Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479506
- Subject:
- XM_006507239.3
- Aligned Length:
- 2177
- Identities:
- 1863
- Gaps:
- 82
Alignment
Query 1 ATGGCAACCCCGGCGGCGGTCAACCCTCCGGAAATGGCTTCAGACATACCTGGATCTGTGACGTTGCCCGTTGC 74
||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGGCAACCCCGGCCGCCGTCAACCCTCCGGAGATGGCGTCAGACATACCAGGATCTGTGGCCTTGCCTGTTGC 74
Query 75 CCCCATGGCGGCCACCGGACAGGTGAGGATGGCGGGGGCCATGCCTGCCCGTGGAGGAAAGCGGCGTTCCGGAA 148
|||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 CCCCATGGCAGCCACCGGACAGGTGAGAATGGCAGGGGCCATGCCTGCCCGAGGAGGAAAGCGTCGATCCGGAA 148
Query 149 TGGACTTCGATGATGAAGATGGTGAAGGCCCCAGTAAATTTTCAAGAGAGAATCATAGTGAAATCGAAAGGCGC 222
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||| |||||.||.||..|||||
Sbjct 149 TGGACTTCGATGACGAAGATGGTGAAGGTCCCAGTAAATTCTCA------------AGTGAGATTGAGCGGCGC 210
Query 223 AGACGGAACAAGATGACTCAGTACATCACGGAGCTCTCCGACATGGTCCCCACATGCAGCGCACTGGCTCGGAA 296
||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||||
Sbjct 211 AGGCGGAACAAGATGACTCAATATATTACGGAACTCTCCGACATGGTTCCCACCTGCAGTGCACTGGCTAGGAA 284
Query 297 GCCAGACAAGCTCACCATCCTCCGCATGGCCGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGTACAGGGAACAAGTCCA 370
||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 285 GCCAGACAAGCTGACCATCCTGCGCATGGCGGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGCACCGGCAACAAATCGA 358
Query 371 CCGATGGCGCGTACAAGCCTTCCTTCCTCACAGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTTGAAGCAGCTGATGGA 444
|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 359 CTGACGGCGCCTACAAGCCTTCCTTCCTCACTGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTGGAAGCCGCTGATGGA 432
Query 445 TTTCTGTTTGTGGTGGCTGCTGAGACAGGGCGAGTGATTTATGTGTCTGACTCCGTCACCCCTGTTCTGAACCA 518
|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 433 TTTCTGTTTGTGGTGGCAGCTGAGACAGGGAGAGTCATCTACGTGTCTGATTCGGTCACTCCTGTCCTGAACCA 506
Query 519 GCCCCAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACACTGTATGAACAGGTGCATCCTGATGACGTGGAGAAGCTGAGAGAGC 592
|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 507 GCCACAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACGCTTTATGAGCAGGTGCACCCTGATGACGTGGAGAAACTGAGGGAAC 580
Query 593 AACTGTGCACCTCAGAAAACTCAATGACAGGCCGGATCTTGGACCTGAAGACTGGGACGGTCAAGAAAGAAGGG 666
|.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct 581 AGCTGTGCACTTCGGAAAACTCCATGACAGGCCGCATCCTGGACCTGAAGACTGGGACAGTGAAGAAGGAGGGA 654
Query 667 CAGCAGTCATCCATGAGGATGTGCATGGGCTCGCGGCGGTCTTTCATCTGCAGGATGAGGTGTGGAAATGCTCC 740
|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 655 CAGCAGTCATCCATGCGCATGTGTATGGGCTCTCGGCGCTCCTTCATCTGTAGGATGAGGTGTGGAAACGCTCC 728
Query 741 TTTGGACCACCTTCCTCTAAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 814
.|||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 CTTGGACCACCTGCCTTTGAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 802
Query 815 AAGGAGAAGCCCAATATGCTGTGGTCCACTGTACAGGATACATCAAGGCCTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 888
|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 AAGGAGAAGCCCAGTATGCTGTGGTCCACTGCACAGGTTACATCAAGGCTTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 876
Query 889 CCTGAAGAAGACGCTGATGTGGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGACTCCAGGTGACCAG 962
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 877 CCCGAAGAAGACGCTGATGTCGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGGCTCCAGGTGACCAG 950
Query 963 CTCTCCTGTATGCATGGACATGAATGGGATGTCGGTGCCCACAGAGTTCTTATCCCGGCATAACTCCGATGGAA 1036
|||||||||.|||||||||||||..||.|||||.|||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 951 CTCTCCTGTGTGCATGGACATGAGCGGCATGTCAGTGCCCACAGAGTTCCTGTCACGGCACAACTCTGATGGGA 1024
Query 1037 TCATCACATTTGTGGATCCAAGATGTATCAGTGTGATTGGCTACCAACCGCAGGATCTTCTGGGAAAGGACATT 1110
|.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1025 TTATCACGTTTGTGGACCCCAGATGCATCAGTGTGATTGGCTACCAGCCCCAGGACCTTCTGGGAAAGGATATT 1098
Query 1111 TTGGAATTCTGCCACCCTGAGGATCAAAGCCATCTGCGTGAGAGCTTCCAGCAGGTGGTTAAGCTGAAAGGCCA 1184
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1099 TTGGAATTTTGCCACCCTGAGGATCAGAGCCACCTACGGGAGAGCTTCCAACAGGTGGTTAAGCTGAAGGGCCA 1172
Query 1185 AGTCCTGTCGGTCATGTATCGATTTCGCACCAAGAACCGGGAGTGGATGTTGATCCGCACCAGCAGCTTCACAT 1258
|||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1173 AGTGCTGTCGGTCATGTATCGGTTCCGCACCAAGAACCGGGAGTGGCTGTTGATCCGTACCAGCAGCTTCACCT 1246
Query 1259 TCCAGAATCCCTATTCTGATGAGATTGAGTACATCATCTGCACCAACACCAACGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1332
|||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 TCCAGAACCCCTACTCTGATGAGATCGAGTACGTCATCTGCACCAACACCAATGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1320
Query 1333 CAGGCAGAATTGGAAGTGCACCAGAGAGATGGATTGTCATCGTATGACTTATCCCAGGTCCCCGTCCCCAACCT 1406
|||||||||.||||.||.||.|||.|||||||..||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1321 CAGGCAGAACTGGAGGTACATCAGCGAGATGGGCTGTCGTCATATGACTTATCTCAGGTCCCAGTACCCAACCT 1394
Query 1407 ACCAGCCGGTGTTCATGAGGCCGGGAAGTCCGTGGAAAAGGCGGATGCAATCTTCTCCCAGGAAAGAGATCCTC 1480
|||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1395 ACCCGCTGGTGTTCACGAGGCCGGGAAGTCTGTGGAAAAGGCAGATGCAATCTTCTCCCAAGAGAGAGACCCTC 1468
Query 1481 GGTTTGCTGAAATGTTTGCAGGAATTAGTGCATCGGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCTGCAGCAGGAACC 1554
|.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.|.|
Sbjct 1469 GTTTTGCTGAGATGTTTGCAGGCATCAGTGCATCTGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCAGCATCAGGCAGC 1542
Query 1555 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGCCCATTTCCCT-CTGGACACTCCGGGAAGGCCTTCAGCTCTTCAGTGGTTC 1627
|||||||||||||||||||||||.||| |||||| |.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1543 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGTCCA-TTCCCTGCCGGGCACTCGGGCAAGGCCTTCAGCTCTTCCGTGGTCC 1615
Query 1628 ATGTGCCTGGAGTGAATGATATTCAGTCCTCTTCTTCCACGGGCCAGAACATGTCCCAAATCTCCCGGCAGCTA 1701
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1616 ATGTGCCTGGAGTGAATGACATTCAGTCCTCCTCCTCAACGGGACAGAACATATCCCAGATCTCTCGGCAGCTG 1689
Query 1702 AACCAGAGTCAGGTGGCATGGACAGGGAGTCGTCCGCCCTTTCCGGGACAGCAAATCCCATCTCAGTCCAGCAA 1775
||||||.|.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.|||| |||||||
Sbjct 1690 AACCAGGGCCAGGTGGCATGGACAGGCAGCCGTCCACCGTTCCCAGGGCAGC---------------CCAGCAA 1748
Query 1776 GACTCAGTCATCTCCCTTTGGGATTGGAACGAGCCACACCTACCCGGCAGACCCCTCTTCCTACAGCCCCCTCT 1849
|||.|||||||||.||||.||.||||||.|.||||||.|.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 1749 GACGCAGTCATCTGCCTTCGGAATTGGATCAAGCCACCCTTACCCGGCTGACCCTTCATCCTACAGTCCTCTCT 1822
Query 1850 CCAGCCCAGCTACCTCCTCGCCAAGTGGGAATGCCTACTCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTCGCTGAA 1923
|||||||||||.|||||||.||||||||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1823 CCAGCCCAGCTGCCTCCTCACCAAGTGGAAACGCATACCCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTTGCTGAG 1896
Query 1924 AGTGGACAAAGTAGCGGGCAGTTCCAAGGGCGGCCCTCGGAAGTCTGGTCGCAGTGGCAAAGCCAGCACCATGG 1997
||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1897 AGTGGACAGAGTGGCGGGCAGTTCCAGGGCCGGCCCTCGGAGGTCTGGTCCCAGTGGCAGAGCCAGCATCACGG 1970
Query 1998 CCAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCCCACCAGCAGCCCGGTCAGACTGAAGTGTTCCAGGACATGCTGCCCATGC 2071
.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1971 ACAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCGCATCAGCAGCCTGGCCAGACTGAAGTGTTCCAGGACATGCTACCCATGC 2044
Query 2072 CAGGAGATC-----CAGGGAATGAATGGTGGTCTCCCCACT-----CCCGGCAGCACTTTAGGCAGCCCATAAG 2135
|.||.||.| ||||| ||.||| |.||| ..|| ||.||||| ||.|.||
Sbjct 2045 CGGGCGACCCGACGCAGGG---GACTGG--------CAACTATAACATCG--AGGACTTT--GCTGACC----- 2098
Query 2136 CTATGCGAGAATG------------------ 2148
.|.|.|||
Sbjct 2099 -----TGGGCATGTTCCCTCCATTTTCTGAG 2124