Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479509
• Subject: NM_001351044.1
• Aligned Length: 1617
• Identities: 1530
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGCGCAGGGTTTCGCAGTGGGCTTCGACCCACTGGGCCTAGGAGACCTGAGCTCCGGCTCTCTGAGCTCCCT  74
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Sbjct    1  ATGGCGCAGGGTTTCGCAGTGGGCTTCGACCCACTGGGCCTAGGAGACCTGAGCTCCGGCTCTCTGAGCTCCCT  74

Query   75  CTCCTCCCGAGGCCACCTAGGCAGCGACTCAGGCTCCACCGCAACGCGATACCTGCTAAGGAAGCAACAACGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCTCCCGAGGCCACCTAGGCAGCGACTCAGGCTCCACCGCAACGCGATACCTGCTAAGGAAGCAACAACGGC  148

Query  149  TGCTGAACGGGCCCCCCCGCGGAATCCGAGCCTCATCGCCCATGGGACGCGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGAACGGGCCCCCCCGCGGAATCCGAGCCTCATCGCCCATGGGACGCGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC  222

Query  223  GAAGCCAACAGTGATGAAAGTGACATCATCCATTCAGTCCGGGTGGAGAAGAGTCCAGCAGGGAGGCTGGGCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGCCAACAGTGATGAAAGTGACATCATCCATTCAGTCCGGGTGGAGAAGAGTCCAGCAGGGAGGCTGGGCTT  296

Query  297  CAGCGTGCGCGGGGGCTCAGAGCATGGCCTGGGCATCTTCGTCAGCAAAGTGGAGGAAGGCAGCAGTGCAGAGC  370
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Sbjct  297  CAGCGTGCGCGGGGGCTCAGAGCATGGCCTGGGCATCTTCGTCAGCAAAGTGGAGGAAGGCAGCAGTGCAGAGC  370

Query  371  GGGCTGGCCTGTGCGTGGGGGACAAGATCACGGAGGTGAATGGGCTGAGCCTGGAGAGCACCACCATGGGTAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGCTGGCCTGTGCGTGGGGGACAAGATCACGGAGGTGAATGGGCTGAGCCTGGAGAGCACCACCATGGGTAGC  444

Query  445  GCCGTAAAGGTGCTGACCAGCAGCAGCCGCCTGCACATGATGGTTCGGCGCATGGGCCGTGTGCCGGGCATCAA  518
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Sbjct  445  GCCGTAAAGGTGCTGACCAGCAGCAGCCGCCTGCACATGATGGTTCGGCGCATGGGCCGTGTGCCGGGCATCAA  518

Query  519  GTTCTCCAAGGAGAAGACCACGTGGGTGGATGTGGTGAATCGGCGCCTGGTAGTGGAGAAGTGCGGTTCAACAC  592
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Sbjct  519  GTTCTCCAAGGAGAAGACCACGTGGGTGGATGTGGTGAATCGGCGCCTGGTAGTGGAGAAGTGCGGTTCAACAC  592

Query  593  CCTCCGACACCAGCTCAGAAGATGGTGTCCGGCGCATCGTCCACCTATACACAACCTCCGACGACTTCTGCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTCCGACACCAGCTCAGAAGATGGTGTCCGGCGCATCGTCCACCTATACACAACCTCCGACGACTTCTGCCTG  666

Query  667  GGCTTCAACATCCGTGGGGGCAAGGAGTTTGGCCTGGGCATCTATGTGTCCAAAGTGGACCATGGTGGGCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTTCAACATCCGTGGGGGCAAGGAGTTTGGCCTGGGCATCTATGTGTCCAAAGTGGACCATGGTGGGCTGGC  740

Query  741  CGAGGAGAATGGCATCAAGGTGGGGGACCAGGTCCTGGCAGCCAACGGTGTCAGGTTTGACGACATCAGCCACA  814
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Sbjct  741  CGAGGAGAATGGCATCAAGGTGGGGGACCAGGTCCTGGCAGCCAACGGTGTCAGGTTTGACGACATCAGCCACA  814

Query  815  GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGCCAAACGCACATCATGCTGACCATCAAGGAGACCGGCCGGTATCCTGCC  888
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Sbjct  815  GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGCCAAACGCACATCATGCTGACCATCAAGGAGACCGGCCGGTATCCTGCC  888

Query  889  TACAAGGAGATGGTTTCTGAGTACTGCTGGCTGGACCGACTGAGCAACGGGGTGCTGCAGCAGCTGTCCCCGGC  962
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Sbjct  889  TACAAGGAGATGGTTTCTGAGTACTGCTGGCTGGACCGACTGAGCAACGGGGTGCTGCAGCAGCTGTCCCCGGC  962

Query  963  CTCTGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCTTCGTGCGCCTCCAGCGCCCCCTACAGCTCGGGCTCCCTGCCGTCGGACC  1036
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Sbjct  963  CTCTGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCTTCGTGCGCCTCCAGCGCCCCCTACAGCTCGGGCTCCCTGCCGTCGGACC  1036

Query 1037  GCATGGACATCTGCCTCGGGCAGGAGGAGCCCGGCAGCCGCGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCGGACACAGCCATG  1110
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Sbjct 1037  GCATGGACATCTGCCTCGGGCAGGAGGAGCCCGGCAGCCGCGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCGGACACAGCCATG  1110

Query 1111  CAGACGGAGCCCGATGCGGGAGGCCGGGTGGAGACCTGGTGCAGCGTGCGGCCCACAGTCATCCTCAGGGACAC  1184
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Sbjct 1111  CAGACGGAGCCCGATGCGGGAGGCCGGGTGGAGACCTGGTGCAGCGTGCGGCCCACAGTCATCCTCAGGGACAC  1184

Query 1185  CGCCATCCGCTCGGACGGCCCCCATCCCGGCCGCCGCCTTGACTCTGCGCTCTCTGAGTCTCCCAAGACGGCTT  1258
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Sbjct 1185  CGCCATCCGCTCGGACGGCCCCCATCCCGGCCGCCGCCTTGACTCTGCGCTCTCTGAGTCTCCCAAGACGGCTT  1258

Query 1259  TGCTGCTGGCCCTCAGCCGACCCCGGCCCCCCATCACGCGCTCCCAGAGCTATCTGACCTTGTGG---------  1323
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1259  TGCTGCTGGCCCTCAGCCGACCCCGGCCCCCCATCACGCGCTCCCAGAGCTATCTGACCTTGTGGGCTCCCCCG  1332

Query 1324  -------------------GAGGAGAAGCAGCAGCG---GAAGGAGAAGTCGGGGTCCCCTGGGGAGAAGGGTG  1375
                               |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGCTCCCTCGTGTCTGCAGAGGAGAAGCAGCAGCGGAAGAAGGAGAAGTCGGGGTCCCCTGGGGAGAAGGGTG  1406

Query 1376  CCCTGCAGCGCTCCAAGACGCTGATGAACCTCTTCTTCAAGGGAGGGCGGCAGGGGAGGCTAGCGCGGGACGGG  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCTGCAGCGCTCCAAGACGCTGATGAACCTCTTCTTCAAGGGAGGGCGGCAGGGGAGGCTAGCGCGGGACGGG  1480

Query 1450  CGCAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCGGGAGCCTGGCCAAAACTTACCCTCGCCTGGACATAGAGAAAGAGAT  1523
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Sbjct 1481  CGCAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCGGGAGCCTGGCCAAAACTTACCCTCGCCTGGACATAGAGAAAGAGAT  1554

Query 1524  GGGGGCAACA-----------------------------------------------------  1533
            |||||...||                                                     
Sbjct 1555  GGGGGTTTCACCCTGTTGCCCAGGCTAGTCTCAAATTCCTGGACTGAAGCTATCTACCCGCCT  1617