Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479266
• Subject: XM_011538245.3
• Aligned Length: 1980
• Identities: 1928
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  -----------------------------------------AT-------GGATGATATTGCTGATAGGATGAG  26
                                                     ||       .|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAAATCCCCTTAACTGCCACAATTTGCTTACCTGGCTCATCGCCTCCTGATGATATTGCTGATAGGATGAG  74

Query   27  GATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTT  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTT  148

Query  101  TTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTT  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTT  222

Query  175  ACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGG  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGG  296

Query  249  CTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCAT  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCAT  370

Query  323  CTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGT  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGT  444

Query  397  TTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAG  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAG  518

Query  471  TCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTCTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAG  544
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTTTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAG  592

Query  545  CAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAAAGAGAGGTTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTT  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAAAGAGAGATTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTT  666

Query  619  ACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAA  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAA  740

Query  693  AGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTG  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTG  814

Query  767  CCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCA  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCA  888

Query  841  TTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTT  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTT  962

Query  915  AGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAA  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAA  1036

Query  989  CTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAGAATTAACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGA  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1037  CTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAGAATTAACTAGTGTTTATGATTCTCGAGCACGA  1110

Query 1063  GAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGA  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGA  1184

Query 1137  ACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCC  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCC  1258

Query 1211  AAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAG  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAG  1332

Query 1285  AAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTAC  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTAC  1406

Query 1359  ACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGC  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGC  1480

Query 1433  TGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAA  1506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAA  1554

Query 1507  ACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCC  1580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCC  1628

Query 1581  CATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCA  1654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCA  1702

Query 1655  TGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGG  1728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGG  1776

Query 1729  AAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAG  1802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAG  1850

Query 1803  TGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAAC  1876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAAC  1924

Query 1877  ACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG  1932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG  1980