  664
            |||.|||||||||||||||||.|||||...|.||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.|
Sbjct  591  GCTGCAGATGGTCACAGGGAAGCAGTTCTGTGTAGCGAAACCCACCACACATTTTCCGTTACGCCTGTCTCGGT  664

Query  665  GTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATT  738
            ||||||||||||.|||.||..|||||||||||||.|||||.|.|||.||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct  665  GTCTTAGTTCCAATAAGAACTCTTTGAAAGACTCGCTGTTGAGAAACGGAAACTCTTGTGCATCTCATGTCATT  738

Query  739  GGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTC  812
            ||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||...|||||.|||.||||||||||||.|.||||
Sbjct  739  GGTTCTGATACGTCATCCTCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTGCACAGGAGCAGTTGTCCCACAGTGCACATTC  812

Query  813  CCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACC  886
            |||.||.|||..|||||||||||||||.||||||||||||||.||||            ||||.||.|||||||
Sbjct  813  CCTGTCATCTGGTACCCCAGATGTTGCCTTTGGATCCAAAGACTCTG------------ATCCTCACCATCACC  874

Query  887  ACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTA  960
            .|.|||..||.|||||||||.|||.||||.||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  875  TCGCTGCACCTCATCAGCCAAATAGCTTACCAGCATCAAATACACAGTCCGAAGGGTCAGACTCTGTGATTTTA  948

Query  961  CTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTT-------------------------------------  997
            ||.|||||||||||.||.|||||||||.||.||||.|                                     
Sbjct  949  CTTAAAGTGAAAGAATCTCAGACTCCAGCTTCCAGATACCTCAGTCCATTGAAGAGACGTTCTTGCCCCTACAT  1022

Query  998  -----------------------------------------CTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAG  1030
                                                     ||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1023  TATTCCTTATTCAGCAGTCATGGATCTGCTCTCTAGCAGCCCTACGTTCTTCCAGGCAGAGCTATGGATCAAAG  1096

Query 1031  AATTAACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTA  1104
            ||||||||||.|||||||..||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||..||
Sbjct 1097  AATTAACTAGCGTTTATGACTCTCGAGCTCGGGAAAGATTGCGCCGGATTGAAGAGCAGAAAGCATTGGCACTA  1170

Query 1105  CAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACC  1178
            |||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||.|||.||.|||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1171  CAGCTTCAAAACCAGCGACTGCAGGAGCAGGAACATGCAGTACTTGACTCCGTAGAGCTTCACCTTCGTGTGCC  1244

Query 1179  TCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACA--AAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGA  1250
            |||||||||||||||||||||.||.|.||.||||||||| ||  ||||||| |.||..|..|.|||||.|||||
Sbjct 1245  TCTTGAAAAGGAGATTCCTGTCACAGCTGCCCAAGAAAC-CAGGAAAAAAA-GCCACCAGCTGACTGACAGTGA  1316

Query 1251  AGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATG  1324
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1317  AGACGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAAAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAACGGTAACCAGGATG  1390

Query 1325  AAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTC  1398
            ||||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1391  AAGTCCTCAGTGAGGCATTCCGCTTGACCATTACACGCAAAGACATTCAGACTCTAAACCATCTAAACTGGCTC  1464

Query 1399  AATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCA  1472
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1465  AATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAACATGCTAATGGAACGCAGTAAAGAGAAGGGGTTTCCAAGTGTACA  1538

Query 1473  TGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAG  1546
            |||.|||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1539  TGCGTTTAATACCTTCTTCTTCACTAAGCTAAAAACAGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGCTGGACAAAGAAGG  1612

Query 1547  TAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGAC  1620
            |.||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1613  TGGATGTATTCTCCGTTGATATTCTTCTGGTGCCCATTCACTTGGGTGTGCACTGGTGTCTAGCTGTTGTAGAC  1686

Query 1621  TTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCA  1694
            |||||||.|||||.|||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1687  TTTAGAAGGAAGAGTATCACCTACTATGATTCTATGGGTGGAATAAACAACGAGGCCTGCAGGATCCTCTTGCA  1760

Query 1695  ATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGA  1768
            |||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1761  ATACCTAAAACAAGAAAGTGTTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAACGGCTGGCAGCTCTTCAGCAAGA  1834

Query 1769  AAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATT  1842
            |.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1835  AGAGCCAGGAAATCCCACAGCAGATGAATGGGAGTGACTGTGGAATGTTTGCTTGCAAATATGCTGACTGCATT  1908

Query 1843  ACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCT  1916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1909  ACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATATTTCCGAAAGCGAATGGTCTGGGAGATCCT  1982

Query 1917  CCACCGAAAACTCTTG  1932
            ||||||.||.||||||
Sbjct 1983  CCACCGGAAGCTCTTG  1998