Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479523
• Subject: NM_001323621.1
• Aligned Length: 2832
• Identities: 2786
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGACTGTGAGTGGTCCAGGGACCCCCGAGCCCCGGCCGGCCACCCCCGGGGCCAGCTCAGTGGAGCAGCTGCG  74
            ||||||                                             |||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACT---------------------------------------------GCCAGCTCAGTGGAGCAGCTGCG  29

Query   75  GAAGGAGGGCAATGAGCTGTTCAAATGTGGAGACTACGGGGGCGCCCTGGCGGCCTACACTCAGGCCCTGGGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   30  GAAGGAGGGCAATGAGCTGTTCAAATGTGGAGACTACGGGGGCGCCCTGGCGGCCTACACTCAGGCCCTGGGTC  103

Query  149  TGGACGCGACGCCCCAGGACCAGGCCGTTCTGCACCGGAACCGGGCCGCCTGCCACCTCAAGCTGGAAGATTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  104  TGGACGCGACGCCCCAGGACCAGGCCGTTCTGCACCGGAACCGGGCCGCCTGCCACCTCAAGCTGGAAGATTAC  177

Query  223  GACAAAGCAGAAACAGAGGCATCCAAAGCCATTGAAAAGGATGGTGGGGATGTCAAAGCACTCTACCGGCGGAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  178  GACAAAGCAGAAACAGAGGCATCCAAAGCCATTGAAAAGGATGGTGGGGATGTCAAAGCACTCTACCGGCGGAG  251

Query  297  CCAAGCCCTAGAGAAGCTGGGCCGCCTGGACCAGGCTGTCCTTGACCTGCAGAGATGTGTGAGCTTGGAGCCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  252  CCAAGCCCTAGAGAAGCTGGGCCGCCTGGACCAGGCTGTCCTTGACCTGCAGAGATGTGTGAGCTTGGAGCCCA  325

Query  371  AGAACAAAGTTTTCCAGGAGGCCTTGCGGAACATCGGGGGCCAGATTCAGGAGAAGGTGCGATACATGTCCTCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  326  AGAACAAAGTTTTCCAGGAGGCCTTGCGGAACATCGGGGGCCAGATTCAGGAGAAGGTGCGATACATGTCCTCG  399

Query  445  ACGGATGCCAAAGTGGAACAGATGTTTCAGATACTGTTGGACCCAGAAGAGAAGGGCACTGAGAAAAAGCAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  400  ACGGATGCCAAAGTGGAACAGATGTTTCAGATACTGTTGGACCCAGAAGAGAAGGGCACTGAGAAAAAGCAAAA  473

Query  519  GGCTTCTCAGAACCTGGTGGTGCTGGCCAGGGAGGATGCTGGAGCGGAGAAGATCTTCCGGAGTAATGGGGTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  GGCTTCTCAGAACCTGGTGGTGCTGGCCAGGGAGGATGCTGGAGCGGAGAAGATCTTCCGGAGTAATGGGGTTC  547

Query  593  AGCTCTTGCAACGTTTACTCGACATGGGAGAGACTGACCTCATGCTGGCGGCTCTGCGTACGCTGGTTGGCATT  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  AGCTCTTGCAACGTTTACTGGACATGGGAGAGACTGACCTCATGCTGGCGGCTCTGCGTACGCTGGTTGGCATT  621

Query  667  TGCTCTGAGCATCAGTCACGGACAGTGGCAACCCTGAGCATACTGGGAACTCGGCGAGTAGTCTCCATCCTGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  TGCTCTGAGCATCAGTCACGGACAGTGGCAACCCTGAGCATACTGGGAACTCGGCGAGTAGTCTCCATCCTGGG  695

Query  741  CGTGGAAAGCCAGGCTGTGTCCCTGGCTGCCTGCCACCTGCTGCAGGTTATGTTTGATGCCCTCAAGGAAGGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  CGTGGAAAGCCAGGCTGTGTCCCTGGCTGCCTGCCACCTGCTGCAGGTTATGTTTGATGCCCTCAAGGAAGGTG  769

Query  815  TCAAAAAAGGCTTCCGAGGCAAAGAAGGTGCCATCATTGTGGATCCTGCCCGGGAGCTGAAGGTCCTCATCAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  TCAAAAAAGGCTTCCGAGGCAAAGAAGGTGCCATCATTGTGGATCCTGCCCGGGAGCTGAAGGTCCTCATCAGT  843

Query  889  AACCTCTTAGATCTGCTGACAGAGGTGGGGGTCTCTGGCCAAGGCCGAGACAATGCCCTGACCCTCCTGATTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  844  AACCTCTTAGATCTGCTGACAGAGGTGGGGGTCTCTGGCCAAGGCCGAGACAATGCCCTGACCCTCCTGATTAA  917

Query  963  AGCGGTGCCCCGGAAGTCTCTCAAGGACCCCAACAACAGCCTCACCCTCTGGGTCATCGACCAAGGTCTGAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  AGCGGTGCCCCGGAAGTCTCTCAAGGACCCCAACAACAGCCTCACCCTCTGGGTCATCGACCAAGGTCTGAAAA  991

Query 1037  AGATTTTGGAAGTGGGGGGCTCTCTACAGGACCCTCCTGGGGAGCTCGCAGTGACCGCAAACAGCCGCATGAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  992  AGATTTTGGAAGTGGGGGGCTCTCTACAGGACCCTCCTGGGGAGCTCGCAGTGACCGCAAACAGCCGCATGAGC  1065

Query 1111  GCCTCTATTCTCCTCAGCAAGCTCTTTGATGACCTCAAGTGTGATGCGGAGAGGGAGAATTTCCACAGACTTTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066  GCCTCTATTCTCCTCAGCAAGCTCTTTGATGACCTCAAGTGTGATGCGGAGAGGGAGAATTTCCACAGACTTTG  1139

Query 1185  TGAAAACTACATCAAGAGCTGGTTTGAGGGCCAAGGGCTGGCCGGGAAGCTACGGGCCATCCAGACGGTGTCCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140  TGAAAACTACATCAAGAGCTGGTTTGAGGGCCAAGGGCTGGCCGGGAAGCTACGGGCCATCCAGACGGTGTCCT  1213

Query 1259  GCCTCCTGCAGGGCCCATGTGACGCTGGCAACCGGGCCTTGGAGCTGAGCGGTGTCATGGAGAGTGTGATTGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214  GCCTCCTGCAGGGCCCATGTGACGCTGGCAACCGGGCCTTGGAGCTGAGCGGTGTCATGGAGAGTGTGATTGCT  1287

Query 1333  CTGTGTGCCTCTGAGCAGGAGGAGGAGCAGCTGGTGGCCGTGGAGGCTCTGATCCATGCAGCCGGCAAGGCTAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288  CTGTGTGCCTCTGAGCAGGAGGAGGAGCAGCTGGTGGCCGTGGAGGCTCTGATCCATGCAGCCGGCAAGGCTAA  1361

Query 1407  GCGGGCCTCATTCATCACTGCCAATGGTGTCTCGCTGCTGAAGGACCTATATAAGTGCAGCGAGAAGGACAGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362  GCGGGCCTCATTCATCACTGCCAATGGTGTCTCGCTGCTGAAGGACCTATATAAGTGCAGCGAGAAGGACAGCA  1435

Query 1481  TCCGCATCCGGGCGCTAGTGGGACTCTGTAAGCTCGGTTCGGCTGGAGGGACTGACTTCAGCATGAAGCAGTTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436  TCCGCATCCGGGCGCTAGTGGGACTCTGTAAGCTCGGTTCGGCTGGAGGGACTGACTTCAGCATGAAGCAGTTT  1509

Query 1555  GCTGAAGGCTCCACTCTCAAACTGGCTAAGCAGTGTCGAAAGTGGCTGTGCAATGACCAGATCGACGCAGGCAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510  GCTGAAGGCTCCACTCTCAAACTGGCTAAGCAGTGTCGAAAGTGGCTGTGCAATGACCAGATCGACGCAGGCAC  1583

Query 1629  TCGGCGCTGGGCAGTGGAGGGCCTGGCTTACCTGACCTTTGATGCCGACGTGAAGGAAGAGTTTGTGGAGGATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584  TCGGCGCTGGGCAGTGGAGGGCCTGGCTTACCTGACCTTTGATGCCGACGTGAAGGAAGAGTTTGTGGAGGATG  1657

Query 1703  CGGCTGCTCTGAAAGCTCTGTTCCAGCTCAGCAGGTTGGAGGAGAGGTCAGTGCTCTTTGCGGTGGCCTCAGCG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1658  CGGCTGCTCTGAAAGCTCTGTTCCAGCTCAGCAGGTTGGAGGAGAGGTCAGTGCTCTTTGCGGTGGCCTCAGCG  1731

Query 1777  CTGGTGAACTGCACCAACAGCTATGACTACGAGGAGCCCGACCCCAAGATGGTGGAGCTGGCCAAGTATGCCAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1732  CTGGTGAACTGCACCAACAGCTATGACTACGAGGAGCCCGACCCCAAGATGGTGGAGCTGGCCAAGTATGCCAA  1805

Query 1851  GCAGCATGTGCCCGAGCAGCACCCCAAGGACAAGCCAAGCTTCGTGCGGGCTCGGGTGAAGAAGCTGCTGGCAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1806  GCAGCATGTGCCCGAGCAGCACCCCAAGGACAAGCCAAGCTTCGTGCGGGCTCGGGTGAAGAAGCTGCTGGCAG  1879

Query 1925  CGGGTGTGGTGTCGGCCATGGTGTGCATGGTGAAGACGGAGAGCCCTGTGCTGACCAGTTCCTGCAGAGAGCTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1880  CGGGTGTGGTGTCGGCCATGGTGTGCATGGTGAAGACGGAGAGCCCTGTGCTGACCAGTTCCTGCAGAGAGCTG  1953

Query 1999  CTCTCCAGGGTCTTCTTGGCTTTAGTGGAAGAGGTAGAGGACCGAGGCACTGTGGTTGCCCAGGGAGGCGGCAG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1954  CTCTCCAGGGTCTTCTTGGCTTTAGTGGAAGAGGTAGAGGACCGAGGCACTGTGGTTGCCCAGGGAGGCGGCAG  2027

Query 2073  GGCGCTGATCCCGCTGGCCCTGGAAGGCACGGACGTGGGGCAGACAAAGGCAGCCCAGGCCCTTGCCAAGCTCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028  GGCGCTGATCCCGCTGGCCCTGGAAGGCACGGACGTGGGGCAGACAAAGGCAGCCCAGGCCCTTGCCAAGCTCA  2101

Query 2147  CCATCACCTCCAACCCGGAGATGACCTTCCCTGGCGAGCGGATCTATGAGGTGGTCCGGCCCCTCGTCTCCCTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2102  CCATCACCTCCAACCCGGAGATGACCTTCCCTGGCGAGCGGATCTATGAGGTGGTCCGGCCCCTCGTCTCCCTG  2175

Query 2221  TTGCACCTCAACTGCTCAGGCCTGCAGAACTTCGAGGCGCTCATGGCCCTAACAAACCTGGCTGGGATCAGCGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2176  TTGCACCTCAACTGCTCAGGCCTGCAGAACTTCGAGGCGCTCATGGCCCTAACAAACCTGGCTGGGATCAGCGA  2249

Query 2295  GAGGCTCCGGCAGAAGATCCTGAAGGAGAAGGCTGTGCCCATGATAGAAGGCTACATGTTTGAGGAGCATGAGA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250  GAGGCTCCGGCAGAAGATCCTGAAGGAGAAGGCTGTGCCCATGATAGAAGGCTACATGTTTGAGGAGCATGAGA  2323

Query 2369  TGATCCGCCGGGCAGCCACGGAGTGCATGTGTAACTTGGCCATGAGCAAGGAGGTGCAGGACCTCTTCGAAGCC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324  TGATCCGCCGGGCAGCCACGGAGTGCATGTGTAACTTGGCCATGAGCAAGGAGGTGCAGGACCTCTTCGAAGCC  2397

Query 2443  CAGGGCAATGACCGACTGAAGCTGCTGGTGCTGTACAGTGGAGAGGATGATGAGCTGCTACAGCGGGCAGCTGC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398  CAGGGCAATGACCGACTGAAGCTGCTGGTGCTGTACAGTGGAGAGGATGATGAGCTGCTACAGCGGGCAGCTGC  2471

Query 2517  CGGGGGCTTGGCCATGCTTACCTCCATGCGGCCCACGCTCTGCAGCCGCATTCCCCAAGTGACCACACACTGGC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2472  CGGGGGCTTGGCCATGCTTACCTCCATGCGGCCCACGCTCTGCAGCCGCATTCCCCAAGTGACCACACACTGGC  2545

Query 2591  TGGAGATCCTGCAGGCCCTGCTTCTGAGCTCCAACCAGGAGCTGCAGCACCGGGGTGCTGTGGTGGTGCTGAAC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2546  TGGAGATCCTGCAGGCCCTGCTTCTGAGCTCCAACCAGGAGCTGCAGCACCGGGGTGCTGTGGTGGTGCTGAAC  2619

Query 2665  ATGGTGGAGGCCTCGAGGGAGATTGCCAGCACCCTGATGGAGAGTGAGATGATGGAGATCTTGTCAGTGCTAGC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2620  ATGGTGGAGGCCTCGAGGGAGATTGCCAGCACCCTGATGGAGAGTGAGATGATGGAGATCTTGTCAGTGCTAGC  2693

Query 2739  TAAGGGTGACCACAGCCCTGTCACAAGGGCTGCTGCAGCCTGCCTGGACAAAGCAGTGGAATATGGGCTTATCC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694  TAAGGGTGACCACAGCCCTGTCACAAGGGCTGCTGCAGCCTGCCTGGACAAAGCAGTGGAATATGGGCTTATCC  2767

Query 2813  AACCCAACCAAGATGGAGAG  2832
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 2768  AACCCAACCAAGATGGAGAG  2787