Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479503
• Subject: NM_006483.3
• Aligned Length: 1887
• Identities: 1767
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCAGGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCAGGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGA  74

Query   75  TGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTG  148

Query  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCG  222

Query  223  CCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTA  296

Query  297  CATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAATTGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAATTGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370

Query  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTC  444

Query  445  CTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATGAACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATGAACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATAT  518

Query  519  AGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTGCCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTGCCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592

Query  593  ACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGAACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGAACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGC  666

Query  667  ACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATTCACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATTCACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCT  740

Query  741  GTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGGCAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGGCAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACC  814

Query  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCCTGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCCTGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATG  888

Query  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCA  962

Query  963  GATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGCCATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGCCATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGT  1036

Query 1037  ACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACGAAAGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCC  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct 1037  ACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACGAAAGAACTCAGGA-----------------  1093

Query 1111  GGGACACGGCGGCTGCAGGAGGTGCTGGGCGTGCAGACGGGCGGGCCCGGGGGCCGGCGGGCGGGGGAGCCGGG  1184
                                                                                      
Sbjct 1094  --------------------------------------------------------------------------  1093

Query 1185  CCACAGCCCCGCCGACTACCTCCGCTTCCAGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCA  1258
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094  -----------------------------AGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCA  1138

Query 1259  TCAGCCCCCTGGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  TCAGCCCCCTGGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCA  1212

Query 1333  GGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGCCCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  GGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGCCCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAG  1286

Query 1407  TTCTGGAGGCTCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTACCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  TTCTGGAGGCTCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTACCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTG  1360

Query 1481  GGCCCCCTATCACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCCACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  GGCCCCCTATCACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCCACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGG  1434

Query 1555  GGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCCTCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  GGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCCTCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACC  1508

Query 1629  CCCCCAGCCCCGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTCACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  CCCCCAGCCCCGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTCACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCC  1582

Query 1703  TGGTGGGCGGCCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGCCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583  TGGTGGGCGGCCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGCCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTC  1656

Query 1777  CGGACTCGGATGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657  CGGACTCGGATGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGG  1730

Query 1851  CCTCCGTGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG  1887
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731  CCTCCGTGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG  1767