Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479503
- Subject:
- XM_006539526.3
- Aligned Length:
- 2067
- Identities:
- 1665
- Gaps:
- 264
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTGGCCGCTCGCCCACCGCACTGGGGTCCCCATCGCGCTCCAGCCCCCCGTGGGCCCAGCGCCATCCCTGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCCGGGTCTCAGCGGCGGTGGCAGCCGAGGTGCAGGATGCGAGAAGGCGCCCCCCGGCCGGGCTCCCGCTCCAG 148
Query 1 --------------------------------ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCA 42
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 149 GCCTCACGCCCCTGCGGCCCTCTGAGCCCACCATGGCCGTCCCACCAGGCCATGGTCCTTTCTCTGGCTTTCCG 222
Query 43 GGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGATGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGA 116
|||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGCCCCAGGAACACACACAGGTACTACCTGATGTGCGGCTCCTGCCCCGGAGACTGCCCCTGGCCTTCCGGGA 296
Query 117 TGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTGTGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACT 190
|||..||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCGGCCTCAGCCCCGCTGCGCAAGCTCTCGGTGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACT 370
Query 191 ATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCGCCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTG 264
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAACAGGCGCCACCCCAGGACTCGAGCACCAAAAAGGAGAAGAAGGTCCTG 444
Query 265 AACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTACATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAAT 338
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 445 AACCACGGTTATGATGACGACAACCACGACTACATTGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTAGAGCGCTATGAGAT 518
Query 339 TGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCCAGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGG 412
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 519 TGACTCTCTTATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCCAGGTGGTGAAAGCCTATGATCACCAGACTCAGGAGCTGGTGG 592
Query 413 CCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTCCTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATG 486
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 593 CCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCCTTCCTGAACCAGGCACAGATTGAGCTACGGCTGTTGGAGCTGATG 666
Query 487 AACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATATAGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTG 560
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 AACCAGCATGATACAGAGATGAAGTACTACATAGTACACCTTAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAATCACCTGTG 740
Query 561 CCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGTACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGA 634
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 741 CCTGGTGTTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGTACGACCTCCTCCGCAACACACACTTTCGGGGTGTCTCACTGA 814
Query 635 ACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGCACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATT 708
|||||||..||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 815 ACCTGACGAGGAAGCTGGCACAGCAGCTCTGCACAGCTCTGCTCTTTCTGGCCACCCCCGAGCTCAGCATCATC 888
Query 709 CACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCTGTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGG 782
|||||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 CACTGCGACCTCAAGCCTGAGAACATCCTGCTCTGCAACCCCAAGCGCAGTGCCATCAAGATCGTGGACTTCGG 962
Query 783 CAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACCAGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCC 856
|||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 963 CAGTTCCTGCCAGCTTGGCCAGCGGATCTACCAGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCCGAGGTGCTCC 1036
Query 857 TGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATGTGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAG 930
||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGGTACACCCTATGACCTGGCCATTGACATGTGGTCCCTGGGCTGCATCCTCGTGGAGATGCACACCGGAGAG 1110
Query 931 CCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCAGATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGC 1004
|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||.||||||||||.||.||..|
Sbjct 1111 CCCCTCTTCAGTGGCTCTAATGAGGTGGACCAGATGAGCCGTATTGTGGAGGTGTTGGGCATCCCTCCCGCACC 1184
Query 1005 CATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGTACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGA 1078
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATGCTGGAACAGGCACCCAAGGCTCGAAAGTACTTTGAGCGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGA 1258
Query 1079 CGAAAGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCCGGGACACGGCGGCTGCAGGAGGTGCTGGGCGTGCAGACGGGC 1152
|.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAAAGGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCTGGGACACGGCGGCTGCAGG----------------------- 1309
Query 1153 GGGCCCGGGGGCCGGCGGGCGGGGGAGCCGGGCCACAGCCCCGCCGACTACCTCCGCTTCCAGGACCTGGTGCT 1226
|||||||||||||
Sbjct 1310 -------------------------------------------------------------AGGACCTGGTGCT 1322
Query 1227 GCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCCCTGGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCA 1300
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1323 GCGCATGCTGGAATATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCTCTGGGCGCTCTGCAGCATGGCTTCTTCCGCCGCA 1396
Query 1301 CGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGC 1374
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1397 CGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCGGCGCCCCTTGACACCTGC 1470
Query 1375 CCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGTTCTGGAGGCTCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTA 1448
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||..||||||.|..||||
Sbjct 1471 CCCTCCTCTAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGCTCTGGAGGTTCCAGTGGCTCCTCCAACGACAACAGAGCCTA 1544
Query 1449 CCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTGGGCCCCCTATCACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCC 1522
|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 CCGATACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCAGGGCCCCCCATCACTGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCC 1618
Query 1523 CACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCC 1596
.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1619 TACCCTCCCAGCCTCTGCGCCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTATCTCTGCC 1692
Query 1597 TCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACCCCCCCAGCCCCGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTC 1670
||..||.||||.|||||.|||||.|||||||||||...||||||.|.||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1693 TCAACATTGCCGGGGACTGGGGCTCAGTTACCCCCATTGCCCCGTTGCCTTGGACGACCCCCATCACCAACATC 1766
Query 1671 ACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCGGCCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGC 1744
||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||||.|||||||..|||||.|
Sbjct 1767 ACCACCACCCCCAGAGTTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCAGCCCTCCAGACTGCTCTCCACCTCCTCCAGCAC 1840
Query 1745 CTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGATGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCT 1818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1841 CTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGATGACAGGAGGTCGACCACCTCTCCCACCCCCT 1914
Query 1819 GATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGGCCTCCGTGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG 1887
|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1915 GATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCGCCTGGGTCTCCATGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCA 1983