Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479266
• Subject: XM_006719361.3
• Aligned Length: 2028
• Identities: 1929
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAAATCCCCTTAACTGCCACAATTTGCTTACCTGGCTCATCGCCTCCTGGACTTTGTATCTTTGCTAAAGT  74

Query    1  ----------------------ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAG  52
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGTGATGTGAAAAGACTTGAAATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAG  148

Query   53  TGAACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCT  126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCT  222

Query  127  GACCAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTA  200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTA  296

Query  201  TAATCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCC  274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAATCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCC  370

Query  275  AGAGTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGA  348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGA  444

Query  349  AGTCTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTG  422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTCTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTG  518

Query  423  CCATGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTC  496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCATGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTC  592

Query  497  GAAGTCTCTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAA  570
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGTCTTTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAA  666

Query  571  AGAGAGGTTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTT  644
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAGAGATTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTT  740

Query  645  TCCTTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACT  718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACT  814

Query  719  CTTGTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAG  792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTGTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAG  888

Query  793  CTGTCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCT  866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCT  962

Query  867  TCATCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAG  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCATCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAG  1036

Query  941  GATCAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCA  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GATCAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCA  1110

Query 1015  GAGCTGTGGATCAAAGAATTAACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACA  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGCTGTGGATCAAAGAATTAACTAGTGTTTATGATTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACA  1184

Query 1089  GAAGGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAAC  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAAC  1258

Query 1163  TACATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAA  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TACATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAA  1332

Query 1237  TTAACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAA  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTAACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAA  1406

Query 1311  TGGGAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACC  1384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGGAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACC  1480

Query 1385  ATCTGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGC  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCTGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGC  1554

Query 1459  TTGCCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACG  1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTGCCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACG  1628

Query 1533  TTGGACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTC  1606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTGGACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTC  1702

Query 1607  TAGCTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGC  1680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TAGCTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGC  1776

Query 1681  AGAATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCA  1754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGAATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCA  1850

Query 1755  GCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAAT  1828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAAT  1924

Query 1829  ATGCTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATG  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATGCTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATG  1998

Query 1903  GTCTGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG  1932
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTCTGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG  2028