Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479488
• Subject: NM_173015.3
• Aligned Length: 1668
• Identities: 1401
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGAGGTCGGAGGAGACACTGCTGCCCCGGCCCCCGGGGGCGCGGAGGACTTGGAGGACACGCAGTTCCCCAG  74
            |||||||.|||||||||.|.|||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCCGGAGGAGATAATGCTGTCCCAGCCCCCGGGGGCGTGGAGGACTTGGTGGACACGCAGTTCCCCAG  74

Query   75  TGAGGAAGCTAGAGAAGGTGGAGGGGTTCACGCGGTCCCGCCGGATCCCGAAGACGAGGGCCTGGAGGAAACAG  148
            .|||||.|||.||||..|||.|.||||||||||...|.|||.||||||||.|||.|.||.||.||||||.||||
Sbjct   75  AGAGGAGGCTGGAGACAGTGAAAGGGTTCACGCAAGCACGCTGGATCCCGGAGATGGGGACCCGGAGGACACAG  148

Query  149  GATCCAAGGACAAGGACCAGCCACCCAG---CCCATCACCACCGCCCCAGTCAGAGGCCCTG--TCAAGCACCT  217
            ||||      |||||||||||||.||||   ||.||||||.|.|||.|||.|.||||  |||  ||||||||||
Sbjct  149  GATC------CAAGGACCAGCCATCCAGCCTCCTATCACCTCTGCCTCAGACTGAGG--CTGCATCAAGCACCT  214

Query  218  CTCGGCTCTGG---AGTCCTGCAGCCCCTGAGAATAGTCCCACATGTAG-CCCTGAGAGTAGCTCTGGAGGCCA  287
            .|..||.||||   |.|.|.||||||.|.||.|..|| |||.|..|.|| .||||||||||.|||||..||.||
Sbjct  215  GTGAGCACTGGGAAACTGCAGCAGCCTCAGACAGCAG-CCCCCCCGGAGAACCTGAGAGTAACTCTGAGGGTCA  287

Query  288  G------------------GGCGGGGACCCCAGTGATGAGGAGTGGCGCAGCCAGCGGAAGCATGTGTTTGTGC  343
            |                  ||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  288  GGGAGAAGACCCCGACGATGGGGGGGACCCCAGTGACGAGGACTGGCGCAGCCAGCGGAAGCACGTGTTCGTGC  361

Query  344  TGAGTGAGGCTGGCAAGCCCATCTACTCGCGGTATGGTAGTGTGGAGGCGCTGTCGGCTACCATGGGTGTAATG  417
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct  362  TGAGTGAGGCAGGCAAGCCCATCTACTCACGGTACGGTAGCGTGGAGGCACTGTCGGCCACCATGGGGGTGATG  435

Query  418  ACCGCCCTGGTGTCCTTTGTGCAGAGTGCGGGAGATGCCATCCGTGCCATCTACGCTGAGGACCACAAGCTGGT  491
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  436  ACAGCCCTGGTGTCCTTTGTGCAGAGTGCAGGAGACGCCATCCGTGCCATCTATGCTGAGGATCACAAGCTGGT  509

Query  492  GTTCCTACAACAGGGCCCACTGTTGCTCGTGGCCATGTCACGGACTTCTCAGTCAGCAGCCCAGCTGCGGGGGG  565
            ||||||.||.|||||.|||||..||||||||||..||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct  510  GTTCCTGCAGCAGGGTCCACTCCTGCTCGTGGCTGTGTCCCGGACTCCACAGTCTGCAGCACAGCTACGAGGTG  583

Query  566  AGCTGCTAGCTGTGCACGCACAGATCGTGAGCACACTTACACGTGCAAGTGTCGCCCGCATCTTCGCACACAAG  639
            |.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  584  AACTGCTTGCTGTACACGCCCAAATTGTGAGCACACTAACGCGTGCAAGCGTGGCCCGCATCTTCGCACATAAG  657

Query  640  CAGAACTATGACCTCCGCCGCCTGCTGGCTGGTTCAGAGCGCACACTGGACCGACTTCTGGACAGTATGGAGCA  713
            |||||||||||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.||..||||||||.|||||||
Sbjct  658  CAGAACTATGACCTCCGTCGCCTGTTGGCCGGCTCAGAGCGCACACTGGACCGGCTCTTGGACAGTGTGGAGCA  731

Query  714  GGACCCAGGAGCCCTGCTCCTGGGTGCCGTGCGCTGTGTGCCCCTTGCCCGCCCGCTGCGAGACGCACTAGGTG  787
            .|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.||..
Sbjct  732  AGACCCGGGCGCCCTGCTCCTGGGCGCTGTGCGCTGTGTGCCTCTGGCCCGTCCACTGCGGGATGCCCTGGGCA  805

Query  788  CGCTCCTCCGACGTTGCACAGCGCCTGGCCTGGCGCTGTCAGTGCTGGCAGTAGGCGGTCGACTTATAACAGCA  861
            |.||.||.||.||.||.|||||.||.||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|..
Sbjct  806  CACTACTGCGGCGCTGTACAGCCCCAGGCCTGGCCTTGTCAGTGCTGGCTGTTGGCGGTCGACTGATAACCGTG  879

Query  862  GCCCAGGAGCGGAATGTGCTGGCCGAGTGCCGGCTGGACCCAGCTGACCTGCAGTTGCTGCTCGACTGGGTGGG  935
            |||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  880  GCCCAGGAGAGGAATGTGCTGGCGGAGTGCCGGCTGGACCCTGCTGATCTACAGTTGCTGCTTGACTGGGTGGG  953

Query  936  TGCACCAGCCTTTGCGGCGGGTGAGGCTTGGGCACCTGTGTGCCTGCCCCGCTTCAACCCTGATGGTTTTTTCT  1009
            ||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  954  TGCACCAGCCTTCGCGGCAGGTGAAGCATGGGCACCTGTGTGCCTGCCTCGCTTTAACCCAGATGGTTTCTTCT  1027

Query 1010  ACGCCTACGTGGCCCGCCTGGATGCTATGCCTGTCTGCCTGCTGCTGCTTGGCACCCAACGTGAAGCCTTCCAT  1083
            |.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1028  ATGCCTATGTGGCCCGCCTGGATTCCATGCCCGTCTGCCTGCTGCTGCTTGGTACCAACCGTGAAGCCTTCCAT  1101

Query 1084  GCCATGGCCGCCTGCCGGCGCCTGGTTGAAGATGGGATGCATGCCCTTGGTGCCATGCGTGCCCTTGGGGAGGC  1157
            |||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||...||||||||||.|||||.|.|||||||||||
Sbjct 1102  GCCATGGCCGCCTGCCGGCGCTTAGTTGAAGATGGGATGCACAACCTTGGTGCCCTGCGTACTCTTGGGGAGGC  1175

Query 1158  TGCCAGCTTCTCTAATGCCTCATCAGCCAGTGCTCCTGCCTACAGCGTGCAGGCTGTCGGGGCGCCGGGCCTCC  1231
            |||||.|||||||||||.|.||.||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 1176  TGCCAACTTCTCTAATGGCCCAGCAGCCAGTGCCCCAGCCTACAGTGTGCAGGCTGTGGGAGCCCCTGGCCTCC  1249

Query 1232  GGCACTTCCTGTATAAGCCGCTGGACATCCCTGACCACCACCACCAACTGCCCCAGTTTACCAGCCCTGAGCTA  1305
            ||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||.|||.|||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1250  GGCATTTTCTCTATAAGCCACTGGATATCCCTGAACAACACCGCCAGCTGCCACAGTTTACCAGTCCCGAGCTA  1323

Query 1306  GAGGCCCCCTACAGCAGAGAGGAGGAGCGGCAGCGGCTGTCGGACCTGTACCACCGCCTGCATGCTCGTCTCCA  1379
            ||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1324  GAGGCCCCATACAGCAGAGAGGAAGAGCGACAGCGACTGTCAGACTTGTATCACCGCCTGCATGCTCGCCTCCA  1397

Query 1380  CAGCACCTCCCGACCCCTGCGCCTCATTTACCACGTGGCTGAGAAGGAGACACTACTGGCCTGGGTGACCTCCA  1453
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1398  CAGCACCTCCCGGCCCCTGCGCCTCATTTACCACGTGGCTGAGAAAGAGACGCTGCTGGCTTGGGTGACTTCCA  1471

Query 1454  AATTCGAGCTCTATACCTGCCTCAGCCCTCTGGTGACCAAGGCAGGTGCAATCTTGGTAGTGACCAAACTCCTG  1527
            |.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||.||
Sbjct 1472  AGTTTGAGCTCTATACTTGCCTCAGCCCCCTGGTAACCAAGGCTGGTGCCATCTTAGTAGTGACGAAGCTCTTG  1545

Query 1528  CGCTGGGTGAAGAAAGAGGAGGACCGGCTCTTCATTCGTTACCCACCCAAGTACTCCACACCACCAGCCACCTC  1601
            ||||||||.|.|||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1546  CGCTGGGTAAGGAAGGAAGAGGACCGGCTTTTCATCCGTTACCCACCCAAATACTCCACACCCCCATCCACCTC  1619

Query 1602  TACGGACCAAGCTGCCCATAATGGCTTGTTCACTGGACTC  1641
            ..|||||||.||..||.|.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1620  GGCGGACCAGGCCCCCAACAATGGCTTGTTCACAGGACTC  1659