Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479509
• Subject: XM_017318034.1
• Aligned Length: 1534
• Identities: 1230
• Gaps: 107

Alignment

Query    1  ATGGCGCAGGGTTTCGCAGTGGGCTTCGACCCACTGGGCCTAGGAGACCTGAGCTCCGGCTCTCTGAGCTCCCT  74
            |||||.|..||||||.|.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||..|
Sbjct    1  ATGGCACGTGGTTTCACGGTAGGCTTTGACCCACTGGGTCTAGGAGAACTCAGCTCTGGCTCCCTGAGCTCTGT  74

Query   75  CTCCTCCCGAGGCCACCTAGGCAGCGACTCAGGCTCCACCGCAACGCGATACCTGCTAAGGAAGCAACAACGGC  148
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct   75  CTCCTCCCGAGGCCACCTGGGCAGCGACTCAGGCTCCACAGCAACACGATACCTGCTGAGGAAGCAGCAGCGCC  148

Query  149  TGCTGAACGGGCCCCCCCGCGGAATCCGAGCCTCATCGCCCATGGGACGCGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC  222
            |||||||.||||||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGAATGGGCCCTCCCGAGGAATTCGAGCCTCCTCGCCCATGGGCCGGGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC  222

Query  223  GAAGCCAACAGTGATGAAAGTGACATCATCCATTCAGTCCGGGTGGAGAAGAGTCCAGCAGGGAGGCTGGGCTT  296
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||.||.|||||||||||.||..|.|||||||||||.||
Sbjct  223  GAAGCCAACAGTGACGAAAGTGACATCATCCACGCCGTTCGCGTGGAGAAGAGCCCCTCGGGGAGGCTGGGTTT  296

Query  297  CAGCGTGCGCGGGGGCTCAGAGCATGGCCTGGGCATCTTCGTCAGCAAAGTGGAGGAAGGCAGCAGTGCAGAGC  370
            |||||||.|.||.|||||.|||||||||.||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  297  CAGCGTGAGAGGCGGCTCTGAGCATGGCTTGGGTATCTTTGTCAGCAAGGTGGAGGAGGGAAGCAGCGCAGAGC  370

Query  371  GGGCTGGCCTGTGCGTGGGGGACAAGATCACGGAGGTGAATGGGCTGAGCCTGGAGAGCACCACCATGGGTAGC  444
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  371  GGGCTGGCCTGTGTGTGGGAGACAAGATCACGGAGGTGAACGGGCTGAGCCTAGAGAGCACCACAATGGGGAGC  444

Query  445  GCCGTAAAGGTGCTGACCAGCAGCAGCCGCCTGCACATGATGGTTCGGCGCATGGGCCGTGTGCCGGGCATCAA  518
            ||.||.|.|.||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  GCTGTGAGGCTGCTGACCAGTAGCAGCTGCCTACACATGATGGTCCGGCGCATGGGCCGAGTGCCCGGCATCAA  518

Query  519  GTTCTCCAAGGAGAAGACCACGTGGGTGGATGTGGTGAATCGGCGCCTGGTAGTGGAGAAGTGCGGTTCAACAC  592
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.|||||.||.|||||||||.|||||||.|
Sbjct  519  GTTCTCCAAGGAGAAGACCACATGGGTGGATGTAGTGAACCGGAGGCTGGTGGTAGAGAAGTGCAGTTCAACGC  592

Query  593  CCTCCGACACCAGCTCAGAAGATGGTGTCCGGCGCATCGTCCACCTATACACAACCTCCGACGACTTCTGCCTG  666
            |.||.|||..||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  593  CGTCGGACCGCAGCTCGGAAGACGGTGTGCGCCGCATCGTCCATCTCTATACAACCTCGGATGACTTCTGCCTA  666

Query  667  GGCTTCAACATCCGTGGGGGCAAGGAGTTTGGCCTGGGCATCTATGTGTCCAAAGTGGACCATGGTGGGCTGGC  740
            ||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GGCTTCAACATCAGAGGGGGCAAAGAGTTTGGCCTGGGCATCTACGTGTCCAAAGTGGACCATGGGGGGCTGGC  740

Query  741  CGAGGAGAATGGCATCAAGGTGGGGGACCAGGTCCTGGCAGCCAACGGTGTCAGGTTTGACGACATCAGCCACA  814
            .||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  741  TGAAGAGAACGGCATCAAAGTGGGGGACCAGGTCCTGGCGGCCAACGGTGTCAGGTTCGATGACATCAGCCACA  814

Query  815  GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGCCAAACGCACATCATGCTGACCATCAAGGAGACCGGCCGGTATCCTGCC  888
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  815  GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGACAAACGCACATCATGTTGACCATCAAGGAGACTGGCCGATACCCTGCC  888

Query  889  TACAAGGAGATGGTTTCTGAGTACTGCTGGCTGGACCGACTGAGCAACGGGGTGCTGCAGCAGCTGTCCCCGGC  962
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  TACAAAGAGATGGTTTCAGAGTACTGCTGGCTGGATAGATTGAGCAATGGGGTACTGCAGCAGCTGTCGCCAGC  962

Query  963  CTCTGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCTTCGTGCGCCTCCAGCGCCCCCTACAGCTCGGGCTCCCTGCCGTCGGACC  1036
            |||.||||||||||||||||||||.||.|..|||||.||||||||||.||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  963  CTCCGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCCTCCTATGCCTCTAGCGCCCCCTGCAGCTCGGGCTCGCTGCCCTCTGACC  1036

Query 1037  GCATGGACATCTGCCTCGGGCAGGAGGAGCCCGGCAGCCGCGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCGGACACAGCCATG  1110
            |||||||..||||.||.||||..|||||||||...||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1037  GCATGGATGTCTGTCTGGGGCCAGAGGAGCCCACTAGCCATGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCAGACACGGCCATG  1110

Query 1111  CAGACGGAGCCCGATGCGGGA-GGCCGGGTGGAGACCTGGTGCAGCGTGCGGCCCACAGTCATCCTCAGGGACA  1183
            |||||.|||||.|| .|.||| .||||.|||||.||.|||||||||||..||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGACTGAGCCTGA-CCTGGACAGCCGAGTGGAAACTTGGTGCAGCGTAAGGCCGACCGTCATCCTCAGGGACA  1183

Query 1184  CCGCCATCCGCTCGGACGGCCCCCATCCCGGCCGCCGCCTTGACTCTGCGCTCTCTGAGTCTCCCAAGACGGCT  1257
            |.||||||||||||||.||.|||..|.|...|||.|.||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1184  CGGCCATCCGCTCGGATGGTCCCTCTTCTACCCGACACCTTGATTCTGCACTTTCAGAGTCCCCCAAGACTGCT  1257

Query 1258  TTGCTGCTGGCCCTCAGCCGACCCCGGCCCCCCATCACGCGCTCCCAGAGCTATCTGACCTTGTGGGAGGAGAA  1331
            .|.||.||||||||||||||||||.|..|.||||||||.||.|||||||||.|.|||||..|||||        
Sbjct 1258  CTCCTTCTGGCCCTCAGCCGACCCAGAACTCCCATCACTCGATCCCAGAGCCACCTGACACTGTGG--------  1323

Query 1332  GCAGCAGCGGAAGGAGAAGTCGGGGTCCCCTGGGGAGAAGGGTGCCCTGCAGCGCTCCAAGACGCTGATGAACC  1405
                                                                                      
Sbjct 1324  --------------------------------------------------------------------------  1323

Query 1406  TCTTCTTCAAGGGAGGGCGGCAGGGGAGGCTAGCGCGGGACGGGCGCAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCGGG  1479
                      ||||||||||||||||.|||.|||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1324  ----------GGGAGGGCGGCAGGGGCGGCCAGCAGGGGACGGGCACAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCAGA  1387

Query 1480  AGCCTGGCCAAAACTTACCCTCGCCTGGACATAGAGAAAGAGATGGGGGCAACA  1533
            ||||...|||||.....|||||||||||||.|||||||||.             
Sbjct 1388  AGCCCCACCAAAGTCCGCCCTCGCCTGGACCTAGAGAAAGG-------------  1428