Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479503
• Subject: NM_010092.2
• Aligned Length: 1887
• Identities: 1630
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCAGGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGA  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.|.|||||
Sbjct    1  ATGGCCGTCCCACCAGGCCATGGTCCTTTCTCTGGCTTTCCGGGGCCCCAGGAACACACACAGGTACTACCTGA  74

Query   75  TGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTG  148
            |||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  TGTGCGGCTCCTGCCCCGGAGACTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCGGCCTCAGCCCCGCTGCGCAAGCTCTCGG  148

Query  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAACAGGCG  222

Query  223  CCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTA  296
            |||||||||||.|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CCACCCCAGGACTCGAGCACCAAAAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCACGGTTATGATGACGACAACCACGACTA  296

Query  297  CATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAATTGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATTGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTAGAGCGCTATGAGATTGACTCTCTTATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370

Query  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTC  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCACCAGACTCAGGAGCTGGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCCTTC  444

Query  445  CTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATGAACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATAT  518
            |||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  CTGAACCAGGCACAGATTGAGCTACGGCTGTTGGAGCTGATGAACCAGCATGATACAGAGATGAAGTACTACAT  518

Query  519  AGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTGCCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTACACCTTAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAATCACCTGTGCCTGGTGTTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592

Query  593  ACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGAACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGC  666
            ||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||..||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  ACGACCTCCTCCGCAACACACACTTTCGGGGTGTCTCACTGAACCTGACGAGGAAGCTGGCACAGCAGCTCTGC  666

Query  667  ACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATTCACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCT  740
            ||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||.||||
Sbjct  667  ACAGCTCTGCTCTTTCTGGCCACCCCCGAGCTCAGCATCATCCACTGCGACCTCAAGCCTGAGAACATCCTGCT  740

Query  741  GTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGGCAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACC  814
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  741  CTGCAACCCCAAGCGCAGTGCCATCAAGATCGTGGACTTCGGCAGTTCCTGCCAGCTTGGCCAGCGGATCTACC  814

Query  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCCTGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCCGAGGTGCTCCTGGGTACACCCTATGACCTGGCCATTGACATG  888

Query  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCA  962
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTCGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCTAATGAGGTGGACCA  962

Query  963  GATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGCCATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGT  1036
            |||||.|||.||||||||||||.||||||||||.||.||..||||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  963  GATGAGCCGTATTGTGGAGGTGTTGGGCATCCCTCCCGCACCCATGCTGGAACAGGCACCCAAGGCTCGAAAGT  1036

Query 1037  ACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACGAAAGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCC  1110
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||                 
Sbjct 1037  ACTTTGAGCGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACAAAGGAACTCAGGA-----------------  1093

Query 1111  GGGACACGGCGGCTGCAGGAGGTGCTGGGCGTGCAGACGGGCGGGCCCGGGGGCCGGCGGGCGGGGGAGCCGGG  1184
                                                                                      
Sbjct 1094  --------------------------------------------------------------------------  1093

Query 1185  CCACAGCCCCGCCGACTACCTCCGCTTCCAGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCA  1258
                                         |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1094  -----------------------------AGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAATATGAGCCCGCCGCCCGCA  1138

Query 1259  TCAGCCCCCTGGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCA  1332
            |||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  TCAGCCCTCTGGGCGCTCTGCAGCATGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCA  1212

Query 1333  GGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGCCCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAG  1406
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  GGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCGGCGCCCCTTGACACCTGCCCCTCCTCTAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAG  1286

Query 1407  TTCTGGAGGCTCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTACCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTG  1480
            .||||||||.||||||||||||||||..||||||.|..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1287  CTCTGGAGGTTCCAGTGGCTCCTCCAACGACAACAGAGCCTACCGATACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCAG  1360

Query 1481  GGCCCCCTATCACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCCACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGG  1554
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1361  GGCCCCCCATCACTGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCTACCCTCCCAGCCTCTGCGCCCCTGGGCAGGG  1434

Query 1555  GGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCCTCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACC  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||..||.||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1435  GGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTATCTCTGCCTCAACATTGCCGGGGACTGGGGCTCAGTTACC  1508

Query 1629  CCCCCAGCCCCGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTCACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCC  1702
            |||...||||||.|.||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1509  CCCATTGCCCCGTTGCCTTGGACGACCCCCATCACCAACATCACCACCACCCCCAGAGTTGATGGATGTGAGCC  1582

Query 1703  TGGTGGGCGGCCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGCCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTC  1776
            ||||||||.|||||.|.||||||||.|||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583  TGGTGGGCAGCCCTCCAGACTGCTCTCCACCTCCTCCAGCACCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTC  1656

Query 1777  CGGACTCGGATGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGG  1850
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1657  CGGACTCGGATGACAGGAGGTCGACCACCTCTCCCACCCCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCGCCTGGG  1730

Query 1851  CCTCCGTGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG  1887
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1731  TCTCCATGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCA  1767