Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479474
• Subject: XM_006516220.3
• Aligned Length: 1253
• Identities: 917
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  ATGGATGAGCTGGTACACGACTTAGCCTCAGCCTTGGAGCAGACATCTGAGCAGAATAAGCTTGGTGAACTGTG  74
            |||||||||||.||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGATGAGCTAGTGCATGACCTGGCCTCAGCCTTGGAGCAGACATCGGAGCAGAGCAAGCTTGGTGAGCTGTG  74

Query   75  GGAGGAGATGGCGCTGAGCCCCCGACAGCAGAGGCGGCAGCTTCGGAAACGCCGAGGTCGGAAGCGTCGTTCTG  148
            ||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  GGAGGAGATGGCCCTGAGCCCCAGACAGCAGAGGCGGCAGCTTCGCAAACGCCGAGGACGGAAGCGCCGGTCTG  148

Query  149  ACTTCACTCACCTGGCAGAGCATACCTGCTGCTACAGCGAGGCCTCTGAGTCAAGTCTGGATGAGGCCACTAAG  222
            ||||.|||||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  ACTTTACTCACCTGGCAGAGCACGCCTGCTGCTTCAGCGAGGCCTCTGAGTCAAGTCTGGATGAAGCCACCAAG  222

Query  223  GACTGTCGAGAAGTGGCTCCGGTGACCAATTTTAGTGACTCTGATGACACAATGGTAGCCAAACGACACCCAGC  296
            |||||.|||||||||||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||..||||.||||||||.||||||||
Sbjct  223  GACTGCCGAGAAGTGGCTCCGCTCACCAACTTCAGTGACTCTGATGACACGGTGGTGGCCAAACGGCACCCAGC  296

Query  297  TCTCAATGCCATTGTCAAGAGTAAGCAACATTCTTGGCATGAATCTGACTCCTTTACTGAAAATGCACCTTGTC  370
            |||||.||||||..|.|.|.||||||||||||||||||..||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  TCTCAGTGCCATCATTAGGGGTAAGCAACATTCTTGGCCCGAGTCTGACTCCTTTACGGAAAACGCACCTTGTC  370

Query  371  GACCACTCAGGCGCAGGCGGAAGGTGAAGCGAGTGACATCAGAGGTGGCTGCTAGCCTTCAGCAGAAGCTGAAG  444
            ||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  GACCCCTCAGGCGCCGGCGGAAGGTGAAGCGAGTGACGTCCGAGGTGGCTGCCAGCCTTCAGCAGAAGCTGAAA  444

Query  445  GTGTCAGATTGGAGCTATGAGAGAGGCTGCAGGTTCAAGTCTGCTAAGAAGCAGCGTCTGTCCCGCTGGAAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GTGTCAGATTGGAGCTATGAGAGAGGCTGCAGGTTCAAGTCTGCCAAGAAGCAGCGTCTATCCCGCTGGAAGGA  518

Query  519  GAATACTCCCTGGACCTCATCAGGCCACGGATTGTGTGAATCAGCAGAAAATAGGACTTTCCTAAGCAAAACAG  592
            |||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct  519  GAATACTCCCTGGACCTCATCTGGCCATGGGCTGTGTGAATCAGCAGAGAATCGGACTTTCCTAAGCCAACCAG  592

Query  593  GAAGGAAAGAAAGGATGGAGTGTGAAACAGATGAACAAAAACAGGGCTCTGATGAGAACATGTCAGAATGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||.|||.|.||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct  593  GAAGGAAAGAAAGGATGGAGTGCGAAGCCGAAGAGCAGAAGCACGGCTCTGACGAGAACATGTCCGAGTGTGAC  666

Query  667  ACCAGCAGTGTGTGTAGCAGCAGTGACACTGGGCTCTTTACCAATGATGAAGGGCGACAAGGTGATGACGAACA  740
            ||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct  667  ACTAGCAGTGTGTGCAGCAGCAGTGACACGGGGCTCTTCACCAATGATGAAGGACGACAAGGGGATGATGAGCA  740

Query  741  GAGTGATTGGTTCTATGAAGGAGAATGTGTCCCAGGATTCACTGTCCCTAATCTTCTGCCCAAGTGGGCTCCTG  814
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGTGATTGGTTTTATGAAGGAGAATGTGTCCCCGGATTCACTGTCCATAACCTTCTGCCCAAGTGGGCTCCTG  814

Query  815  ATCATTGTTCTGAAGTAGAAAGAATGGATTCTGGATTGGATAAATTTTCTGATTCCACATTCCTTTTACCTTCT  888
            ||||.||..|||||||||||||.|||||.||.||..||||||||.|.||.||..||||.||||||||||||||.
Sbjct  815  ATCACTGCACTGAAGTAGAAAGGATGGACTCCGGCCTGGATAAACTCTCAGACCCCACGTTCCTTTTACCTTCC  888

Query  889  CGGCCAGCTCAAAGAGGGTACCATACTCGCTTGAATCGTCTACCTGGAGCTGCAGCTCGATGCCTCAGAAAGGG  962
            |||||||||||||||||.||||||..|||..|||||.|..|.||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  889  CGGCCAGCTCAAAGAGGATACCATGGTCGTCTGAATAGGTTGCCAGGAGCTGCAGCTCGTTGCCTCAGGAAGGG  962

Query  963  GCGAAGAAGGCTGGTTGGGAAGGTGATACCTCTCACAGTTAGCTTG-GCTCAG--TGG----GGAGATAAT---  1026
            |||.|||||||||..||||||||.|            |..|||.|| |  |||  |||    |||||..||   
Sbjct  963  GCGGAGAAGGCTGCCTGGGAAGGAG------------GCGAGCATGAG--CAGCCTGGGGACGGAGAGGATCGG  1022

Query 1027  --ATTCCCT-------------------------ATGGGAG-------TTGTG--TATCCT---AT--------  1053
              ||.||.|                         |||.|||       ||.||  |.||||   ||        
Sbjct 1023  CCATACCATCAGTGACCCCCGGCAGACAGAAAAGATGAGAGCATTGGCTTCTGGTTCTCCTTCCATTTCTGCTT  1096

Query 1054  --------------------------------------------------------------------------  1053
                                                                                      
Sbjct 1097  GTGTACACGAGTTTAATCCACTCTCCCCTCTTTACTCCCTGGACGTTCTTGCTGATGCTTCTCATCGAAGGTGC  1170

Query 1054  ---------------------------------------------------------------------  1053
                                                                                 
Sbjct 1171  TCACCTGCACACTGCTCTGCCAGTGCACCCAGATGTTCTGGAGCCGGCCATCCCAGCTCAGAAGCCTCC  1239