Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479509
• Subject: XM_011540183.3
• Aligned Length: 1602
• Identities: 1529
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGGCGCAGGGTTTCGCAGTGGGCTTCGACCCACTGGGCCTAGGAGACCTGAGCTCCGGCTCTCTGAGCTCCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCAGGGTTTCGCAGTGGGCTTCGACCCACTGGGCCTAGGAGACCTGAGCTCCGGCTCTCTGAGCTCCCT  74

Query   75  CTCCTCCCGAGGCCACCTAGGCAGCGACTCAGGCTCCACCGCAACGCGATACCTGCTAAGGAAGCAACAACGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCTCCCGAGGCCACCTAGGCAGCGACTCAGGCTCCACCGCAACGCGATACCTGCTAAGGAAGCAACAACGGC  148

Query  149  TGCTGAACGGGCCCCCCCGCGGAATCCGAGCCTCATCGCCCATGGGACGCGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGAACGGGCCCCCCCGCGGAATCCGAGCCTCATCGCCCATGGGACGCGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC  222

Query  223  GAAGCCAACAGTGATGAAAGTGACATCATCCATTCAGTCCGGGTGGAGAAGAGTCCAGCAGGGAGGCTGGGCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGCCAACAGTGATGAAAGTGACATCATCCATTCAGTCCGGGTGGAGAAGAGTCCAGCAGGGAGGCTGGGCTT  296

Query  297  CAGCGTGCGCGGGGGCTCAGAGCATGGCCTGGGCATCTTCGTCAGCAAAGTGGAGGAAGGCAGCAGTGCAGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCGTGCGCGGGGGCTCAGAGCATGGCCTGGGCATCTTCGTCAGCAAAGTGGAGGAAGGCAGCAGTGCAGAGC  370

Query  371  GGGCTGGCCTGTGCGTGGGGGACAAGATCACGGAGGTGAATGGGCTGAGCCTGGAGAGCACCACCATGGGTAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGCTGGCCTGTGCGTGGGGGACAAGATCACGGAGGTGAATGGGCTGAGCCTGGAGAGCACCACCATGGGTAGC  444

Query  445  GCCGTAAAGGTGCTGACCAGCAGCAGCCGCCTGCACATGATGGTTCGGCGCATGGGCCGTGTGCCGGGCATCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGTAAAGGTGCTGACCAGCAGCAGCCGCCTGCACATGATGGTTCGGCGCATGGGCCGTGTGCCGGGCATCAA  518

Query  519  GTTCTCCAAGGAGAAGACCACGTGGGTGGATGTGGTGAATCGGCGCCTGGTAGTGGAGAAGTGCGGTTCAACAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTCTCCAAGGAGAAGACCACGTGGGTGGATGTGGTGAATCGGCGCCTGGTAGTGGAGAAGTGCGGTTCAACAC  592

Query  593  CCTCCGACACCAGCTCAGAAGATGGTGTCCGGCGCATCGTCCACCTATACACAACCTCCGACGACTTCTGCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTCCGACACCAGCTCAGAAGATGGTGTCCGGCGCATCGTCCACCTATACACAACCTCCGACGACTTCTGCCTG  666

Query  667  GGCTTCAACATCCGTGGGGGCAAGGAGTTTGGCCTGGGCATCTATGTGTCCAAAGTGGACCATGGTGGGCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTTCAACATCCGTGGGGGCAAGGAGTTTGGCCTGGGCATCTATGTGTCCAAAGTGGACCATGGTGGGCTGGC  740

Query  741  CGAGGAGAATGGCATCAAGGTGGGGGACCAGGTCCTGGCAGCCAACGGTGTCAGGTTTGACGACATCAGCCACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGAGGAGAATGGCATCAAGGTGGGGGACCAGGTCCTGGCAGCCAACGGTGTCAGGTTTGACGACATCAGCCACA  814

Query  815  GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGCCAAACGCACATCATGCTGACCATCAAGGAGACCGGCCGGTATCCTGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGCCAAACGCACATCATGCTGACCATCAAGGAGACCGGCCGGTATCCTGCC  888

Query  889  TACAAGGAGATGGTTTCTGAGTACTGCTGGCTGGACCGACTGAGCAACGGGGTGCTGCAGCAGCTGTCCCCGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACAAGGAGATGGTTTCTGAGTACTGCTGGCTGGACCGACTGAGCAACGGGGTGCTGCAGCAGCTGTCCCCGGC  962

Query  963  CTCTGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCTTCGTGCGCCTCCAGCGCCCCCTACAGCTCGGGCTCCCTGCCGTCGGACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCTGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCTTCGTGCGCCTCCAGCGCCCCCTACAGCTCGGGCTCCCTGCCGTCGGACC  1036

Query 1037  GCATGGACATCTGCCTCGGGCAGGAGGAGCCCGGCAGCCGCGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCGGACACAGCCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCATGGACATCTGCCTCGGGCAGGAGGAGCCCGGCAGCCGCGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCGGACACAGCCATG  1110

Query 1111  CAGACGGAGCCCGATGCGGGAGGCCGGGTGGAGACCTGGTGCAGCGTGCGGCCCACAGTCATCCTCAGGGACAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGACGGAGCCCGATGCGGGAGGCCGGGTGGAGACCTGGTGCAGCGTGCGGCCCACAGTCATCCTCAGGGACAC  1184

Query 1185  CGCCATCCGCTCGGACGGCCCCCATCCCGGCCGCCGCCTTGACTCTGCGCTCTCTGAGTCTCCCAAGACGGCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGCCATCCGCTCGGACGGCCCCCATCCCGGCCGCCGCCTTGACTCTGCGCTCTCTGAGTCTCCCAAGACGGCTT  1258

Query 1259  TGCTGCTGGCCCTCAGCCGACCCCGGCCCCCCATCACGCGCTCCCAGAGCTATCTGACCTTGTGG---------  1323
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1259  TGCTGCTGGCCCTCAGCCGACCCCGGCCCCCCATCACGCGCTCCCAGAGCTATCTGACCTTGTGGGCTCCCCCG  1332

Query 1324  -------------------GAGGAGAAGCAGCAGCG---GAAGGAGAAGTCGGGGTCCCCTGGGGAGAAGGGTG  1375
                               |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGCTCCCTCGTGTCTGCAGAGGAGAAGCAGCAGCGGAAGAAGGAGAAGTCGGGGTCCCCTGGGGAGAAGGGTG  1406

Query 1376  CCCTGCAGCGCTCCAAGACGCTGATGAACCTCTTCTTCAAGGGAGGGCGGCAGGGGAGGCTAGCGCGGGACGGG  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCTGCAGCGCTCCAAGACGCTGATGAACCTCTTCTTCAAGGGAGGGCGGCAGGGGAGGCTAGCGCGGGACGGG  1480

Query 1450  CGCAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCGGGAGCCTGGCCAAAACTTACCCTCGCCTGGACATAGAGAAAG-AGA  1522
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  
Sbjct 1481  CGCAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCGGGAGCCTGGCCAAAACTTACCCTCGCCTGGACATAGAGAAAGCA--  1552

Query 1523  TGGGGGC----------AACA---------------------------  1533
             ||||||          .|||                           
Sbjct 1553  -GGGGGCGTGGGCCCGGTACAGAAGTTTGTCACCTGGAGACTGAGACG  1599