Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479316
- Subject:
- XM_017322044.1
- Aligned Length:
- 2124
- Identities:
- 1662
- Gaps:
- 186
Alignment
Query 1 ATGGCAGCAGCGGCTACTGCAGCCGAGGGGGTCCCCAGTCGGGGGCCTCCCGGGGAAGTCATCCATCTGAATGT 74
|||||.|..|||.|.|||||||..|||||||||||.||||||||..|.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCCGTCGCGACGACTGCAGTGGAGGGGGTCCCGAGTCGGGGAGCACCCGGGGAAGTGATTCATCTGAACGT 74
Query 75 GGGAGGCAAGAGATTCAGTACCTCTCGCCAGACTCTCACCTGGATCCCAGACTCCTTCTTCTCCAGTCTTCTGA 148
.||.||||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 75 AGGGGGCAAGCGGTTCAGTACCTCTCGCCAGACGCTTACCTGGATCCCAGACTCCTTCTTTTCCAGTCTTTTGA 148
Query 149 GCGGACGCATCTCGACGCTGAAAGATGAGACCGGAGCAATCTTCATCGACAGGGACCCTACAGTCTTCGCCCCC 222
|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 149 GCGGACGCATCTCAACCCTGAAAGATGAGACCGGAGCTATCTTCATCGACCGGGACCCCACCGTCTTTGCCCCC 222
Query 223 ATCCTCAACTTCCTGCGCACCAAAGAGTTGGATCCCAGGGGTGTCCACGGTTCCAGCCTCCTCCATGAAGCCCA 296
|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCCTTAATTTCCTGCGGACCAAAGAGTTAGATCCCAGGGGTGTCCATGGTTCCAGCCTCCTCCATGAAGCCCA 296
Query 297 GTTCTATGGGCTCACTCCTCTGGTTCGTCGCCTGCAGCTTCGAGAGGAGTTGGATCGATCTTCTTGTGGAAACG 370
.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|..|.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 297 ATTCTACGGACTCACTCCACTGGTTCGTCGCCTGCAGGTGAGGGAAGAGTTGGATCGATCTTCCTGCGGAAATG 370
Query 371 TCCTCTTCAATGGTTACCTGCCGCCACCAGTGTTCCCAGTGAAGCGGCGGAACCGGCACAGCCTAGTGGGGCCT 444
||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 371 TCCTCTTCAATGGTTATCTACCTCCTCCAGTGTTCCCAGTGAAGCGGCGAAACCGGCACAGCCTGGTGGGGCCC 444
Query 445 CAGCAGCTAGGAGGACGGCCAGCCCCTGTCCGACGGAGCAACACGATGCCCCCCAACCTTGGCAATGCAGGGCT 518
|||||..||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||
Sbjct 445 CAGCAAATAGGGGGACGCCCAGCCCCTGTTCGACGGAGCAACACGATGCCCCCCAACTTGGGTAATGCAGGGCT 518
Query 519 GCTGGGCCGAATGCTGGATGAGAAAACCCCTCCCTCACCCTCAGGACAACCTGAGGAGCCGGGGATGGTGCGCC 592
|||||||||||||.|.|||||||.|.|.|||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 GCTGGGCCGAATGTTAGATGAGAGAGCACCTCCATCCCCATCAGGCCAACCAGAGGAGCCAGGGATGGTGCGCC 592
Query 593 TGGTGTGTGGACACCATAATTGGATCGCTGTGGCCTATACCCAGTTTCTAGTCTGCTACAGGTTGAAGGAAGCC 666
||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 593 TGGTGTGTGGTCACCACAACTGGATTGCTGTGGCATATACCCACTTTCTCGTCTGTTATAGGTTGAAGGAAGCC 666
Query 667 TCTGGCTGGCAGCTGGTGTTTTCCAGCCCCCGCCTGGACTGGCCCATCGAACGACTGGCGCTCACAGCCCGGGT 740
||.|||||||||||.|..||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||..|.||.|||||
Sbjct 667 TCGGGCTGGCAGCTTGCATTCTCCAGCCCGCGCCTGGACTGGCCCATCGAGCGCCTGGCTCTTGCGGCTCGGGT 740
Query 741 GCATGGTGGGGCTTTGGGTGAACATGACAAGATGGTGGCAGCAGCCACCGGCAGCGAGATCCTGCTATGGGCTC 814
||.|||.||.|||..||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 741 GCTTGGCGGTGCTCCGGGTGAGCATGACAAGATGGTGGCTGCAGCTACTGGCAGCGAGATCCTTCTGTGGGCCC 814
Query 815 TGCAGGCGGAAGGCGGTGGCTCCGAGATAGGGGTCTTTCATCTGGGGGTGCCTGTGGAGGCCTTGTTCTTCGTC 888
|.||.||..||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 815 TACAAGCACAAGGTGGTGGCTCTGAGATAGGTGTCTTCCACCTGGGTGTGCCAGTGGAGGCCTTGTTCTTTGTT 888
Query 889 GGGAACCAGCTCATTGCTACAAGCCACACAGGGCGCATCGGGGTGTGGAATGCCGTCACCAAGCACTGGCAGGT 962
|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGAATCAGCTCATTGCCACAAGTCACACAGGGCGCATCGGTGTCTGGAACGCTGTGACCAAGCACTGGCAGGT 962
Query 963 CCAGGAGGTGCAGCCCATCACCAGTTATGACGCGGCAGGCTCCTTCCTCCTCCTGGGCTGCAACAACGGCTCCA 1036
|||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 963 CCAGGAGGTCCAGCCTATCACGAGCTATGATGCAGCCGGCTCCTTCCTCCTCCTGGGCTGCAGCAATGGCTCCA 1036
Query 1037 TTTACTACGTGGATGTGCAGAAGTTCCCCTTGCGCATGAAAGACAACGACCTCCTTGTCAGCGAGCTCTATCGG 1110
|.||.||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1037 TCTATTATGTAGATGTGCAGAAATTCCCCCTGCGGATGAAGGACAACGATCTCCTTGTCAGTGAGCTCTACCGA 1110
Query 1111 GACCCAGCGGAGGATGGGGTCACCGCCCTCAGTGTCTACCTCACCCCCAAGACCAGTGACAGTGGGAACTGGAT 1184
||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACCCAGCAGAGGATGGGGTCACCGCCCTCAGCGTCTACCTCACCCCCAAGACCA------------------- 1165
Query 1185 CGAGATCGCCTATGGCACCAGCTCAGGGGGCGTGCGGGTCATCGTGCAGCACCCGGAGACTGTGGGCTCGGGGC 1258
Sbjct 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Query 1259 CTCAGCTCTTCCAGACCTTCACTGTGCACCGCAGCCCTGTCACCAAGATCATGCTGTCGGAGAAGCACCTCATC 1332
Sbjct 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Query 1333 TCAGTCTGTGCCGACAACAACCACGTGCGGACATGGTCTGTGACTCGCTTCCGCGGCATGATTTCCACCCAGCC 1406
|.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1166 ----TGTGTGCCGACAACAACCATGTTCGGACGTGGTCTGTGACCCGCTTTCGAGGCATGATCTCCACCCAGCC 1235
Query 1407 CGGCTCCACCCCACTCGCTTCCTTTAAGATCCTGGCTCTGGAGTCGGCAGATGGGCATGGCGGCTGCAGTGCTG 1480
.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|..|||||||..||.|||||||||||||
Sbjct 1236 TGGTTCCACTCCGCTGGCATCCTTCAAGATCCTGGCGCTGGAATCTGTTGATGGGCTCGGTGGCTGCAGTGCTG 1309
Query 1481 GCAATGACATTGGCCCCTACGGTGAGCGGGACGACCAGCTAGTGTTCATCCAGAAGGTGGTGCCCAGTGCCAGC 1554
|||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||..||||||||||||||.||||||||.|.||||||.
Sbjct 1310 GCAATGACATTGGTCCCTATGGTGAACGGGATGACCAGCAGGTGTTCATCCAGAAAGTGGTGCCAAATGCCAGT 1383
Query 1555 CAGCTCTTCGTGCGTCTCTCATCTACTGGGCAGCGGGTGTGCTCCGTGCGCTCCGTGGACGGCTCACCCACGAC 1628
|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 1384 CAGCTATTTGTGCGTCTCTCTTCCACTGGGCAGCGGGTGTGTTCTGTGCGCTCGGTGGATGGGTCTCCCACGAC 1457
Query 1629 GGCCTTCACAGTGCTGGAGTGCGAGGGCTCCCGGCGGCTCGGCTCTCGGCCCCGGCGCTACCTGCTCACTGGCC 1702
.||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||.|||||..|.|||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1458 TGCCTTCACAGTGTTGGAGTGTGAGGGCTCCAGGCGGCTGGGCTCCAGACCCCGACGTTACCTGCTCACTGGTC 1531
Query 1703 AGGCCAACGGCAGCTTGGCCATGTGGGACCTAACCACCGCCATGGACGGCCTCGGCCAGGCCCCTGCAGGTGGC 1776
||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.|||
Sbjct 1532 AGGCCAACGGCAGCCTGGCCATGTGGGACCTGACCACTGCCATGGATGGCCTGGGCCAAACTCCTGCAGGCGGC 1605
Query 1777 CTGACGGAGCAAGAGCTGATGGAACAGCTGGAACACTGTGAGCTG-GCCCCGCCGGCTCCTTCAGCTCCCTCAT 1849
|||||.||..|||||||||||||.||.|||||.||.||||||||| || ||.|..|||.||||..
Sbjct 1606 CTGACAGAAGAAGAGCTGATGGACCAACTGGAGCAATGTGAGCTGAGC----------CCATTGGCTTCCTCTC 1669
Query 1850 GGGGCTGTCTCCCCAGCCCCTCACCCCGCATCTCCCTCACCAGCCTCCACTCAGCCTCCAGCAACACCTCCTTG 1923
||||||.|.|||||||||||||||||.|.|.|||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1670 GGGGCTCTTTCCCCAGCCCCTCACCCAGGACCTCTCTTACCAGTCTCCACTCAGCCTCCAGCAACACCTCCCTG 1743
Query 1924 TCTGGCCACCGTGGGAGCCCAAGCCCCCCGCAGGCTGAGGCCCGGCGCCGTGGTGGGGGCAGCTTTGTGGAACG 1997
|.|||||.|.|.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|..||.|||||.|||||.||
Sbjct 1744 TATGGCCCCAGAGGGAGCCCCAGCCCACCACAGGCAGAGGCCCGTCGCCGCGGGGCAGGAAGCTTCGTGGATCG 1817
Query 1998 CTGCCAGGAACTGGTGCGGAGTGGGCCAGACCTCCGACGGCCACCCACACCAGCCCCGTGGCCCTCCAGCGGTC 2071
.||.||||||||||...||.|||.||||||.|||.||.||||.||.|||||||||||..|.|||||||.|.|||
Sbjct 1818 GTGTCAGGAACTGGCAAGGGGTGCGCCAGAGCTCAGATGGCCGCCAACACCAGCCCCTCGACCCTCCACCAGTC 1891
Query 2072 TCGGCACTCCCCTCACACCTCCCAAGATGAAGCTC--AATGAAACTTCCTTT 2121
|.||.|.||||||.|||.|||.||||| ||.||| ||.||||||||||||
Sbjct 1892 TTGGGAATCCCCTGACAGCTCTCAAGA--AAACTCTTAACGAAACTTCCTTT 1941