Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479326
• Subject: XM_011523234.2
• Aligned Length: 2211
• Identities: 1863
• Gaps: 348

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCTGCCAGCAGTCGCGGTACCACAGCTTCTCGTCCGCGTCGAGATTACAGCCACGGCCTTCAGGAGTGAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CATAGACGAATCCTTTCTCACAGAAGACAAGAGCACCCAGAATCGCAAGCTTCTTCAGAAACGAAGGACGCTGA  148

Query    1  --------------ATGGGTGGGCACCTGTCCCCATGGCCCACATACACCAGTGGCCAGACCATTTTGCAAAAT  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGGTCAGTTCTCCATGGGTGGGCACCTGTCCCCATGGCCCACATACACCAGTGGCCAGACCATTTTGCAAAAT  222

Query   61  CGAAAACCCTGTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCC  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAAAACCCTGTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCC  296

Query  135  CCAGTACTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCC  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGTACTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCC  370

Query  209  AGGAACTAAGGCTGCAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTA  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAACTAAGGCTGCAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTA  444

Query  283  CTATCCTCCATCAAGAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCT  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTATCCTCCATCAAGAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCT  518

Query  357  GAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATG  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATG  592

Query  431  AAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCA  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCA  666

Query  505  TTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGC  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGC  740

Query  579  CTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAG  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAG  814

Query  653  GCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAG  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAG  888

Query  727  ATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGAC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGAC  962

Query  801  CAACAAGGATCTTCAGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCC  874
            ||||||||||||||||||                                                        
Sbjct  963  CAACAAGGATCTTCAGGA--------------------------------------------------------  980

Query  875  TCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACT  948
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct  981  -------------------------------------------------------GCAGGAGATCCAGCGCACT  999

Query  949  TCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAA------------------------------------------  980
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct 1000  TCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGGTGAGGGCAGCCGGCAGGGCCCCAGGTCCTGCTTACATGT  1073

Query  981  ---------------------------------AGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGG  1021
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  GGGCCCAGACTCCAGCTCCCTCTCCCCACATGCAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGG  1147

Query 1022  CTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAA  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  CTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAA  1221

Query 1096  GACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAA  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222  GACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAA  1295

Query 1170  GAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAG  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296  GAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAG  1369

Query 1244  AGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTAT  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370  AGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTAT  1443

Query 1318  ACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAA  1391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444  ACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAA  1517

Query 1392  GCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACA  1465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518  GCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACA  1591

Query 1466  GTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAA  1539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592  GTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAA  1665

Query 1540  GAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCG  1613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666  GAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCG  1739

Query 1614  CTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATG  1687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740  CTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATG  1813

Query 1688  AGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAG  1761
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814  AGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAG  1887

Query 1762  CTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTT  1835
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888  CTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTT  1961

Query 1836  CCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTG  1909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962  CCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTG  2035

Query 1910  CCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1974
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036  CCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  2100