Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479415
• Subject: NM_001113566.1
• Aligned Length: 1206
• Identities: 1079
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGTTATTTGACGACGAATC  74
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGGGCACCTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGCTATTTGACGACGAATC  74

Query   75  GGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTG  148
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GGACCCTTTCGAGGTACTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCCG  148

Query  149  GGGCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGGCAAACAGCTGCGCAAGGAGTCC  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.||||||
Sbjct  149  GGGCCAAGAGCGCGGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCGGGCAAACAGTTGCGTAAAGAGTCC  222

Query  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTCGGCGTGGCCGACAAAAAGGAGGAGACGCAGCCGCCGGT  296

Query  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGGCGAGTTGGAAGAAGACCCGATCAACAACTACAGGGTGATGGGAAACTAA  370

Query  371  TTGATAGAAGACCAGAAAGGCGACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGA  444
            |||||||.|||.||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TTGATAGGAGAGCAGAAAGGCGACCACCCCGTGAAAGAAGATTTGAAAAGCCACTTGAAGAAAAAGGTGAAGGA  444

Query  445  GGCGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGG  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GGTGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATCGAACGGCCTATCCGAGGCCGAGGTGGTCTTGGAAGGGGTCGAGG  518

Query  519  GGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGCGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAGCGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592

Query  593  GAAGTGATAGATCTGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCACAACTGGGGAACTGTCAAA  666
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGTGATAGATCTGGCCTGAAGCATGAGGACAAACGCGGAGGTAGCGGCTCTCACAACTGGGGAACTGTCAAA  666

Query  667  GACGAATTAACAGAGTCCCCCAAATACATTCAGAAACAAATATCTTATAATTACAGTGACTTGGATCAATCAAA  740
            ||.||||||||                                             |||.||||||||||||||
Sbjct  667  GATGAATTAAC---------------------------------------------TGATTTGGATCAATCAAA  695

Query  741  TGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCATCCAGTGGCAGACACTGAAAATAAGGAGAATGAAGTTG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||   |.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  696  TGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAG---AGCACCCTGTGGCAGATACTGAAAATAAGGAGAACGAAGTTG  766

Query  815  AAGAGGTAAAAGAGGAGGGTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATTCAAAATAAGGACCGGGCA  888
            |||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  767  AAGAGGTTAAGGAAGAGGGTCCAAAAGAGATGACTCTGGATGAGTGGAAAGCTATTCAAAATAAAGACCGAGCA  840

Query  889  AAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCTGATGGGCAGTGGAAGAAGGGATTTGTTCTTCATAA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  841  AAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGCGCCGATGGACAATGGAAAAAGGGATTTGTTCTGCATAA  914

Query  963  ATCAAAGAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGAAGCCAGCAAATGATATAA  1036
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  ATCAAAAAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCAGTTATGGACCATCATTTCCGGAAGCCAGCAAATGATATAA  988

Query 1037  CGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCGCCCAGGACGTGGCGGCAGGGGAGGACGAGGTGGATGT  1110
            |.|||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||..||
Sbjct  989  CATCTCAACTGGAGATCAATTTTGGAGACTTAGGCCGCCCAGGACGTGGTGGCAGAGGAGGACGTGGTGGGCGT  1062

Query 1111  GGGCGTGGTGGGCGCCCAAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGTCAAGTGCTTCTGCTCCTGATGTGGATGACCC  1184
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1063  GGGCGTGGTGGACGTCCAAACCGTGGCAGCAGGACTGATAAGTCAAGTGCTTCTGCTCCTGATGTAGATGACCC  1136

Query 1185  AGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT  1206
            ||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1137  AGAGGCCTTCCCAGCTCTGGCC  1158