Nucleotide Global Alignment
Description
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- TRCN0000479298
- Subject:
- XM_024450207.1
- Aligned Length:
- 4185
- Identities:
- 3961
- Gaps:
- 222
Alignment
Query 1 ATGATGGAGATCCAGATGGACGAGGGCGGCGGCGTGGTGGTGTACCAGGACGACTACTGCTCCGGCTCGGTGAT 74
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Sbjct 1 ATGATGGAGATCCAGATGGACGAGGGCGGCGGCGTGGTGGTGTACCAGGACGACTACTGCTCCGGCTCGGTGAT 74
Query 75 GTCGGAGCGGGTGTCGGGCCTGGCGGGCTCCATCTACCGCGAGTTCGAGCGCCTCATCCACTGCTACGACGAGG 148
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Sbjct 75 GTCGGAGCGGGTGTCGGGCCTGGCGGGCTCCATCTACCGCGAGTTCGAGCGCCTCATCCACTGCTACGACGAGG 148
Query 149 AGGTGGTCAAGGAGCTCATGCCGCTGGTGGTGAACGTGCTGGAGAACCTAGACTCGGTGCTCAGCGAGAACCAG 222
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Sbjct 149 AGGTGGTCAAGGAGCTCATGCCGCTGGTGGTGAACGTGCTGGAGAACCTAGACTCGGTGCTCAGCGAGAACCAG 222
Query 223 GAGCACGAGGTGGAGCTGGAGCTGCTGCGCGAGGACAACGAGCAGCTGCTCACCCAGTACGAGCGTGAGAAGGC 296
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Sbjct 223 GAGCACGAGGTGGAGCTGGAGCTGCTGCGCGAGGACAACGAGCAGCTGCTCACCCAGTACGAGCGTGAGAAGGC 296
Query 297 GCTGCGCAGGCAGGCGGAGGAGAAATTCATTGAGTTTGAAGATGCTCTGGAACAAGAGAAGAAAGAGCTGCAAA 370
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Sbjct 297 GCTGCGCAGGCAGGCGGAGGAGAAATTCATTGAGTTTGAAGATGCTCTGGAACAAGAGAAGAAAGAGCTGCAAA 370
Query 371 TCCAGGTGGAGCACTACGAGTTCCAGACGCGCCAGCTGGAGCTGAAGGCCAAGAACTATGCCGATCAGATTTCC 444
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Sbjct 371 TCCAGGTGGAGCACTACGAGTTCCAGACGCGCCAGCTGGAGCTGAAGGCCAAGAACTATGCCGATCAGATTTCC 444
Query 445 CGGTTGGAGGAGCGGGAGTCGGAGATGAAGAAGGAGTACAATGCCCTGCACCAGCGGCACACAGAGATGATACA 518
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Sbjct 445 CGGTTGGAGGAGCGGGAGTCGGAGATGAAGAAGGAGTACAATGCCCTGCACCAGCGGCACACAGAGATGATACA 518
Query 519 GACCTACGTGGAGCACATTGAGAGGTCCAAGATGCAGCAGGTCGGAGGAAACAGCCAGACCGAGAGCAGCCTGC 592
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Sbjct 519 GACCTACGTGGAGCACATTGAGAGGTCCAAGATGCAGCAGGTCGGAGGAAACAGCCAGACCGAGAGCAGCCTGC 592
Query 593 CGGGGCGG---------------------------AGGAAGGAGCGCCCCACCTCCCTGAACGTGTTCCCCCTG 639
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Sbjct 593 CGGGGCGGAGTCCTCGTCAGTCGTGGAGGAAAAGCAGGAAGGAGCGCCCCACCTCCCTGAACGTGTTCCCCCTG 666
Query 640 GCTGACGGCACGGTACGTGCACAGATCGGGGGCAAGCTCGTGCCTGCGGGGGACCACTGGCACCTGAGTGACCT 713
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Sbjct 667 GCTGACGGCACGGTACGTGCACAGATCGGGGGCAAGCTCGTGCCTGCGGGGGACCACTGGCACCTGAGTGACCT 740
Query 714 CGGCCAGCTGCAGTCCAGCTCCAGCTACCAGTGTCCACAGGATGAAATGTCCGAGTCAGGCCAGTCCTCGGCGG 787
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Sbjct 741 CGGCCAGCTGCAGTCCAGCTCCAGCTACCAGTGTCCACAGGATGAAATGTCCGAGTCAGGCCAGTCCTCGGCGG 814
Query 788 CCGCCACACCCAGCACCACAGGCACCAAGTCCAACACGCCCACATCCTCCGTGCCCTCGGCCGCCGTCACACCC 861
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Sbjct 815 CCGCCACACCCAGCACCACAGGCACCAAGTCCAACACGCCCACATCCTCCGTGCCCTCGGCCGCCGTCACACCC 888
Query 862 CTCAACGAGAGCCTGCAGCCCCTGGGGGACTATGGCGTGGGCTCCAAGAACAGCAAGCGTGCCCGGGAGAAGCG 935
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Sbjct 889 CTCAACGAGAGCCTGCAGCCCCTGGGGGACTATGGCGTGGGCTCCAAGAACAGCAAGCGTGCCCGGGAGAAGCG 962
Query 936 CGACAGCCGCAACATGGAAGTACAGGTCACCCAGGAGATGCGCAACGTCAGTATAGGCATGGGCAGCAGTGACG 1009
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Sbjct 963 CGACAGCCGCAACATGGAAGTACAGGTCACCCAGGAGATGCGCAACGTCAGTATAGGCATGGGCAGCAGTGACG 1036
Query 1010 AGTGGTCTGATGTTCAAGACATTATTGACTCCACGCCAGAGCTGGACATGTGTCCAGAGACCCGCCTGGACCGC 1083
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Sbjct 1037 AGTGGTCTGATGTTCAAGACATTATTGACTCCACGCCAGAGCTGGACATGTGTCCAGAGACCCGCCTGGACCGC 1110
Query 1084 ACAGGAAGCAGCCCAACCCAGGGCATCGTGAACAAAGCTTTCGGCATCAACACCGACTCCCTGTACCATGAGCT 1157
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Sbjct 1111 ACAGGAAGCAGCCCAACCCAGGGCATCGTGAACAAAGCTTTCGGCATCAACACCGACTCCCTGTACCATGAGCT 1184
Query 1158 GTCGACGGCAGGGTCTGAGGTCATCGGGGATGTGGACGAAGGGGCCGACCTCCTAGGGGAGTTCTCAGTGCGCG 1231
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Sbjct 1185 GTCGACGGCAGGGTCTGAGGTCATCGGGGATGTGGACGAAGGGGCCGACCTCCTAGGGGAGTTCTCA------- 1251
Query 1232 ATGATTTCTTTGGAATGGGCAAAGAAGTGGGGAATCTGCTACTGGAAAACTCACAGCTTCTGGAAACCAAAAAC 1305
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Sbjct 1252 -----------GGAATGGGCAAAGAAGTGGGGAATCTGCTACTGGAAAACTCACAGCTTCTGGAAACCAAAAAC 1314
Query 1306 GCCTTGAATGTGGTGAAGAATGACCTGATTGCCAAGGTCGACCAGCTGTCCGGGGAGCAGGAGGTGCTGAGGGG 1379
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Sbjct 1315 GCCTTGAATGTGGTGAAGAATGACCTGATTGCCAAGGTCGACCAGCTGTCCGGGGAGCAGGAGGTGCTGAGGGG 1388
Query 1380 CGAGTTGGAGGCTGCTAAGCAGGCCAAAGTCAAGCTGGAAAACCGTATCAAGGAGCTGGAAGAGGAACTGAAAA 1453
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Sbjct 1389 CGAGTTGGAGGCTGCTAAGCAGGCCAAAGTCAAGCTGGAAAACCGTATCAAGGAGCTGGAAGAGGAACTGAAAA 1462
Query 1454 GAGTGAAGTCCGAGGCCATCATCGCCCGCCGTGAACCCAAAGAAGAGGCGGAGGATGTAAGCAGCTATCTCTGT 1527
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Sbjct 1463 GAGTGAAGTCCGAGGCCATCATCGCCCGCCGTGAACCCAAAGAAGAGGCGGAGGAT------------------ 1518
Query 1528 ACAGAATCGGACAAAATCCCCATGGCCCAGCGCCGCCGCTTCACGCGGGTGGAGATGGCCCGTGTGCTCATGGA 1601
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Sbjct 1519 ---------GACAAAATCCCCATGGCCCAGCGCCGCCGCTTCACGCGGGTGGAGATGGCCCGTGTGCTCATGGA 1583
Query 1602 GCGGAACCAGTACAAGGAGCGGCTGATGGAGCTGCAGGAGGCTGTGCGGTGGACTGAGATGATCAGAGCGTCCC 1675
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Sbjct 1584 GCGGAACCAGTACAAGGAGCGGCTGATGGAGCTGCAGGAGGCTGTGCGGTGGACTGAGATGATCAGAGCGTCCC 1657
Query 1676 GAGAGCACCCATCCGTCCAGGAGAAGAAGAAGTCGACCATCTGGCAGTTCTTCAGCCGCCTCTTCAGCTCTTCC 1749
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Sbjct 1658 GAGAGCACCCATCCGTCCAGGAGAAGAAGAAGTCGACCATCTGGCAGTTCTTCAGCCGCCTCTTCAGCTCTTCC 1731
Query 1750 TCCAGCCCCCCTCCGGCCAAGCGCCCCTATCCCTCGGTGAACATCCACTACAAGTCACCCACCACTGCCGGCTT 1823
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Sbjct 1732 TCCAGCCCCCCTCCGGCCAAGCGCCCCTATCCCTCGGTGAACATCCACTACAAGTCACCCACCACTGCCGGCTT 1805
Query 1824 CAGCCAGCGCCGCAACCATGCCATGTGCCCGATCTCGGCAGGCAGCCGGCCCCTGGAATTCTTCCCTGACGACG 1897
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Sbjct 1806 CAGCCAGCGCCGCAACCATGCCATGTGCCCGATCTCGGCAGGCAGCCGGCCCCTGGAATTCTTCCCTGACGACG 1879
Query 1898 ACTGCACGTCCTCCGCCCGTCGAGAGCAGAAGCGCGAGCAGTACCGCCAGGTGCGTGAGCACGTGCGTAACGAC 1971
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Sbjct 1880 ACTGCACGTCCTCCGCCCGTCGAGAGCAGAAGCGCGAGCAGTACCGCCAGGTGCGTGAGCACGTGCGTAACGAC 1953
Query 1972 GACGGCCGTCTGCAGGCCTGCGGCTGGAGCCTGCCCGCCAAGTACAAGCAGCTGAGTCCCAACGGGGGCCAGGA 2045
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Sbjct 1954 GACGGCCGTCTGCAGGCCTGCGGCTGGAGCCTGCCCGCCAAGTACAAGCAGCTGAGTCCCAACGGGGGCCAGGA 2027
Query 2046 GGACACGCGGATGAAGAACGTGCCGGTGCCGGTGTACTGCCGCCCTCTGGTGGAGAAGGACCCCACCATGAAGC 2119
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Sbjct 2028 GGACACGCGGATGAAGAACGTGCCGGTGCCGGTGTACTGCCGCCCTCTGGTGGAGAAGGACCCCACCATGAAGC 2101
Query 2120 TGTGGTGTGCCGCGGGCGTCAACCTGAGCGGGTGGAGGCCCAATGAGGACGACGCTGGGAATGGAGTCAAGCCA 2193
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Sbjct 2102 TGTGGTGTGCCGCGGGCGTCAACCTGAGCGGGTGGAGGCCCAATGAGGACGACGCTGGGAATGGAGTCAAGCCA 2175
Query 2194 GCGCCAGGCCGCGATCCCCTGACCTGCGACCGAGAAGGAGACGGCGAGCCCAAGAGCGCCCACACGTCTCCCGA 2267
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Sbjct 2176 GCGCCAGGCCGCGATCCCCTGACCTGCGACCGCGAAGGAGACGGCGAGCCCAAGAGCGCCCACACGTCTCCCGA 2249
Query 2268 GAAGAAGAAGGCCAAGGAGCTCCCTGAAATGGACGCCACCTCCAGCCGGGTGTGGATCCTGACCAGCACCCTGA 2341
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Sbjct 2250 GAAGAAGAAGGCCAAGGAGCTCCCTGAAATGGACGCCACCTCCAGCCGGGTGTGGATCCTGACCAGCACCCTGA 2323
Query 2342 CCACCAGCAAGGTGGTGATCATCGACGCCAACCAGCCGGGCACGGTGGTGGACCAGTTCACCGTCTGCAACGCG 2415
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Sbjct 2324 CCACCAGCAAGGTGGTGATCATCGACGCCAACCAGCCGGGCACGGTGGTGGACCAGTTCACCGTCTGCAACGCG 2397
Query 2416 CACGTGCTGTGCATCTCCAGCATCCCCGCGGCCAGCGACAGCGACTACCCTCCCGGGGAGATGTTCCTGGACAG 2489
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Sbjct 2398 CACGTGCTGTGCATCTCCAGCATCCCCGCGGCCAGCGACAGCGACTACCCTCCCGGGGAGATGTTCCTGGACAG 2471
Query 2490 CGACGTGAACCCAGAGGACCCGGGCGCAGATGGCGTGCTGGCCGGTATCACCCTGGTGGGCTGTGCCACCCGCT 2563
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Sbjct 2472 CGACGTGAACCCAGAGGACCCGGGCGCAGATGGCGTGCTGGCCGGTATCACCCTGGTGGGCTGTGCCACCCGCT 2545
Query 2564 GCAACGTGCCGCGGAGCAACTGCTCCTCCCGAGGGGACACCCCAGTGCTAGACAAGGGGCAGGGGGAGGTGGCC 2637
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Sbjct 2546 GCAACGTGCCGCGGAGCAACTGCTCCTCCCGAGGGGACACCCCAGTGCTAGACAAGGGGCAGGGGGAGGTGGCC 2619
Query 2638 ACCATCGCCAACGGGAAGGTCAACCCGTCCCAGTCCACAGAGGAGGCCACAGAGGCCACGGAGGTGCCAGACCC 2711
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Sbjct 2620 ACCATCGCCAACGGGAAGGTCAACCCGTCCCAGTCCACAGAGGAGGCCACAGAGGCCACGGAGGTGCCAGACCC 2693
Query 2712 TGGGCCCAGCGAGCCAGAGACAGCCACATTGCGGCCCGGGCCTCTCACAGAGCACGTCTTCACTGACCCAGCCC 2785
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Sbjct 2694 TGGGCCCAGCGAGCCAGAGACAGCCACATTGCGGCCCGGGCCTCTCACAGAGCACGTCTTCACTGACCCAGCCC 2767
Query 2786 CGACCCCGTCCTCTGGCCCCCAGCCTGGCAGCGAGAACGGGCCAGAGCCTGACAGCAGCAGCACACGGCCAGAG 2859
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Sbjct 2768 CGACCCCGTCCTCTGGCCCCCAGCCTGGCAGCGAGAACGGGCCAGAGCCTGACAGCAGCAGCACACGGCCAGAG 2841
Query 2860 CCAGAGCCCAGCGGGGACCCCACGGGAGCAGGCAGCAGTGCTGCACCCACCATGTGGCTGGGAGCCCAGAACGG 2933
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Sbjct 2842 CCAGAGCCCAGCGGGGACCCCACGGGAGCAGGCAGCAGTGCTGCACCCACCATGTGGCTGGGAGCCCAGAACGG 2915
Query 2934 CTGGCTCTATGTGCACTCGGCTGTGGCCAACTGGAAGAAGTGCCTGCACTCCATCAAGCTGAAGGATTCTGTGC 3007
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Sbjct 2916 CTGGCTCTATGTGCACTCGGCTGTGGCCAACTGGAAGAAGTGCCTGCACTCCATCAAGCTGAAGGATTCTGTGC 2989
Query 3008 TGAGCCTGGTGCATGTCAAAGGCCGTGTGCTGGTGGCTCTGGCGGACGGGACCCTGGCCATCTTCCACCGTGGT 3081
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Sbjct 2990 TGAGCCTGGTGCATGTCAAAGGCCGTGTGCTGGTGGCTCTGGCGGACGGGACCCTGGCCATCTTCCACCGTGGT 3063
Query 3082 GAAGATGGCCAGTGGGATCTGAGCAACTATCACCTAATGGACCTGGGCCACCCGCACCACTCCATCCGCTGCAT 3155
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Sbjct 3064 GAAGATGGCCAGTGGGATCTGAGCAACTATCACCTAATGGACCTGGGCCACCCGCACCACTCCATCCGCTGCAT 3137
Query 3156 GGCTGTTGTGTACGACCGCGTGTGGTGTGGCTACAAGAACAAGGTGCACGTCATCCAGCCCAAGACCATGCAGA 3229
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Sbjct 3138 GGCTGTTGTGTACGACCGCGTGTGGTGTGGCTACAAGAACAAGGTGCACGTCATCCAGCCCAAGACCATGCAGA 3211
Query 3230 TAGAGAAGTCATTTGACGCCCACCCGCGGCGGGAGAGCCAGGTGCGGCAGCTGGCGTGGATCGGCGATGGCGTA 3303
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Sbjct 3212 TAGAGAAGTCATTTGACGCCCACCCGCGGCGGGAGAGCCAGGTGCGGCAGCTGGCGTGGATCGGCGATGGCGTA 3285
Query 3304 TGGGTGTCCATCCGCCTGGACTCCACCCTGAGGCTCTACCATGCACACACGCACCAGCATCTACAGGACGTGGA 3377
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Sbjct 3286 TGGGTGTCCATCCGCCTGGACTCCACCCTGAGGCTCTACCATGCACACACGCACCAGCATCTACAGGACGTGGA 3359
Query 3378 CATTGAGCCCTACGTCAGCAAGATGCTAGGCACTGGCAAGCTGGGTTTCTCCTTCGTACGCATCACGGCCCTGC 3451
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Sbjct 3360 CATTGAGCCCTACGTCAGCAAGATGCTAGGCACTGGCAAGCTGGGTTTCTCCTTCGTACGCATCACGGCCCTGC 3433
Query 3452 TTGTCGCGGGCAGCCGGCTCTGGGTGGGCACCGGCAACGGAGTGGTCATCTCCATCCCCCTGACAGAGA----- 3520
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Sbjct 3434 TTGTCGCGGGCAGCCGGCTCTGGGTGGGCACCGGCAACGGAGTGGTCATCTCCATCCCCCTGACAGAGAGTGAG 3507
Query 3521 -------------------------------------------------------------------------- 3520
Sbjct 3508 TGGCCTGCACACCTGCAGGGGCAGTGGTGCTGCCAGAGGTGTACGTGGGTTCACGGGGTGGCTCTGCAGGGCCA 3581
Query 3521 -----------------------------------------------------------------------CTG 3523
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Sbjct 3582 CCTTGGAGGGTGCCTTGCTGCCCCTACGCTGACCGCTCTCCTCTTCTCCCATGCTCCTCCCATGTCCCCAGCTG 3655
Query 3524 TGGTCCTGCACCGAGGCCAGCTCCTGGGGCTCCGAGCCAATAAGACATCCCCCACCTCTGGGGAGGGCGCCCGT 3597
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Sbjct 3656 TGGTCCTGCACCGAGGCCAGCTCCTGGGGCTCCGAGCCAATAAGACATCCCCCACCTCTGGGGAGGGCGCCCGT 3729
Query 3598 CCCGGGGGCATCATCCACGTGTATGGCGATGACAGCAGTGACAGGGCGGCCAGCAGCTTCATCCCCTACTGCTC 3671
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Sbjct 3730 CCCGGGGGCATCATCCACGTGTATGGCGATGACAGCAGTGACAGGGCGGCCAGCAGCTTCATCCCCTACTGCTC 3803
Query 3672 CATGGCCCAGGCCCAGCTATGCTTCCATGGGCACCGCGATGCCGTGAAGTTCTTTGTCTCGGTGCCAGGGAACG 3745
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Sbjct 3804 CATGGCCCAGGCCCAGCTATGCTTCCATGGGCACCGCGATGCCGTGAAGTTCTTTGTCTCGGTGCCAGGGAACG 3877
Query 3746 TGCTGGCCACCCTGAATGGCAGTGTGCTGGACAGCCCAGCCGAGGGCCCTGGGCCAGCTGCCCCTGCCTCGGAG 3819
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Sbjct 3878 TGCTGGCCACCCTGAATGGGAGTGTGCTGGACAGCCCAGCCGAGGGCCCTGGGCCAGCTGCCCCTGCCTCGGAG 3951
Query 3820 GTCGAGGGCCAGAAGCTGCGGAACGTGCTGGTGCTGAGCGGCGGGGAGGGCTACATCGACTTCCGCATTGGAGA 3893
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Sbjct 3952 GTCGAGGGCCAGAAGCTGCGGAACGTGCTGGTGCTGAGCGGCGGGGAGGGCTACATCGACTTCCGCATTGGAGA 4025
Query 3894 CGGAGAGGACGACGAGACGGAGGAGGGCGCAGGGGACATGAGCCAGGTGAAGCCCGTGCTGTCCAAGGCAGAGC 3967
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Sbjct 4026 CGGAGAGGACGACGAGACGGAGGAGGGCGCAGGGGACATGAGCCAGGTGAAGCCCGTGCTGTCCAAGGCAGAGC 4099
Query 3968 GCAGTCACATCATCGTGTGGCAGGTGTCCTACACCCCCGAG 4008
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Sbjct 4100 GCAGTCACATCATCGTGTGGCAGGTGTCCTACACCCCCGAG 4140