Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479326
• Subject: XM_011523238.1
• Aligned Length: 2097
• Identities: 1800
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  ATGGGTGGGCAC---CTGTCCCCATGGCCCACATACACCAG-TGGCCAGACCATTTTGCAAAATCGAAAACCCT  70
                .|||..||   ||||.|.|          |||..||| |..||||.||                  .|..
Sbjct    1  ----ATGGCGACCGGCTGTACGC----------TACCACAGCTTCCCAGGCC------------------GCGG  42

Query   71  GTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGG----GAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTA  140
            ||.|.|||..|  |||...||..||.||    |..||||||||||        ||||..|.|||     |||  
Sbjct   43  GTGCTGATTGC--CCGCCTGCCCGTGGGTCATGGCCTGCCAGCAG--------TCGCGGTACCA-----CAG--  99

Query  141  CTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGC-TGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAA  213
            |||                               |||.||| || |.|          |||||.||.|||    
Sbjct  100  CTT-------------------------------CTCGTCC-GCGTCG----------AGATTACAGCCA----  127

Query  214  CTAAGGCTGCAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGA---CTT-----CAAAACGTACAAG---  276
                     |.||||| ||| |||     |||     .||||||.||   |||     ||.||  .|||||   
Sbjct  128  ---------CGGCCTT-CAG-GAG-----TGA-----CCATAGACGAATCCTTTCTCACAGAA--GACAAGAGC  178

Query  277  --CCATTACTATC-----CTCCATCAAGAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGG  343
              ||   |..|||     ||.|.|||..||  ||.|     |||.||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179  ACCC---AGAATCGCAAGCTTCTTCAGAAA--CGAA-----GGACGCT-GCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGG  241

Query  344  CTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCT  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  CTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCT  315

Query  418  GAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGA  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  GAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGA  389

Query  492  GGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCA  565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  GGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCA  463

Query  566  GTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTA  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  GTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTA  537

Query  640  GCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCT  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  GCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCT  611

Query  714  GACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAA  787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  GACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAA  685

Query  788  TGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAG---------------------CAGCTGGACACCCTGAGAGCC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||
Sbjct  686  TGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGGGCCAATGTCCTTGCCCACAGCTGGACACCCTGAGAGCC  759

Query  841  AGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCA  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  AGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCA  833

Query  915  ATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAA--------  980
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  834  ATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGGTGAGG  907

Query  981  -------------------------------------------------------------------AGATGTG  987
                                                                               |||||||
Sbjct  908  GCAGCCGGCAGGGCCCCAGGTCCTGCTTACATGTGGGCCCAGACTCCAGCTCCCTCTCCCCACATGCAGATGTG  981

Query  988  GTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCT  1061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  GTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCT  1055

Query 1062  GGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTG  1135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  GGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTG  1129

Query 1136  CTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGAT  1209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  CTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGAT  1203

Query 1210  GCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCG  1283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  GCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCG  1277

Query 1284  CTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGG  1357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  CTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGG  1351

Query 1358  TTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTA  1431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  TTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTA  1425

Query 1432  GCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACAC  1505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426  GCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACAC  1499

Query 1506  TGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATC  1579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500  TGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATC  1573

Query 1580  CCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCC  1653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574  CCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCC  1647

Query 1654  TTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGG  1727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648  TTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGG  1721

Query 1728  CATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACA  1801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722  CATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACA  1795

Query 1802  AGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAG  1875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796  AGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAG  1869

Query 1876  AAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGG  1949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870  AAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGG  1943

Query 1950  ACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1974
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944  ACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1968