Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479266
- Subject:
- XM_011538244.3
- Aligned Length:
- 2028
- Identities:
- 1890
- Gaps:
- 135
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAAATCCCCTTAACTGCCACAATTTGCTTACCTGGCTCATCGCCTCCTGGACTTTGTATCTTTGCTAAAGT 74
Query 1 ----------------------ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAG 52
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGTGATGTGAAAAGACTTGAAATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAG 148
Query 53 TGAACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCT 126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGAACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCT 222
Query 127 GACCAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACCAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTA 296
Query 201 TAATCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCC 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAATCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCC 370
Query 275 AGAGTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGA 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAGTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGA 444
Query 349 AGTCTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTG 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGTCTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTG 518
Query 423 CCATGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTC 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCATGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTC 592
Query 497 GAAGTCTCTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAA 570
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAGTCTTTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAA 666
Query 571 AGAGAGGTTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTT 644
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAGAGATTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTT 740
Query 645 TCCTTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACT 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCTTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACT 814
Query 719 CTTGTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAG 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTTGTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAG 888
Query 793 CTGTCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCT 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGTCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCT 962
Query 867 TCATCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAG 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCATCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAG 1036
Query 941 GATCAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCA 1014
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GATCAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAG------------------- 1091
Query 1015 GAGCTGTGGATCAAAGAATTAACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACA 1088
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 --------------------AACTAGTGTTTATGATTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACA 1145
Query 1089 GAAGGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAAC 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 GAAGGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAAC 1219
Query 1163 TACATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAA 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 TACATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAA 1293
Query 1237 TTAACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAA 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 TTAACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAA 1367
Query 1311 TGGGAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACC 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 TGGGAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACC 1441
Query 1385 ATCTGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGC 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 ATCTGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGC 1515
Query 1459 TTGCCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACG 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 TTGCCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACG 1589
Query 1533 TTGGACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTC 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1590 TTGGACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTC 1663
Query 1607 TAGCTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGC 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664 TAGCTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGC 1737
Query 1681 AGAATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCA 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 AGAATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCA 1811
Query 1755 GCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAAT 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812 GCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAAT 1885
Query 1829 ATGCTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATG 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886 ATGCTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATG 1959
Query 1903 GTCTGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG 1932
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1960 GTCTGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG 1989