Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479266
• Subject: XM_017019231.2
• Aligned Length: 2025
• Identities: 1927
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGACAAGATTTTGCCTTATTTCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCCATTCGTCTGCCTCAGC  74

Query    1  -------------------ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGA  55
                               |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCCAAAGTGCTAGTATTACAGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGA  148

Query   56  ACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGAC  129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGAC  222

Query  130  CAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAA  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAA  296

Query  204  TCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGA  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGA  370

Query  278  GTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGT  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGT  444

Query  352  CTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCA  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCA  518

Query  426  TGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAA  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAA  592

Query  500  GTCTCTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAAAGA  573
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCTTTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAAAGA  666

Query  574  GAGGTTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCC  647
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGATTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCC  740

Query  648  TTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTT  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTT  814

Query  722  GTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTG  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTG  888

Query  796  TCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCA  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCA  962

Query  870  TCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGAT  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGAT  1036

Query  944  CAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCAGAG  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCAGAG  1110

Query 1018  CTGTGGATCAAAGAATTAACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAA  1091
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGTGGATCAAAGAATTAACTAGTGTTTATGATTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAA  1184

Query 1092  GGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTAC  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTAC  1258

Query 1166  ATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAATTA  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAATTA  1332

Query 1240  ACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGG  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGG  1406

Query 1314  GAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATC  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATC  1480

Query 1388  TGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTG  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTG  1554

Query 1462  CCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTG  1535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTG  1628

Query 1536  GACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAG  1609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAG  1702

Query 1610  CTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGA  1683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGA  1776

Query 1684  ATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCT  1757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCT  1850

Query 1758  TTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATG  1831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATG  1924

Query 1832  CTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTC  1905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTC  1998

Query 1906  TGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG  1932
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG  2025