Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479305
• Subject: NM_027758.4
• Aligned Length: 3804
• Identities: 2697
• Gaps: 717

Alignment

Query    1  ATGTGGGTGAACCCGGAGGAGGTGTTGCTGGCCAACGCGCTGTGGATCACCGAGAGGGCCAACCCATACTTCAT  74
            |||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGTGGGTGAATCCGGAGGAGGTACTGCTGGCCAACGCGCTGTGGATCACCGAGAGAGCCAACCCCTACTTCAT  74

Query   75  CCTGCAGCGGAGGAAGGGCCACGCCGGCGATGGAGGCGGCGGCGGCGGACTGGCGGGCCTGCTGGTGGGTACCC  148
            .|||||.||.|||||||||||||..|||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  TCTGCAACGAAGGAAGGGCCACGGGGGCGACGGGGGTGGCGGCGGCGGATTGGCGGGCCTCCTTGTGGGTACCC  148

Query  149  TTGATGTTGTGTTGGACTCCAGCGCCCGGGTCGCTCCTTACCGAATCTTGTACCAGACTCCAGACTCCCTGGTC  222
            |.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  149  TCGATGTGGTATTGGACTCCAGTGCCCGAGTCGCACCGTACCGAATCCTTTATCAAACTCCAGACTCTCTAGTC  222

Query  223  TACTGGACCATCGCCTGTGGTGGTTCCAGGAAAGAAATCACTGAACACTGGGAATGGCTTGAGCAAAATCTCTT  296
            ||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||..|.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||..|
Sbjct  223  TATTGGACCATTGCCTGTGGTGGCTCCAGGAAGGAGGTTACTGAGCACTGGGAATGGCTTGAACAGAACCTACT  296

Query  297  GCAGACACTCTCCATCTTTGAAAATGAGAATGATATCACCACATTTGTGAGAGGAAAAATACAGGGCATCATTG  370
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||         
Sbjct  297  GCAGACACTCTCCATCTTTGAGAATGAGAATGACGTCACCACATTTGTAAGAGGGAAAATACAGG---------  361

Query  371  CAGAATACAACAAAATCAATGATGTAAAGGAAGATGATGACACGGAGAAGTTTAAAGAAGCCATTGTGAAATTT  444
                                                                                      
Sbjct  362  --------------------------------------------------------------------------  361

Query  445  CATAGGCTGTTTGGGATGCCAGAGGAAGAGAAACTCGTCAACTATTACTCTTGCAGCTATTGGAAGGGGAAGGT  518
                                                                                      
Sbjct  362  --------------------------------------------------------------------------  361

Query  519  CCCCCGTCAGGGTTGGATGTACCTCAGCATTAACCACCTTTGCTTTTATTCTTTTCTTATGGGAAGGGAAGCGA  592
                                          |||||                                       
Sbjct  362  ------------------------------TAACC---------------------------------------  366

Query  593  AACTGGTCATCCGGTGGGTAGACATCACTCAGCTTGAGAAGAATGCCACCCTGCTTCTGCCTGATGTGATCAAA  666
                                                                                      
Sbjct  367  --------------------------------------------------------------------------  366

Query  667  GTGAGCACACGGTCCAGTGAGCATTTCTTCTCTGTATTCCTCAACATCAACGAGACCTTCAAGTTAATGGAGCA  740
                                                                                      
Sbjct  367  --------------------------------------------------------------------------  366

Query  741  GCTTGCCAACATAGCCATGAGGCAACTCTTAGACAATGAGGGATTTGAACAAGATCGATCCCTGCCCAAACTCA  814
                                                                                      
Sbjct  367  --------------------------------------------------------------------------  366

Query  815  AAAGGAAATCTCCTAAAAAAGTGTCTGCTCTAAAACGTGATCTTGATGCCAGGGCAAAGAGTGAGAGATACCGT  888
                                                                                      
Sbjct  367  --------------------------------------------------------------------------  366

Query  889  GCACTTTTCCGGCTGCCCAAAGATGAAAAATTAGATGGCCACACAGACTGCACTCTCTGGACTCCATTTAACAA  962
                                                                                      
Sbjct  367  --------------------------------------------------------------------------  366

Query  963  AATGCACATTTTGGGGCAGATGTTTGTGTCCACAAATTACATCTGTTTTACCAGCAAGGAGGAGAACTTATGTA  1036
                                                                                      
Sbjct  367  --------------------------------------------------------------------------  366

Query 1037  GCCTCATTATCCCGCTCCGTGAGGTGACAATTGTGGAAAAGGCAGACAGCTCCAGTGTGCTCCCCAGTCCCT-T  1109
                                         ||.|||||.|||||.|||||||.||||||||||||||| |||| |
Sbjct  367  -----------------------------ATCGTGGAGAAGGCCGACAGCTGCAGTGTGCTCCCCAG-CCCTCT  410

Query 1110  ATCCATCAGCACCCGAAACAGGATGACCTTCCTATTTGCCAACTTGAAAGATAGAGACTTTCTAGTGCAGAGGA  1183
            .||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  411  GTCCATCAGCACCAGGAACAGGATGACCTTCCTGTTCGCGAACTTGAAAGACAGAGACTTTCTGGTGCAGAGGA  484

Query 1184  TCTCAGATTTCCTGCAACAGACTACTTCCAAAATATATTCTGACAAGGAGTTTGCAGGAAGTTACAACAGTTCA  1257
            |||||||||||.||||.||.||.|||||.|..||.||.||.|||||.||||||.|||||||.|.||||||.|||
Sbjct  485  TCTCAGATTTCTTGCAGCAAACGACTTCTAGGATCTACTCAGACAAAGAGTTTTCAGGAAGCTGCAACAGCTCA  558

Query 1258  GATGATGAGGTGTACTCTCGACCCAGCAGCCTCGTCTCCTCCAGCCCCCAGAGAAGCACGAGCTCTGATGCTGA  1331
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  559  GATGATGAGGTGTATTCTCGGCCCAGCAGCCTCGTTTCCTCCAGTCCCCAGAGAAGCACAAGCTCGGATGCTGA  632

Query 1332  TGGAGAGCGCCAGTTTAACCTAAATGGCAACAGCGTCCCCACAGCCACACAGACCCTGATGACCATGTATCGGC  1405
            ||||||.||||..||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  633  TGGAGAACGCCCCTTTAACCTCAATGGCAACAGTGTCCCTACAGCCACCCAGACCCTCATGACCATGTACCGGC  706

Query 1406  GGCGGTCTCCCGAGGAGTTCAACCCGAAATTGGCCAAAGAGTTTCTGAAAGAGCAAGCCTGGAAGATTCACTTT  1479
            ||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  707  GGCGATCTCCTGAAGAATTCAACCCAAAATTGGCCAAAGAGTTTTTGAAAGAACAAGCCTGGAAGATTCACTTT  780

Query 1480  GCTGAGTATGGGCAAGGGATCTGCATGTACCGCACAGAGAAAACGCGGGAGCTGGTGTTGAAGGGCATCCCGGA  1553
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||
Sbjct  781  GCTGAGTATGGGCAGGGAATCTGCATGTACCGCACAGAGAAGACCCGGGAGCTGGTGCTGAAGGGCATCCCAGA  854

Query 1554  GAGCATGCGTGGGGAGCTCTGGCTGCTGCTGTCAGGTGCCATCAATGAGAAGGCCACACATCCTGGGTACTATG  1627
            |||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  855  GAGCATGCGCGGAGAGCTCTGGCTGCTGCTTTCAGGGGCCATCAATGAAAAGGCCACACACCCCGGGTACTACG  928

Query 1628  AAGACCTAGTGGAGAAGTCCATGGGGAAGTATAATCTCGCCACGGAGGAGATTGAGAGGGATTTACACCGCTCC  1701
            |.|.|||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  929  AGGGCCTCGTGGAGAAGTCGATGGGAAAGTACAATCTGGCCACCGAGGAGATTGAGAGAGACTTACACCGCTCC  1002

Query 1702  CTTCCAGAACACCCAGCTTTTCAGAATGAAATGGGCATTGCTGCACTAAGGAGAGTCTTAACAGCTTATGCTTT  1775
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1003  CTTCCAGAACACCCAGCTTTCCAGAACGAAATGGGCATCGCGGCTCTGAGGAGAGTCTTAACGGCTTATGCTTT  1076

Query 1776  TCGAAATCCCAACATAGGGTATTGCCAGGCCATGAATATTGTCACTTCAGTGCTGCTGCTTTATGCCAAAGAGG  1849
            |||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1077  TCGCAATCCCAACATAGGATACTGCCAGGCCATGAACATTGTCACTTCAGTGCTACTGCTGTATGCCAAAGAGG  1150

Query 1850  AGGAAGCTTTCTGGCTGCTTGTGGCTTTGTGTGAGCGCATGCTCCCAGATTACTACAACACCAGAGTTGTGGGT  1923
            ||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1151  AGGAGGCCTTCTGGCTGCTTGTGGCCTTGTGTGAGCGCATGCTTCCCGACTACTACAACACCAGAGTTGTAGGT  1224

Query 1924  GCACTGGTGGACCAAGGTGTCTTTGAGGAGCTAGCACGAGACTACGTCCCACAGCTGTACGACTGCATGCAAGA  1997
            ||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1225  GCCCTGGTGGACCAGGGAGTCTTCGAGGAGCTGGCTCGAGACTATGTCCCGCAGCTGTACGACTGCATGCAGGA  1298

Query 1998  CCTGGGCGTGATTTCCACCATCTCCCTGTCTTGGTTCCTCACACTATTTCTCAGTGTGATGCCTTTTGAGAGTG  2071
            ||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1299  CCTGGGGGTGATCTCTACCATCTCCCTGTCGTGGTTCCTCACACTCTTCCTCAGTGTGATGCCATTTGAGAGTG  1372

Query 2072  CAGTTGTGGTTGTTGACTGTTTCTTCTATGAAGGAATTAAAGTGATATTCCAGTTGGCCCTAGCTGTGCTGGAT  2145
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1373  CAGTGGTGGTTGTGGACTGTTTCTTCTATGAAGGAATCAAAGTGATATTTCAGCTGGCTCTCGCTGTACTGGAT  1446

Query 2146  GCAAATGTGGACAAACTGTTGAACTGCAAGGATGATGGGGAGGCCATGACCGTTTTGGGAAGGTATTTAGACAG  2219
            ||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1447  GCCAACGTGGATAAACTCTTGAACTGCAAGGACGATGGAGAGGCCATGACTGTTTTGGGAAGGTACCTAGACAG  1520

Query 2220  TGTGACCAATAAAGACAGCACACTGCCTCCCATTCCTCACCTCCACTCCTTGCTCAGCGATGATGTGGAACCTT  2293
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||.|||||||.||.||.||||..||.|
Sbjct 1521  TGTGACCAACAAAGACAGCACCCTGCCTCCCATCCCCCATCTCCACTCCCTGCTCAGTGACGACGTGGGGCCCT  1594

Query 2294  ACCCTGAGGTAGACATCTTTAGACTCATCAGAACTTCCTACGAGAAATTCGGAACTATCCGGGCAGATTTGATT  2367
            ||||||..||.||||||||.||||||||..|.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1595  ACCCTGCCGTGGACATCTTCAGACTCATAGGGACGTCTTACGAGAAATTTGGAACTATCCGGGCCGATTTGATT  1668

Query 2368  GAACAGATGAGATTCAAACAGAGACTGAAAGTGATCCAGACGCTGGAGGATACTACGAAACGCAACGTGGTACG  2441
            ||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1669  GAGCAGATGCGATTCAAGCAGAGGCTGAAAGTGATCCAGACCCTGGAGGACACCACCAAACGCAATGTGGTACG  1742

Query 2442  AACCATTGTGACAGAAACTTCCTTTACCATTGATGAGCTGGAAGAACTTTATGCTCTTTTCAAGGCAGAACATC  2515
            .|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1743  GACCATTGTGACGGAGACGTCCTTCACCATCGATGAGCTGGAAGAACTGTACGCTCTTTTCAAGGCTGAGCATC  1816

Query 2516  TCACCAGCTGCTACTGGGGCGGGAGCAGCAACGCGCTGGACCGGCATGACCCCAGCCTGCCCTACCTGGAACAG  2589
            |.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1817  TGACCAGCTGCTACTGGGGTGGGAGCAGCAATGCCCTGGACCGACACGACCCCAGCCTGCCTTACCTGGAGCAG  1890

Query 2590  TATCGCATTGACTTCGAGCAGTTCAAGGGAATGTTTGCTCTTCTCTTTCCTTGGGCATGTGGAACTCACTCTGA  2663
            ||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|..||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1891  TACCGCATCGACTTTGAGCAGTTCAAGGGCATGTTCGTGCTGCTCTTTCCCTGGGCGTGTGGCACACACTCCGA  1964

Query 2664  CGTTCTGGCCTCCCGCTTGTTCCAGTTATTAGATGAAAATGGAGACTCTTTGATTAACTTCCGGGAGTTTGTCT  2737
            .||.||||||||||||.||||||||.|.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1965  TGTGCTGGCCTCCCGCCTGTTCCAGCTGTTAGATGAGAATGGAGACTCCTTGATTAACTTCCGAGAGTTCGTCT  2038

Query 2738  CTGGGCTAAGTGCTGCATGCCATGGGGACCTCACAGAGAAGCTCAAACTCCTGTACAAAATGCACGTCTTGCCT  2811
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2039  CTGGGCTGAGTGCTGCATGCCATGGGGACCTCACAGAGAAACTCAAACTCCTGTACAAGATGCACGTCTTGCCT  2112

Query 2812  GAGCCATCCTCTGATCAAGATGAACCAGATTCTGCTTTTGAAGCAACTCAGTACTTCTTTGAAGATATTACCCC  2885
            ||||||||||.||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 2113  GAGCCATCCTGTGATCAAGATGAGCCTGACTCCGCCTTTGAAGCCACTCAGTACTTTTTTGAAGACATCACCCC  2186

Query 2886  AGAATGTACACATGTTGTTGGATTGGATAGCAGAAGCAAACAGGGTGCAGATGATGGCTTTGTTACGGTGAGCC  2959
            ||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.|||.||||.||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 2187  AGAATGCACACATGTTGTTGGCTTGGACAGTAGAGGCAAGCAGAGTGCGGACGACGGCTTCGTCACAGTGAGCC  2260

Query 2960  TAAAGCCAGACAAAGGGAAGAGAGCAAATTCCCAAGAAAATCGTAATTATTTGAGACTGTGGACTCCAGAAAAT  3033
            |.||||..||||.||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||..|.|.|||.||||||.||||||||
Sbjct 2261  TGAAGCAGGACAGAGGGAAAAGGGCAAATTCTCAAGAAAACCGTAATTACCTAAAACTCTGGACTGCAGAAAAT  2334

Query 3034  AAATCTAAGTCAAAGAATGCAAAGGATTTACCCAAATTAAATCAGGGGCAGTTCATTGAACTGTGTAAGACAAT  3107
            ||.|||||||||||.|.|||.||||||||.|||||..|.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 2335  AAGTCTAAGTCAAAAACTGCCAAGGATTTGCCCAAGCTGAACCAGGGGCAGTTTATTGAGCTCTGTAAGACCAT  2408

Query 3108  GTATAACATGTTCAGCGAAGACCCCAATGAGCAGGAGCTGTACCATGCCACGGCAGCAGTGACCAGCCTCCTGC  3181
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2409  GTACAACATGTTCAGTGAAGACCCCAATGAGCAGGAGCTGTACCATGCCACAGCTGCGGTGACCAGCCTCCTGC  2482

Query 3182  TGGAGATTGGGGAGGTCGGCAAGTTGTTCGTGGCCCAGCCTGCAAAGGAGGGCGGGAGCGGAGGCAG----TGG  3251
            |||||||.||.|||||.||||||||.|||.|..|.|||||.||||||||          .||.||||    |||
Sbjct 2483  TGGAGATCGGAGAGGTTGGCAAGTTCTTCATTACTCAGCCGGCAAAGGA----------AGATGCAGTTCCTGG  2546

Query 3252  GCCGTCCTGCCACCAGGGCATCCCAGGCGTGCTCTTCCCCAAGAAAGGG-CCAGGCCAGCCTTACGTGGTGGAG  3324
            .||..|||||..|||||.||||||||||.||||||||||.|||||.||| ||| |||||.|.||.|||||||||
Sbjct 2547  ACCACCCTGCGGCCAGGCCATCCCAGGCATGCTCTTCCCTAAGAAGGGGTCCA-GCCAGTCCTATGTGGTGGAG  2619

Query 3325  TCTGTTGAGCCCCTGCCGGCCAGCCTGGCCCCCGACAGCGAGGAACACTCCCTTGGAGGACAAATGGAGGACAT  3398
            ||....|||||.||..|.||.||||||||....|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 2620  TCCACAGAGCCACTCACAGCTAGCCTGGCAGTGGACAGTGAGGAGCACTCCCTGGGAGGGCAGATGGAGGACAT  2693

Query 3399  CAAGCTGGAGGACTCCTCGCCCCGGGACAACGGGGCCTGCTCCTCCATGCTGATCTCTGACGACGACACCAAGG  3472
            .||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 2694  TAAACTGGAGGACTCCTCACCCAGGGACAACGGGGCCTGCTCCTCCATGTTGATCTCCGATGATGACACCAAGG  2767

Query 3473  ACGACAGCTCCATGTCCTCATACTCGGTGCTGAGTGCCGGCTCCCACGAGGAGGACAAGCTGCACTGCGAGGAC  3546
            |.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2768  ATGACAGCTCCATGTCATCCTACTCGGTGCTGAGCGCCGGCTCCCACGAGGAGGACAAACTGCACTGTGAGGAC  2841

Query 3547  ATCGGAGAGGACACGGTCCTGGTGCGGAGCGGCCAGGGCACGGCGGCACTGCCCCGGAGCACCAGCCTGGACCG  3620
            ||.|||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||.|..||..|.||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 2842  ATTGGAGAGGACACAGTCCTGGTGCGTAGCAGTCAGGGTAGAGCCACCCTGCCCAGGAGCAGCAGCCTGGACCG  2915

Query 3621  GGACTGGGCCATCACCTTCGAGCAGTTCCTGGCCTCCCTCTTAACTGAGCCTGCCCTGGTCAAGTACTTTGACA  3694
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|.|||||||||||
Sbjct 2916  GGACTGGGCCATCACCTTTGAGCAGTTCCTGGCCTCGCTCTTGACGGAGCCCGCTCTCGTGAGGTACTTTGACA  2989

Query 3695  AGCCCGTGTGCATGATGGCCAGGATTACCAGTGCAAAAAACATCCGGATGATGGGCAAGCCCCTCACCTCGGCC  3768
            ||||.||||||||||||||||||.|.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2990  AGCCAGTGTGCATGATGGCCAGGGTCACCAGTGCGAAGAACATCCGTATGATGGGCAAGCCCCTCACCTCAGCC  3063

Query 3769  AGTGACTATGAAATCTCGGCCATGTCCGGC  3798
            |||||||||||||||||.|||.||||.|||
Sbjct 3064  AGTGACTATGAAATCTCTGCCCTGTCGGGC  3093