Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479398
- Subject:
- NM_054093.3
- Aligned Length:
- 3212
- Identities:
- 2764
- Gaps:
- 10
Alignment
Query 1 ATGTTCACCCTGTCTCAGACCTCGAGAGCATGGTTCATCGATAGAGCCCGTCAGGCACGAGAAGAAAGGCTTGT 74
||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1 ATGTTCACTGTATCTCAGACCTCCAGAGCATGGTTCATCGACAGAGCCCGGCAGGCACGAGAAGAGAGGCTGGT 74
Query 75 GCAGAAGGAACGGGAGCGGGCAGCTGTTGTGATCCAGGCCCATGTCCGGAGTTTTCTCTGTCGGAGTCGACTGC 148
|||||||||.||||||||..||||.||...|||||||||||..|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 75 GCAGAAGGAGCGGGAGCGCTCAGCGGTGACGATCCAGGCCCTAGTCCGCAGTTTCCTCTGCCGGAGGCGACTGC 148
Query 149 AGAGAGATATCAGGAGAGAGATTGATGACTTTTTTAAAGCAGATGACCCTGAGTCCACTAAAAGAAGTGCACTT 222
|.|||||.|||||||.||||||||||||.|||||||..||.|||||..|||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 149 ACAGAGACATCAGGAAAGAGATTGATGAGTTTTTTAGTGCTGATGAGTCTGGGTCCAGTAAAAGAAGTGCACTT 222
Query 223 TGTATTTTCAAGATTGCCAGGAAACTGCTGTTCCTATTCAGAATCAAAGAGGATAATGAGAGATTTGAGAAGTT 296
||||||||.|||||||||||||.|||||||||..|||.||.||..|..|||||.|..||||||.|.||||||||
Sbjct 223 TGTATTTTTAAGATTGCCAGGAGACTGCTGTTTATATGCAAAACTACCGAGGACAGCGAGAGACTGGAGAAGTT 296
Query 297 GTGTCGCAGCATCCTGAGCAGCATGGATGCTGAGAATGAGCCTAAGGTGTGGTATGTGTCCCTGGCTTGTTCTA 370
||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||...||.|
Sbjct 297 GTGTCGAAGCATCCTGAACAGCATGGATGCCGAGAATGAGCCAAAGGTGTGGTACGTGTCCCTGGCTCTCTCCA 370
Query 371 AGGACCTCACCCTCCTTTGGATTCAACAGATCAAGAACATTTTGTGGTACTGCTGTGATTTTCTCAAGCAGCTC 444
||||||||||.||.||.||||||.|.||||||||||.|||..|||||.||||||||||..||||...|||||||
Sbjct 371 AGGACCTCACGCTGCTGTGGATTAAGCAGATCAAGAGCATCCTGTGGCACTGCTGTGAGCTTCTGGGGCAGCTC 444
Query 445 AAGCCTGAAATCCTGCAGGACTCCCGACTCATCACCCTGTACCTCACGATGCTTGTCACCTTCACAGACACTTC 518
|||||.||.|||.|.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGCCAGAGATCTTACAGGACTCCAGGCTCATCACGCTGTACCTCACCATGCTTGTGACCTTCACAGACACTTC 518
Query 519 AACGTGGAAAATTCTTCGGGGAAAAGGTGAAAGTCTTCGACCAGCGATGAACCACATTTGTGCAAATATAATGG 592
|||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 AACATGGAAGATTCTCCGGGGAAAAGGTGAGAGCCTTCGGCCAGCCCTGAACCACATTTGCGCAAATATAATGG 592
Query 593 GACATCTCAACCAGCATGGATTTTATTCTGTGCTGCAGATATTGTTAACCCGTGGCCTGGCAAGACCCCGTCCT 666
|.|||||||||||||.||||.||||.|||||..|||||.||.||.|.|||||.||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 593 GCCATCTCAACCAGCGTGGACTTTACTCTGTATTGCAGGTACTGCTGACCCGAGGCCTGGCCAGGCCCCGGCCC 666
Query 667 TGTCTATCCAAAGGCACTTTAACAGCAGCTTTTTCTCTAGCGTTACGCCCTGTGATTGCTGCACAGTTCTCAGA 740
|||||.||||||||||..|||||||||||.||.|||||.||..|.|||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 667 TGTCTGTCCAAAGGCATGTTAACAGCAGCCTTCTCTCTGGCCCTGCGCCCTGTGGTTGCTGCGCAGTTCTCAGA 740
Query 741 CAATCTGATTCGGCCGTTCCTCATCCACATCATGTCTGTGCCTGCTCTGGTGACTCATCTCAGCACAGTGACCC 814
||||||.||.||.||.|||.||||||||.|||||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||.|||.|||
Sbjct 741 CAATCTTATGCGACCATTCATCATCCACGTCATGTCGGTACCTGCTCTCGTGGCTCATCTCAGCACCGTGGCCC 814
Query 815 CTGAGCGCCTCACTGTTTTAGAATCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCATATTTTTAAGAGACCAAGATCGA 888
|||||||||||...||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||..|.|||||...|||.|||
Sbjct 815 CTGAGCGCCTCGGCGTTTTAGAGTCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCGTCTTCCTGAGAGATAGAGACCGA 888
Query 889 TGCCGTGATGTATGTGAAAGTTTAGAAGGATGCCATACGCTTTGTCTAATGGGCAACCTCCTACACTTGGGCTC 962
|||||.||||..|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 889 TGCCGCGATGCTTGTGAGAGTTTAGAAGGCTGCCATACCCTGTGTCTCATGGGCAATCTCCTGCACTTGGGCTC 962
Query 963 CCTCAGCCCCAGAGTGTTAGAGGAGGAGACAGATGGGTTCGTGAGTTTGCTCACCCAGACGCTGTGCTACTGTC 1036
||||||||.|||..||||||||||.||||..||||||||.|||||...||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 963 CCTCAGCCTCAGGCTGTTAGAGGAAGAGATGGATGGGTTTGTGAGCGCGCTCACGCAGATGCTGTGCTACTGTC 1036
Query 1037 AGAAGTATGTGTCTCAGAAGAAGTCCAACCTGACCCACTGGCATCCTGTCCTTGGCTGGTTCTCCCAATCTGTG 1110
|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||.|||||
Sbjct 1037 AGAAGTACGTGGCTCAGAAGAAGTCCAACCTGACCCACTGGCACCCTGTGCTCGGCTGGTTTTCCCAACCTGTG 1110
Query 1111 GATTATGGCCTTAACGAGTCAATGCACTTGATCACCAAACAGCTGCAGTTCTTGTGGGGGGTGCCTCTGATCCG 1184
|||||.|||||.||.||.||.|||.||.||||||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 1111 GATTACGGCCTCAATGATTCCATGTACCTGATCACCAAGCAGCTGCAGTTCCTGTGGGCGGTGCCTCTCATCCG 1184
Query 1185 GATCTTCTTCTGTGACATCCTGAGCAAGAAGCTACTGGAG-AGCCAGGAGCCAGCCCACG-------CACAGCC 1250
.||..|||||.|||||||||||||||.||||||.|||||| |..|| |||||.|||| || |.|||||
Sbjct 1185 CATTCTCTTCAGTGACATCCTGAGCAGGAAGCTGCTGGAGCATGCA-GAGCCGGCCC-CGGTGCAACCGCAGCC 1256
Query 1251 AGCATCCCCTCAGAATGTGCTCCCAGTGAAGAGTCTCCTAAAGCGTGCTTTTCAAAAGTCGGCATCAGTCCGGA 1324
..|.||.||.||||..||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 1257 GTCCTCACCGCAGACGGTGCTCCCCGTGAAGAGCCTCCTCAAGCGTGCGTTTCAGAAGTCGGCTTCGGTTCGGA 1330
Query 1325 ATATTCTCAGGCCTGTCGGGGGTAAACGGGTCGACTCTGCAGAAGTCCAGAAGGTTTGCAACATCTGTGTCCTC 1398
|.||.|||||||||||.|||||....||.||||||||.||.||.||.|.||||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 1331 ACATCCTCAGGCCTGTTGGGGGCCGCCGTGTCGACTCCGCTGAGGTGCGGAAGGTCTGCAACATTTGCGTGCTC 1404
Query 1399 TACCAGACCTCGCTGACAACTCTCACACAGATTCGGCTGCAGATACTCACAGGTCTCACTTACCTTGATGACCT 1472
|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1405 TACCAGACCTCGCTGACGACCCTCACCCAGATCCGCCTGCAGATCCTCACAGGTCTTACGTACCTGGATGACCT 1478
Query 1473 GCTTCCCAAACTGTGGGCATTTATCTGTGAGCTCGGGCCCCACGGAGGGTTAAAGCTCTTCTTGGAATGCCTGA 1546
|||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||.||||.|||||||
Sbjct 1479 GCTGCCCAAGCTCTGGGCGTTTATCTGTGAGCTGGGGCCCCACGGCGGGCTCAAGCTCTTCCTGGAGTGCCTGA 1552
Query 1547 ACAATGACACTGAAGAGTCCAAGCAACTCTTGGCCATGCTGATGCTGTTCTGTGACTGTTCGCGGCACCTCATC 1620
||||||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1553 ACAATGACACTGGAGAGTCCAAGCAGCTCCTGGCCATGCTGATGCTCTTCTGTGACTGTTCCCGGCACCTCATC 1626
Query 1621 ACAATCCTTGATGACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATTTCATTCAAACTGGAAGAGCTGGTCACTATCTCCTC 1694
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1627 ACCATCCTCGATGACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATCTCCTTCAAGCTGGAAGAGCTGGTCACCATCTCCTC 1700
Query 1695 TTTCCTGAATTCTTTTGTGTTTAAGATGATCTGGGATGGAATTGTAGAGAACGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGC 1768
.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 GTTCCTCAATTCCTTCGTGTTTAAGATGATCTGGGACGGAATTGTAGAGAATGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGC 1774
Query 1769 TGTTCCAGTCTGTCCACGGGTGGCTTATGGTGCTGTACGAGCGGGACTGCCGGCGGCGCTTCACCCCCGAGGAC 1842
||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||..|.||.||||||
Sbjct 1775 TGTTCCAGTCCGTCCATGGCTGGCTGATGGTGCTGTATGAGCGAGACTGCCGCCGGCGCTTTGCTCCGGAGGAC 1848
Query 1843 CACTGGCTGCGAAAGGATCTCAAACCTAGCGTGCTCTTCCAAGAACTCGACAGGGACAGAAAACGGGCACAGTT 1916
||||||||.||.|.|||.|||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||||.||||.|||...||||.|||.|
Sbjct 1849 CACTGGCTACGGAGGGACCTCAAGCCTGGTGTGCTCTTCCAGGAGCTCGACAAGGACCGAAGGAGGGCTCAGCT 1922
Query 1917 GATCCTGCAGTACATCCCACATGTCATCCCTCACAAAAACAGAGTTCTACTGTTTCGAACCATGGTTACCAAGG 1990
|.||||||||.|||||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|.||||||||.|||||
Sbjct 1923 GGTCCTGCAGCACATCCCCCACGTCGTGCCTCACAAGAACAGAGTTCTTCTGTTCCGGAACATGGTTATCAAGG 1996
Query 1991 AGAAGGAGAAACTGGGGCTGGTGGAAACCAGCTCTGCCTCCCCGCATGTCACTCACATCACCATCCGCCGGTCC 2064
||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||..|||||
Sbjct 1997 AGAAAGAGAAGCTGGGGCTTGTGGAGACCAGCTCTGCCTCTCCTCACGTCACCCACATCACCATCCGAAGGTCC 2070
Query 2065 AGGATGCTGGAGGACGGCTACGAGCAGCTTAGGCAGCTCTCCCAGCACGCCATGAAGGGGGTCATCCGTGTGAA 2138
.|||||.||||||||||||||||.|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2071 CGGATGTTGGAGGACGGCTACGAACAGCTCCGGCAGCTTTCCCAGCATGCCATGAAGGGTGTGATCCGAGTGAA 2144
Query 2139 GTTTGTCAATGACCTCGGGGTGGACGAAGCAGGGATTGATCAAGACGGTGTTTTTAAGGAGTTCTTGGAAGAGA 2212
|||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||..|||||||||
Sbjct 2145 GTTTGTCAACGACCTCGGGGTGGACGAGGCTGGGATTGACCAGGATGGTGTCTTCAAGGAGTTTCTGGAAGAGA 2218
Query 2213 TCATCAAGAGAGTTTTTGACCCAGCACTCAATCTGTTCAAGACAACCAGTGGGGATGAGAGGCTGTACCCCTCA 2286
||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 2219 TCATCAAGAGGGTGTTTGACCCCGCACTCAACCTGTTCAAGACAACCAGCGGGGATGAGCGGCTGTACCCATCA 2292
Query 2287 CCCACATCCTACATCCATGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGAAGATGCTGGGGAAGGCTGTGTA 2360
|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2293 CCCACGTCCTACATTCACGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGAAGATGCTGGGAAAGGCAGTGTA 2366
Query 2361 TGAGGGAATTGTGGTGGACGTGCCATTTGCATCCTTCTTCCTGAGCCAACTGCTTGGGCACCACCACAGCGTCT 2434
||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2367 TGAGGGGATCGTGGTAGATGTGCCCTTTGCCTCCTTCTTCCTGAGCCAGATGCTCGGGCACCACCACAGCGTCT 2440
Query 2435 TCTATAGCTCGGTGGATGAACTGCCTTCTCTGGACTCCGAGTTCTATAAAAACCTCACCTCCATCAAGCGCTAT 2508
||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2441 TCTACAGCTCCGTGGATGAGCTTCCCTCCCTGGACTCGGAGTTTTATAAAAACCTCACCTCCATCAAGCGCTAC 2514
Query 2509 GATGGGGACATCACTGACCTGGGCCTGACGCTGTCTTACGACGAGGACGTCATGGGTCAGCTTGTTTGCCATGA 2582
|||||.||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 2515 GATGGAGACATCGCAGACCTCGGGCTGACGCTGTCTTACGATGAAGACGTCATGGGTCAGCTCGTCTGCCACGA 2588
Query 2583 ACTGATTCCTGGAGGGAAGACCATTCCTGTTACAAATGAAAATAAAATTAGCTACATCCATCTGATGGCACATT 2656
||||.||||.||||||||||||||.||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2589 ACTGGTTCCCGGAGGGAAGACCATCCCGGTTACAGATGAGAACAAAATTAGCTACATCCATCTGATGGCGCATT 2662
Query 2657 TTCGAATGCACACTCAAATAAAAAACCAAACAGCTGCCCTCATTAGCGGATTCCGTTCCATTATCAAACCCGAG 2730
|.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2663 TCCGAATGCACACTCAAATTAAAAACCAGACAGCTGCTCTTATCAGTGGCTTCCGTTCCATCATCAAGCCCGAG 2736
Query 2731 TGGATCCGAATGTTCTCAACTCCTGAACTGCAGCGTCTCATCTCTGGCGACAATGCTGAGATTGATCTGGAAGA 2804
|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2737 TGGATCCGAATGTTCTCTACCCCTGAGCTTCAGCGCCTCATCTCCGGGGACAACGCTGAGATAGATCTGGAAGA 2810
Query 2805 TTTAAAGAAGCACACAGTCTACTACGGTGGTTTCCATGGAAGTCACAGAGTCATCATCTGGCTCTGGGATATTC 2878
.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2811 CTTAAAGAAGCACACAGTGTACTACGGTGGCTTTCATGGGAGCCACAGGGTCATCATCTGGCTCTGGGATATCC 2884
Query 2879 TGGCCTCCGACTTCACACCGGATGAGAGAGCTATGTTTCTGAAGTTCGTGACCAGCTGCTCCAGACCCCCGCTC 2952
||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 2885 TGGCTTCCGACTTCACGCCTGAAGAAAGAGCCATGTTCCTGAAGTTTGTGACCAGCTGCTCCCGGCCCCCGCTC 2958
Query 2953 CTGGGATTCGCCTACCTCAAGCCTCCATTCTCCATCCGCTGCGTGGAGGTGTCGGACGATCAGGACACCGGGGA 3026
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2959 CTAGGATTCGCCTACCTCAAGCCTCCGTTCTCCATCCGCTGTGTGGAAGTATCAGATGACCAGGACACTGGGGA 3032
Query 3027 CACTCTGGGCAGCGTCCTCCGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGCGGGAGCCAGGCGGCCGCCTGCCCACCTCCT 3100
.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||.||.|
Sbjct 3033 TACCCTGGGCAGCGTCCTCAGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGAGGGAGCCAGGGGGGCGTCTGCCCACATCTT 3106
Query 3101 CCACCTGCTTCAACCTGCTCAAGCTGCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTCCTCCGCGAGAAGCTGCGCTACGCC 3174
||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 3107 CCACTTGCTTCAACCTGCTTAAGCTGCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTACTGCGAGAGAAACTACGCTATGCC 3180
Query 3175 ATCAGCATGAACACGGGCTTTGAACTCTCC 3204
|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3181 ATCAGCATGAACACGGGCTTTGAGCTCTCC 3210